基因页：NPHP1
概括？
| 基因 | 4867 |
| 象征 | NPHP1 |
| 同义词 | jbts4 | nph1 | slsn1 |
| 描述 | 肾植物1（少年） |
| 参考 | MIM：607100|HGNC：HGNC：7905|ENSEMBL：ENSG00000144061|HPRD：02019|HPRD：09524|Vega：Otthumg00000131195 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 2Q13 |
| Pascal P值 | 0.013 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.0004 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.00755 | |
| 表达 | 基因表达的荟萃分析 | p价值：2.538 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| 拉斯 | 0.92 | 0.91 |
| GTPBP4 | 0.92 | 0.92 |
| GGNBP2 | 0.91 | 0.91 |
| immt | 0.91 | 0.90 |
| PLAA | 0.91 | 0.90 |
| CUL2 | 0.91 | 0.88 |
| Cul3 | 0.91 | 0.90 |
| GPBP1 | 0.91 | 0.91 |
| strbp | 0.91 | 0.91 |
| VPS45 | 0.91 | 0.91 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MT-CO2 | -0.81 | -0.81 |
| AF347015.31 | -0.80 | -0.82 |
| AF347015.33 | -0.80 | -0.81 |
| AF347015.8 | -0.80 | -0.81 |
| AF347015.27 | -0.78 | -0.79 |
| FXYD1 | -0.77 | -0.82 |
| AF347015.2 | -0.77 | -0.79 |
| AF347015.21 | -0.77 | -0.78 |
| mt-cyb | -0.77 | -0.78 |
| AF347015.15 | -0.76 | -0.79 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 12244321 | |
| 去：0005198 | 结构分子活性 | nas | 12006559 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007165 | 信号转导 | nas | 12244321 | |
| 去：0007632 | 视觉行为 | nas | 12205563 | |
| 去：0007588 | 排泄 | 塔斯 | 9361039 | |
| GO：0016337 | 细胞细胞粘附 | nas | 12006559 | |
| 去：0030036 | 肌动蛋白细胞骨架组织 | nas | 12006559 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0016020 | 膜 | nas | 10665934 | |
| GO：0030054 | 细胞连接 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| BCAR1 | cas |cas1 |Cass1 |crkas |P130CAS | 乳腺癌抗雌激素抵抗1 | - | HPRD，Biogrid | 10739664|11493697 |
| flna | ABP-280 |ABPX |DKFZP434P031 |fln |fln1 |FMD |MNS |NHBP |OPD |OPD1 | OPD2 | Filamin A，α（肌动蛋白结合蛋白280） | - | HPRD，Biogrid | 12006559 |
| flnb | ABP-278 |aoi |DKFZP686A1668 |DKFZP686O033 |FH1 |fln1l |LRS1 |sct |TABP |轻敲 | Filamin B，β（肌动蛋白结合蛋白278） | - | HPRD，Biogrid | 12006559 |
| flnc | ABP-280 |ABP280A |ABPA |abpl |FLJ10186 |FLN2 | Filamin C，伽马（肌动蛋白结合蛋白280） | - | HPRD | 12006559 |
| Invs | Inv |KIAA0573 |MGC133080 |MGC133081 |nph2 |NPHP2 | inversin | - | HPRD，Biogrid | 12872123 |
| NPHP1 | FLJ97602 |JBTS4 |nph1 |SLSN1 | 肾植物1（少年） | - | HPRD，Biogrid | 12006559 |
| nphp3 | DKFZP667K242 |DKFZP781K1312 |FLJ30691 |FLJ36696 |KIAA2000 |MGC78666 |nph3 | 肾植物3（青少年） | - | HPRD，Biogrid | 12872122 |
| NPHP4 | KIAA0673 |SLSN4 | 肾植物4 | - | HPRD，Biogrid | 12244321 |
| ptk2b | Cadtk |cakb |fadk2 |fak2 |frnk |PKB |PTK |pyk2 |筏 | PTK2B蛋白酪氨酸激酶2β | - | HPRD，Biogrid | 11493697 |
| TNS1 | DKFZP586K0617 |MGC88584 |MST091 |MST122 |MST127 |MSTP122 |MSTP127 |mxra6 |TNS | Tensin 1 | - | HPRD，Biogrid | 11493697 |
| 塔布 | M40 |MGC117247 |MGC16435 |OK/SW-CL.56 |tubb1 |tubb5 | 微管蛋白，β | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12872123 |
| tubb2a | tubb |tubb2 |DJ40E16.7 | 微管蛋白，β2A | - | HPRD | 12872123 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 中村肿瘤区周围与中央 | 285 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graessmann血清剥夺DN的细胞凋亡 | 234 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shen Smarca2靶向DN | 357 | 212 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chesler Brain QTL顺式 | 75 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI TCF21目标2向上 | 428 | 266 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性2 | 473 | 224 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Matzuk精子 | 114 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |