概括
基因 4893
象征 Nras
同义词 alps4 | cmns | n-ras | ncms | nras1 | ns6
描述 神经母细胞瘤RAS病毒(V-RAS)癌基因同源物
参考 MIM:164790|HGNC:HGNC:7989|ENSEMBL:ENSG00000213281|HPRD:01273|Vega:Otthumg0000000012059
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p13.2
Pascal P值 5.67E-4
Sherlock P值 0.714
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0235
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.00814
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:3

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS7562379 CHR2 76693222 Nras 4893 0.02 反式
RS2324209 CHR3 7710840 Nras 4893 0.1 反式
RS9870241 CHR3 7710921 Nras 4893 0.12 反式
RS3804843 CHR3 7715396 Nras 4893 0.12 反式
RS1523262 CHR3 116670389 Nras 4893 0.02 反式
RS4948088 CHR7 51027193 Nras 4893 0.18 反式
RS4546623 CHR8 98411165 Nras 4893 0.13 反式
RS10976262 Chr9 7356143 Nras 4893 0.1 反式
RS8071763 CHR17 67930673 Nras 4893 7.957E-4 反式
RS4536719 CHR20 24397114 Nras 4893 0.1 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
PNPLA6 0.87 0.85
DCTN1 0.87 0.85
otud5 0.84 0.84
APLP2 0.84 0.83
ABCF3 0.83 0.82
PLD3 0.83 0.82
NACC1 0.83 0.83
rangap1 0.83 0.81
GPI 0.82 0.82
rad23a 0.82 0.82
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.53 -0.28
FAM159B -0.49 -0.51
AL050337.1 -0.46 -0.28
AC087071.1 -0.45 -0.26
C1orf54 -0.44 -0.25
Sycp3 -0.44 -0.31
AC135724.1 -0.43 -0.37
ACSM3 -0.43 -0.33
AC120053.1 -0.43 -0.37
C1orf61 -0.41 -0.24

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0003924 GTPase活性 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
去:0005525 GTP结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0048169 调节长期神经元突触可塑性 IEA 神经元,突触(GO期限:10) -
GO:0032228 调节突触传播,GABA能量 IEA 神经元,GABA,突触,神经递质(GO术语级别:9) -
GO:0043524 神经元细胞凋亡的阴性调节 IEA 神经元(GO期限:9) -
去:0007265 RAS蛋白信号转导 经验 11520933
去:0007265 RAS蛋白信号转导 IEA -
去:0008284 细胞增殖的阳性调节 IEA -
去:0008542 视觉学习 IEA -
去:0007569 细胞衰老 IEA -
去:0006897 内吞作用 IEA -
去:0030036 肌动蛋白细胞骨架组织 IEA -
GO:0035022 RAC蛋白信号转导的正调控 IEA -
GO:0051146 条纹肌肉细胞分化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000139 高尔基膜 IEA -
去:0005794 高尔基体 IEA -
去:0005622 细胞内 IEA -
去:0005624 膜分数 IEA -
去:0005886 质膜 经验 7972015|8493579|9069260
|9690470
去:0005886 质膜 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg mapk信号通路 267 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg erbb信号通路 87 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG趋化因子信号传导途径 190 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG轴突指导 129 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg vegf信号通路 76 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg thright连接点 134 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg间隙交界处 90 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg天然杀伤细胞介导的细胞毒性 137 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg t细胞受体信号通路 108 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG B细胞受体信号通路 75 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg fc epsilon ri信号传导途径 79 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg长期增强 70 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG神经营养蛋白信号传导途径 126 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG长期抑郁症 70 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌动蛋白细胞骨架的KEGG调节 216 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG胰岛素信号通路 137 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg gnRH信号通路 101 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg黑色素发生 102 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
癌症中的KEGG途径 328 259 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG肾细胞癌 70 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG子宫内膜癌 52 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg神经胶质瘤 65 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG前列腺癌 89 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG甲状腺癌 29 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg黑色素瘤 71 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg膀胱癌 42 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG慢性髓细胞性白血病 73 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg急性髓样白血病 60 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG非小细胞肺癌 54 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID GMCSF途径 37 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TCR途径 66 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ER非原始组途径 41 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID EPHB FWD途径 40 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CD8 TCR途径 53 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID SHP2途径 58 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID MTOR 4 Pathway 69 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL2 1 Pathway 55 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ERBB1受体近端途径 35 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TCR RAS途径 14 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PI3KCI途径 49 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ERBB1下游途径 105 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ERBB2 ERBB3途径 44 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PDGFRB途径 129 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TRKR途径 62 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CMYB途径 84 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ERBB1内部化途径 41 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CXCR3途径 43 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID RAS路径 30 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID MAPK TRK途径 34 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PI3K PLC TRK途径 36 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CD8 TCR下游途径 65 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NGF的Reactome信号传导 217 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCF套件的Reactome信号传导 78 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB4的Reactome信号传导 90 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2的Reactome信号传导 101 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
组成性活性EGFR的反应组信号传导 18 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2信号中的Reactome GRB2事件 22 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EGFR在癌症中的反应组信号传导 109 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB4信号中的Reactome SHC1事件 20 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
B细胞受体BCR的Reactome下游信号传导事件 97 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
B细胞受体BCR的反应组信号传导 126 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome胰岛素受体信号传导级联 87 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Arms介导的激活 17 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome长时间ERK激活事件 19 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome对RAS的信号传导 27 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组细胞表面相互作用在血管壁 91 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome NGF信号通过TRKA从质膜发出 137 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
向ERK的Reactome信号传导 36 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome P38MAPK事件 13 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FGFR在疾病中的反应组信号传导 127 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome通过RIT和RIN向p38发出信号 15 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome胃胃CREB信号传导途径通过PKC和MAPK 205 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FGFR突变体的Reactome信号传导 44 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
egfr信号中的Reactome SHC1事件 15 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Tie2信号传导 17 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GPCR的反应组信号传导 920 449 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PDGF的Reactome信号传导 122 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome下游信号转导 95 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Axon指导 251 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome NCAM信号传导,用于神经突的生长 64 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome FRS2介导的级联 36 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome的下游信号传导激活的FGFR 100 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SHC介导的级联 28 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ILS的Reactome信号传导 107 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome IL 2信号传导 41 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胰岛素受体的反应组信号传导 108 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SOS介导的信号传导 14 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组止血 466 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome RAF MAP激酶级联 10 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SHC介导的信号传导 15 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome适应性免疫系统 539 350 该途径中的所有SZGR 2.0基因
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 270 204 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FGFR的Reactome信号传导 112 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SHC相关事件 17 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bidus转移 214 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 633 376 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Castellano Hras和NRAS靶向DN 8 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Castellano NRAS靶向DN 14 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与腔内 326 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与基础 330 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN 514 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM MYCL1扩增靶向DN 20 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
buytaert光动力疗法压力 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向DN 411 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
丁肺癌显着突变 26 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
费尔南德斯(Fernandez)由迈克(Myc)约束 182 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍夫曼细胞淋巴瘤 50 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 314 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MariaDason对丁酸酯Sulindac 4的反应 21 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YIH对砷C1的反应 24 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hillion HMGA1目标 90 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hillion HMGA1B目标 92 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stearman肺癌早期与晚期 125 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
营地结肠癌复制号码 92 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞 425 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西部肾上腺皮质肿瘤 294 199 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bhati G2M被2methoxyestradiol逮捕 125 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Firestein CTNNB1途径 33 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性DN 210 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
格雷希克癌症复制号码 323 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌的生存率差A6 456 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
croonquist nras发出信号 41 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Croonquist NRAS与基质刺激 41 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
丁肺癌反复突变 6 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G3 UP 188 121 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dang myc的目标 143 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
Let-7/98 186 192 M8 HSA-LET-7A ugagguaguaguauauaguu
HSA-LET-7B ugagguaguagguuguguguguu
HSA-LET-7C ugagguaguagguuguaugguu
HSA-LET-7D agagguaguagguugcauagu
HSA-LET-7E ugagguaggagguuauauagu
HSA-LET-7F ugagguagauuguauauaguu
HSA-MIR-98 ugagguaaguuguauuguu
HSA-LET-7GSZ ugagguaguuguuguacagu
HSA-LET-7I ugagguaguugugugugugcugu
mir-124/506 640 646 M8 HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-196 185 191 M8 HSA-MIR-196A uagguaguucauguugugug
HSA-MIR-196B uagguaguucuuguugg
mir-28 116 122 M8 HSA-MIR-28 Aaggagcucacagucuauugag
mir-326 210 216 1a HSA-MIR-326 ccucugggcccuccag
mir-361 966 972 1a HSA-MIR-361 uuaucagaaucuccagggguac
mir-505 418 424 1a HSA-MIR-505 gucaacuugcugguuccuc