概括
基因 4901
象征 NRL
同义词 D14S46E | NRL-MAF | RP27
描述 神经视网膜亮氨酸拉链
参考 MIM:162080|HGNC:HGNC:8002|ENSEMBL:ENSG00000129535|HPRD:08875|Vega:Otthumg0000000028789
基因类型 蛋白质编码
地图位置 14Q11.1-Q11.2
Pascal P值 0.242
胎儿β -0.347

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.047
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003700 转录因子活性 IEA -
去:0003704 特异性RNA聚合酶II转录因子活性 塔斯 8939891
GO:0043565 序列特异性DNA结合 IEA -
GO:0046983 蛋白质二聚活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006355 调节转录,DNA依赖性的调节 IEA -
去:0007601 视觉感知 塔斯 1729696
GO:0050896 对刺激的反应 IEA -
GO:0045872 视紫红质基因表达的阳性调节 IEA -
GO:0045944 RNA聚合酶II启动子的转录阳性调节 IEA -
GO:0046548 视网膜杆细胞发育 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 塔斯 8939891

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
周的炎症反应生活 485 293 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应fima 544 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周炎性反应lps up 431 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC网络 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 ICP带有H3K27ME3 74 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF ICP与H3K27Me3 206 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pedrioli mir31靶向DN 418 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-338 175 181 M8 HSA-MIR-338 uccagauuuuuguuga
mir-542-3p 660 666 M8 HSA-MIR-542-3P ugugacauugauaacugaaa