基因页：NPAS1
概括？
| 基因 | 4861 |
| 象征 | NPAS1 |
| 同义词 | mop5 | pasd5 | bhlhe11 |
| 描述 | 神经元PAS结构蛋白1 |
| 参考 | MIM：603346|HGNC：HGNC：7894|Ensembl：ENSG00000130751|HPRD：09136|Vega：Otthumg00000183440 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 19q13.32 |
| Pascal P值 | 0.23 |
| Sherlock P值 | 0.244 |
| 胎儿β | -0.312 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS4698764 | CHR4 | 111146783 | NPAS1 | 4861 | 0.04 | 反式 | ||
| RS17542473 | CHR4 | 111182451 | NPAS1 | 4861 | 0.03 | 反式 | ||
| RS10054300 | CHR5 | 51847657 | NPAS1 | 4861 | 0.07 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| NTNG1 | 0.72 | 0.48 |
| BTBD11 | 0.70 | 0.63 |
| FAM19A4 | 0.70 | 0.69 |
| TPH2 | 0.70 | 0.56 |
| CPNE9 | 0.69 | 0.69 |
| AC010087.3 | 0.69 | 0.64 |
| PTPN3 | 0.69 | 0.42 |
| SYT9 | 0.69 | 0.36 |
| DOK7 | 0.68 | 0.58 |
| NECAB2 | 0.68 | 0.67 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ISLR2 | -0.47 | -0.54 |
| PPAPDC1B | -0.47 | -0.56 |
| plekho1 | -0.47 | -0.57 |
| ZNF300 | -0.46 | -0.50 |
| foxg1b | -0.45 | -0.58 |
| CCNG2 | -0.45 | -0.53 |
| SF3A2 | -0.45 | -0.54 |
| ZNF551 | -0.45 | -0.54 |
| mycn | -0.45 | -0.50 |
| AC004017.1 | -0.44 | -0.53 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0004871 | 信号传感器活性 | IEA | - | |
| 去：0003700 | 转录因子活性 | 塔斯 | 9012850 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007417 | 中枢神经系统发展 | 塔斯 | 大脑（GO期限：6） | 9012850 |
| GO：0000122 | RNA聚合酶II启动子的转录负调控 | IEA | - | |
| 去：0006355 | 调节转录，DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
| 去：0007165 | 信号转导 | IEA | - | |
| 去：0007610 | 行为 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005634 | 核 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 巴索CD40信号传导DN | 68 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bandres对Carmustin Mgmt 48hr DN的响应 | 161 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 | 419 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 | 269 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP | 349 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 | 341 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Alfano MYC目标 | 239 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |