基因页:NRL
概括?
基因 | 4901 |
象征 | NRL |
同义词 | D14S46E | NRL-MAF | RP27 |
描述 | 神经视网膜亮氨酸拉链 |
参考 | MIM:162080|HGNC:HGNC:8002|ENSEMBL:ENSG00000129535|HPRD:08875|Vega:Otthumg0000000028789 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 14Q11.1-Q11.2 |
Pascal P值 | 0.242 |
胎儿β | -0.347 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.047 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/NRL_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003700 | 转录因子活性 | IEA | - | |
去:0003704 | 特异性RNA聚合酶II转录因子活性 | 塔斯 | 8939891 | |
GO:0043565 | 序列特异性DNA结合 | IEA | - | |
GO:0046983 | 蛋白质二聚活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006355 | 调节转录,DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
去:0007601 | 视觉感知 | 塔斯 | 1729696 | |
GO:0050896 | 对刺激的反应 | IEA | - | |
GO:0045872 | 视紫红质基因表达的阳性调节 | IEA | - | |
GO:0045944 | RNA聚合酶II启动子的转录阳性调节 | IEA | - | |
GO:0046548 | 视网膜杆细胞发育 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | 塔斯 | 8939891 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
周的炎症反应生活 | 485 | 293 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周的炎症反应fima | 544 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周炎性反应lps up | 431 | 237 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MCV6 ICP带有H3K27ME3 | 74 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF ICP与H3K27Me3 | 206 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pedrioli mir31靶向DN | 418 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-338 | 175 | 181 | M8 | HSA-MIR-338脑 | uccagauuuuuguuga |
mir-542-3p | 660 | 666 | M8 | HSA-MIR-542-3P | ugugacauugauaacugaaa |