基因页：NRCAM
概括？
| 基因 | 4897 |
| 象征 | NRCAM |
| 同义词 | - |
| 描述 | 神经元细胞粘附分子 |
| 参考 | MIM：601581|HGNC：HGNC：7994|Ensembl：ENSG00000091129|HPRD：07207|Vega：Otthumg00000154973 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 7q31 |
| Pascal P值 | 0.008 |
| Sherlock P值 | 0.272 |
| 胎儿β | 1.079 |
| 主持人 | 元 |
| 支持 | G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL COMPOSITESET |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：8 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| CNOT1 | 0.96 | 0.96 |
| C2CD3 | 0.94 | 0.95 |
| KDM3B | 0.94 | 0.95 |
| IPO9 | 0.94 | 0.94 |
| PRPF8 | 0.94 | 0.96 |
| DHX8 | 0.94 | 0.96 |
| crkrs | 0.94 | 0.95 |
| SNRNP200 | 0.94 | 0.94 |
| Lig3 | 0.94 | 0.95 |
| MSL2 | 0.94 | 0.96 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.75 | -0.85 |
| MT-CO2 | -0.74 | -0.85 |
| ifi27 | -0.72 | -0.82 |
| AF347015.21 | -0.72 | -0.89 |
| AF347015.27 | -0.71 | -0.82 |
| FXYD1 | -0.71 | -0.82 |
| AF347015.8 | -0.70 | -0.83 |
| AF347015.33 | -0.70 | -0.79 |
| higd1b | -0.69 | -0.82 |
| mt-cyb | -0.69 | -0.80 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | nas | 11483367 | |
| 去：0030506 | Ankyrin结合 | 艾达 | 14602817 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0045162 | 电压门控钠通道的聚类 | 艾达 | 神经元，轴突（GO术语级别：12） | 14602817 |
| 去：0007417 | 中枢神经系统发展 | nas | 大脑（GO期限：6） | 8812479 |
| 去：0007416 | 突触发生 | 塔斯 | 突触（GO期限：6） | 8812479 |
| 去：0007413 | 轴突束缚 | nas | 神经元，Axon（GO术语级别：13） | 8812479 |
| 去：0001764 | 神经元迁移 | nas | 神经元（GO期限：8） | 11483367 |
| 去：0030516 | 轴突延伸的调节 | nas | Axon（GO术语级别：14） | 8812479 |
| 去：0045666 | 神经元分化的阳性调节 | nas | 神经元（GO期限：10） | 8812479 |
| GO：0016337 | 细胞细胞粘附 | nas | 8812479 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0043005 | 神经元投影 | nas | 神经元，轴突，神经突，树突（GO期限：5） | 8812479 |
| 去：0009897 | 质膜的外侧 | nas | 8812479 | |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - | |
| 去：0005887 | 质膜的积分 | nas | 8812479 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg细胞粘附分子凸轮 | 134 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome发育生物学 | 396 | 292 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Axon指导 | 251 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome L1CAM相互作用 | 86 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| L1和氨基链蛋白之间的反应组相互作用 | 23 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 家长MTOR信号传导DN | 46 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Davicioni pax foxo1手臂签名 | 59 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Davicioni分子臂与ERMS | 332 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PAX FOXO1融合的Davicioni目标 | 255 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Davicioni Rhabdomyosarcoma PAX FOXO1融合 | 64 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Jaeger转移DN | 258 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| runx1 runx1t1融合HSC的TONKS目标UP | 185 | 126 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| runx1 runx1t1融合红细胞的TONKS目标 | 157 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| runx1 runx1t1融合的TONKS目标维持在红细胞中 | 44 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Odonnell TFRC靶向 | 456 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MYC和TFRC的Odonnell目标 | 83 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gozgit ESR1靶向DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌 | 443 | 294 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| chebotaev gr目标dn | 120 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PAX3 FOXO1融合DN的Ebauer目标 | 48 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Teramoto OPN目标集群8 | 8 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 温曼对缺氧DN的适应 | 41 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gruetzmann胰腺癌DN | 203 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 狮子转移 | 539 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 里克曼头颈癌 | 100 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Onder CDH1目标2 DN | 464 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 康（Kang）因tert而永生 | 89 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Petrova内皮淋巴与血液DN | 162 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Petrova Prox1靶向DN | 64 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 牙槽横纹肌肉瘤 | 98 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| XU GH1自分泌目标DN | 142 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mahajan对IL1A的回应 | 81 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性1 | 528 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Riggins他莫昔芬抵抗DN | 220 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kyng DNA损坏紫外线 | 62 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kyng DNA损坏 | 226 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| coates巨噬细胞M1 vs M2向上 | 81 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee转移和替代剪接 | 74 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Massarweh他莫昔芬抵抗DN | 258 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 克拉斯的iwanaga致癌作用 | 170 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| riggi ewing肉瘤祖先 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zheng胶质母细胞瘤可塑性 | 250 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hoelzel NF1靶向 | 139 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pedrioli mir31靶向DN | 418 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BOSCO过敏原诱导TH2相关模块 | 151 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 林乳腺干细胞向上 | 489 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-124/506 | 833 | 839 | M8 | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
| HSA-MIR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
| mir-153 | 1257 | 1263 | 1a | HSA-MIR-153 | Uugcauagucacaaaaguga |
| mir-182 | 1457 | 1463 | M8 | HSA-MIR-182 | uuuggcaaugguagaacucaca |
| mir-191 | 408 | 414 | M8 | HSA-MIR-191脑 | caacggaaucccaaaagcagcu |
| mir-218 | 1963年 | 1969年 | 1a | HSA-MIR-218脑 | uugugcuugaucuaaccaugu |
| mir-30-3p | 1717年 | 1723年 | M8 | HSA-MIR-30A-3P | cuuucagucggauguugcagc |
| HSA-MIR-30E-3P | cuuucagucggauguauacagc | ||||
| mir-431 | 819 | 826 | 1A，M8 | HSA-MIR-431 | uguugcaggccguauga |
| mir-448 | 1257 | 1263 | 1a | HSA-MIR-448 | uugcauauguaggauguccccau |
| mir-505 | 1530 | 1536年 | 1a | HSA-MIR-505 | gucaacuugcugguuccuc |
| mir-539 | 1472 | 1478 | 1a | HSA-MIR-539 | ggagaauuauccuuggugugu |