基因页面:NOVA2
总结吗?
GeneID | 4858年 |
象征 | NOVA2 |
同义词 | 方差分析| NOVA3 |
描述 | neuro-oncological腹抗原2 |
参考 | MIM: 601991|HGNC: HGNC: 7887|运用:ENSG00000104967|HPRD: 03588|织女:OTTHUMG00000177499 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 19 q13.3 |
帕斯卡假定值 | 0.034 |
夏洛克假定值 | 0.002 |
胎儿β | 0.19 |
DMG | 1(#研究) |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg21632975 | 19 | 46456210 | NOVA2 | 6.015的军医 | 0.275 | 0.05 | DMG: Wockner_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/NOVA2_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
LMO4 | 0.77 | 0.78 |
MIPEP | 0.77 | 0.72 |
NPY1R | 0.76 | 0.86 |
AADAT | 0.76 | 0.69 |
EXOC6 | 0.74 | 0.79 |
ANKMY2 | 0.74 | 0.76 |
GRM7 | 0.73 | 0.73 |
PLK2 | 0.73 | 0.77 |
STK32B | 0.72 | 0.70 |
RUNDC3B | 0.72 | 0.77 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.56 | -0.65 |
AIFM3 | -0.56 | -0.62 |
AF347015.33 | -0.55 | -0.63 |
AF347015.31 | -0.54 | -0.63 |
MT-CYB | -0.54 | -0.63 |
HSD17B14 | -0.54 | -0.64 |
AF347015.8 | -0.53 | -0.65 |
AF347015.2 | -0.53 | -0.64 |
AF347015.27 | -0.53 | -0.61 |
AF347015.15 | -0.53 | -0.63 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
MULLIGHAN MLL签名1 DN | 242年 | 165年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH ES与H3K27ME3 | 1118年 | 744年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
谢泼德BMYB吗啉代DN | 200年 | 112年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
谢泼德BMYB目标 | 74年 | 41 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
谢泼德粉碎和燃烧突变DN | 185年 | 111年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KYNG WERNER通气和正常老化 | 93年 | 62年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |