基因页:Nras
概括?
基因 | 4893 |
象征 | Nras |
同义词 | alps4 | cmns | n-ras | ncms | nras1 | ns6 |
描述 | 神经母细胞瘤RAS病毒(V-RAS)癌基因同源物 |
参考 | MIM:164790|HGNC:HGNC:7989|ENSEMBL:ENSG00000213281|HPRD:01273|Vega:Otthumg0000000012059 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1p13.2 |
Pascal P值 | 5.67E-4 |
Sherlock P值 | 0.714 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.0235 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.00814 | |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中:3 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS7562379 | CHR2 | 76693222 | Nras | 4893 | 0.02 | 反式 | ||
RS2324209 | CHR3 | 7710840 | Nras | 4893 | 0.1 | 反式 | ||
RS9870241 | CHR3 | 7710921 | Nras | 4893 | 0.12 | 反式 | ||
RS3804843 | CHR3 | 7715396 | Nras | 4893 | 0.12 | 反式 | ||
RS1523262 | CHR3 | 116670389 | Nras | 4893 | 0.02 | 反式 | ||
RS4948088 | CHR7 | 51027193 | Nras | 4893 | 0.18 | 反式 | ||
RS4546623 | CHR8 | 98411165 | Nras | 4893 | 0.13 | 反式 | ||
RS10976262 | Chr9 | 7356143 | Nras | 4893 | 0.1 | 反式 | ||
RS8071763 | CHR17 | 67930673 | Nras | 4893 | 7.957E-4 | 反式 | ||
RS4536719 | CHR20 | 24397114 | Nras | 4893 | 0.1 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/NRAS_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
PNPLA6 | 0.87 | 0.85 |
DCTN1 | 0.87 | 0.85 |
otud5 | 0.84 | 0.84 |
APLP2 | 0.84 | 0.83 |
ABCF3 | 0.83 | 0.82 |
PLD3 | 0.83 | 0.82 |
NACC1 | 0.83 | 0.83 |
rangap1 | 0.83 | 0.81 |
GPI | 0.82 | 0.82 |
rad23a | 0.82 | 0.82 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.53 | -0.28 |
FAM159B | -0.49 | -0.51 |
AL050337.1 | -0.46 | -0.28 |
AC087071.1 | -0.45 | -0.26 |
C1orf54 | -0.44 | -0.25 |
Sycp3 | -0.44 | -0.31 |
AC135724.1 | -0.43 | -0.37 |
ACSM3 | -0.43 | -0.33 |
AC120053.1 | -0.43 | -0.37 |
C1orf61 | -0.41 | -0.24 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0003924 | GTPase活性 | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
去:0005525 | GTP结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0048169 | 调节长期神经元突触可塑性 | IEA | 神经元,突触(GO期限:10) | - |
GO:0032228 | 调节突触传播,GABA能量 | IEA | 神经元,GABA,突触,神经递质(GO术语级别:9) | - |
GO:0043524 | 神经元细胞凋亡的阴性调节 | IEA | 神经元(GO期限:9) | - |
去:0007265 | RAS蛋白信号转导 | 经验 | 11520933 | |
去:0007265 | RAS蛋白信号转导 | IEA | - | |
去:0008284 | 细胞增殖的阳性调节 | IEA | - | |
去:0008542 | 视觉学习 | IEA | - | |
去:0007569 | 细胞衰老 | IEA | - | |
去:0006897 | 内吞作用 | IEA | - | |
去:0030036 | 肌动蛋白细胞骨架组织 | IEA | - | |
GO:0035022 | RAC蛋白信号转导的正调控 | IEA | - | |
GO:0051146 | 条纹肌肉细胞分化 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0000139 | 高尔基膜 | IEA | - | |
去:0005794 | 高尔基体 | IEA | - | |
去:0005622 | 细胞内 | IEA | - | |
去:0005624 | 膜分数 | IEA | - | |
去:0005886 | 质膜 | 经验 | 7972015|8493579|9069260 |9690470 |
|
去:0005886 | 质膜 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg mapk信号通路 | 267 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg erbb信号通路 | 87 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG趋化因子信号传导途径 | 190 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG轴突指导 | 129 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg vegf信号通路 | 76 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg thright连接点 | 134 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg间隙交界处 | 90 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg天然杀伤细胞介导的细胞毒性 | 137 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg t细胞受体信号通路 | 108 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG B细胞受体信号通路 | 75 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg fc epsilon ri信号传导途径 | 79 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg长期增强 | 70 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG神经营养蛋白信号传导途径 | 126 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG长期抑郁症 | 70 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肌动蛋白细胞骨架的KEGG调节 | 216 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG胰岛素信号通路 | 137 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg gnRH信号通路 | 101 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg黑色素发生 | 102 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
癌症中的KEGG途径 | 328 | 259 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG肾细胞癌 | 70 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG子宫内膜癌 | 52 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg神经胶质瘤 | 65 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG前列腺癌 | 89 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG甲状腺癌 | 29 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg黑色素瘤 | 71 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg膀胱癌 | 42 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG慢性髓细胞性白血病 | 73 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg急性髓样白血病 | 60 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG非小细胞肺癌 | 54 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID GMCSF途径 | 37 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID TCR途径 | 66 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID ER非原始组途径 | 41 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID EPHB FWD途径 | 40 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID CD8 TCR途径 | 53 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID SHP2途径 | 58 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID MTOR 4 Pathway | 69 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID IL2 1 Pathway | 55 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID ERBB1受体近端途径 | 35 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID TCR RAS途径 | 14 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID PI3KCI途径 | 49 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID ERBB1下游途径 | 105 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID ERBB2 ERBB3途径 | 44 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID PDGFRB途径 | 129 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID TRKR途径 | 62 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID CMYB途径 | 84 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID ERBB1内部化途径 | 41 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID CXCR3途径 | 43 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID RAS路径 | 30 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID MAPK TRK途径 | 34 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID PI3K PLC TRK途径 | 36 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID CD8 TCR下游途径 | 65 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NGF的Reactome信号传导 | 217 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SCF套件的Reactome信号传导 | 78 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome发育生物学 | 396 | 292 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB4的Reactome信号传导 | 90 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB2的Reactome信号传导 | 101 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
组成性活性EGFR的反应组信号传导 | 18 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB2信号中的Reactome GRB2事件 | 22 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EGFR在癌症中的反应组信号传导 | 109 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB4信号中的Reactome SHC1事件 | 20 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
B细胞受体BCR的Reactome下游信号传导事件 | 97 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
B细胞受体BCR的反应组信号传导 | 126 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome胰岛素受体信号传导级联 | 87 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Arms介导的激活 | 17 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome长时间ERK激活事件 | 19 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome对RAS的信号传导 | 27 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组细胞表面相互作用在血管壁 | 91 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome NGF信号通过TRKA从质膜发出 | 137 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
向ERK的Reactome信号传导 | 36 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome P38MAPK事件 | 13 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FGFR在疾病中的反应组信号传导 | 127 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome通过RIT和RIN向p38发出信号 | 15 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome胃胃CREB信号传导途径通过PKC和MAPK | 205 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FGFR突变体的Reactome信号传导 | 44 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
egfr信号中的Reactome SHC1事件 | 15 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Tie2信号传导 | 17 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PDGF的Reactome信号传导 | 122 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome下游信号转导 | 95 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Axon指导 | 251 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome NCAM信号传导,用于神经突的生长 | 64 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome FRS2介导的级联 | 36 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome的下游信号传导激活的FGFR | 100 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome SHC介导的级联 | 28 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ILS的Reactome信号传导 | 107 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome IL 2信号传导 | 41 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
胰岛素受体的反应组信号传导 | 108 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome SOS介导的信号传导 | 14 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组止血 | 466 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome RAF MAP激酶级联 | 10 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome SHC介导的信号传导 | 15 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome适应性免疫系统 | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 | 270 | 204 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FGFR的Reactome信号传导 | 112 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome SHC相关事件 | 17 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bidus转移 | 214 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 | 633 | 376 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 | 722 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Castellano Hras和NRAS靶向DN | 8 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Castellano NRAS靶向DN | 14 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌根源与腔内 | 326 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌根源与基础 | 330 | 217 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN | 514 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KIM MYCL1扩增靶向DN | 20 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Koyama Sema3b靶向DN | 411 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
丁肺癌显着突变 | 26 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
费尔南德斯(Fernandez)由迈克(Myc)约束 | 182 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍夫曼细胞淋巴瘤 | 50 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 | 314 | 201 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MariaDason对丁酸酯Sulindac 4的反应 | 21 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YIH对砷C1的反应 | 24 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hillion HMGA1目标 | 90 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hillion HMGA1B目标 | 92 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stearman肺癌早期与晚期 | 125 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
营地结肠癌复制号码 | 92 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张乳腺癌祖细胞 | 425 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西部肾上腺皮质肿瘤 | 294 | 199 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bhati G2M被2methoxyestradiol逮捕 | 125 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Firestein CTNNB1途径 | 33 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王肿瘤的侵入性DN | 210 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
格雷希克癌症复制号码 | 323 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌的生存率差A6 | 456 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
croonquist nras发出信号 | 41 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Croonquist NRAS与基质刺激 | 41 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
丁肺癌反复突变 | 6 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boyault肝癌子类G3 UP | 188 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dang myc的目标 | 143 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
Let-7/98 | 186 | 192 | M8 | HSA-LET-7A脑 | ugagguaguaguauauaguu |
HSA-LET-7B脑 | ugagguaguagguuguguguguu | ||||
HSA-LET-7C脑 | ugagguaguagguuguaugguu | ||||
HSA-LET-7D脑 | agagguaguagguugcauagu | ||||
HSA-LET-7E脑 | ugagguaggagguuauauagu | ||||
HSA-LET-7F脑 | ugagguagauuguauauaguu | ||||
HSA-MIR-98脑 | ugagguaaguuguauuguu | ||||
HSA-LET-7GSZ | ugagguaguuguuguacagu | ||||
HSA-LET-7I脑 | ugagguaguugugugugugcugu | ||||
mir-124/506 | 640 | 646 | M8 | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
HSA-MIR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
mir-196 | 185 | 191 | M8 | HSA-MIR-196A | uagguaguucauguugugug |
HSA-MIR-196B | uagguaguucuuguugg | ||||
mir-28 | 116 | 122 | M8 | HSA-MIR-28脑 | Aaggagcucacagucuauugag |
mir-326 | 210 | 216 | 1a | HSA-MIR-326 | ccucugggcccuccag |
mir-361 | 966 | 972 | 1a | HSA-MIR-361脑 | uuaucagaaucuccagggguac |
mir-505 | 418 | 424 | 1a | HSA-MIR-505 | gucaacuugcugguuccuc |