基因页：NTF3

概括？
基因 4908
象征 NTF3
同义词 hdnf | ngf-2 | ngf2 | nt-3 | nt3
描述 神经营养蛋白3
参考 MIM：162660|HGNC：HGNC：8023|ENSEMBL：ENSG00000185652|HPRD：01219|Vega：Otthumg00000168649
基因类型 蛋白质编码
地图位置 12p13
Pascal P值 0.008
胎儿β 2.551

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法（Sun等。2008），协会研究 2 链接到Szgene
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中：9

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
RSAD2 0.85 0.78
OAS3 0.83 0.79
GBP1 0.80 0.77
MX2 0.80 0.71
PARP12 0.75 0.73
HLA-B 0.74 0.66
SLC15A3 0.74 0.66
ACSL5 0.73 0.75
HLA-A 0.73 0.57
GBP3 0.72 0.75
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C17orf48 -0.45 -0.55
RBMX2 -0.45 -0.56
zbed5 -0.44 -0.52
RBM3 -0.44 -0.51
Med19 -0.44 -0.54
ZNF821 -0.44 -0.49
WDR70 -0.44 -0.47
Blvra -0.43 -0.50
SAAL1 -0.43 -0.51
U2AF1 -0.43 -0.50

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005165 神经营养蛋白受体结合 IEA -
去：0008083 生长因子活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007420 大脑发育 IEA 大脑（GO期限：7） -
去：0007411 轴突指导 IEA Axon（GO期限：13） -
去：0007403 神经胶质细胞命运测定 IEA 神经胶质（GO期限：10） -
GO：0048699 神经元的产生 IEA 神经元，神经发生（GO期限：7） -
GO：0048666 神经元发展 IEA 神经元（GO期限：9） -
去：0007274 神经肌肉突触传播 IEA 神经元，突触（GO期限：7） -
GO：0048484 肠神经系统发展 IEA 神经元（GO期限：7） -
GO：0042490 机械感受器的分化 IEA 神经元（GO期限：9） -
GO：0043523 神经元细胞凋亡的调节 IEA 神经元（GO期限：8） -
去：0007267 细胞细胞信号传导 塔斯 2236018
去：0007165 信号转导 塔斯 2236018
去：0008544 表皮发展 IEA -
去：0007422 周围神经系统发展 IEA -
GO：0021675 神经发育 IEA -
GO：0051145 平滑肌细胞分化 IEA -
GO：0045944 RNA聚合酶II启动子的转录阳性调节 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005576 细胞外区域 IEA -
GO：0016023 细胞质膜结合的囊泡 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
kegg mapk信号通路 267 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG神经营养蛋白信号传导途径 126 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID SHP2途径 58 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID P75 NTR途径 69 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TRKR途径 62 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID MAPK TRK途径 34 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HATADA甲基化在肺癌DN中 38 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shipp DLBCL治愈与致命 39 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
康（Kang）因tert而永生 89 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Affar YY1目标 214 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线响应集群D2 41 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线高剂量DN 312 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染6小时DN 160 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee衰老的肌肉 45 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Acevedo肝癌，H3K27me3 UP 295 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP，含H3未甲基化 536 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤课程DN 210 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应很晚 317 190 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Servitja肝HNF1A靶向 135 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞向上 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA分泌因素 344 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA女性相关 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
MiR-200BC/429 249 255 M8 HSA-MIR-200B uaauacugccugguaaugaugac
HSA-MIR-200C uaauacugccggguaaugaugg
HSA-MIR-429 uaauacuguguguguguguaaaaaccgu
HSA-MIR-200B uaauacugccugguaaugaugac
HSA-MIR-200C uaauacugccggguaaugaugg
HSA-MIR-429 uaauacuguguguguguguaaaaaccgu
mir-21 133 139 M8 HSA-MIR-21脑 uagcuuaucagacugauguuga
HSA-MIR-590 gagcuuauucauaaaaagugcag
mir-221/222 52 59 1A，M8 HSA-MIR-221脑 agcuacauugucugugggggguc
HSA-MIR-222脑 agcuacaucuggcuacugggucuc
mir-369-3p 85 91 1a HSA-MIR-369-3P aauauacaugguugaucuuu
mir-374 85 92 1A，M8 HSA-MIR-374 uuauaauacaAccugauaagug
mir-410 80 86 1a HSA-MIR-410 aauauaacacagauggcugu
mir-448 46 52 M8 HSA-MIR-448 uugcauauguaggauguccccau
mir-539 142 148 1a HSA-MIR-539 ggagaauuauccuuggugugu