基因页：ntrk3
概括？
| 基因 | 4916 |
| 象征 | ntrk3 |
| 同义词 | GP145-TRKC | TRKC | GP145（TRKC） |
| 描述 | 神经营养性酪氨酸激酶，受体，3型 |
| 参考 | MIM：191316|HGNC：HGNC：8033|ENSEMBL：ENSG00000140538|HPRD：01870|Vega：Otthumg00000148677 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 15Q25 |
| Pascal P值 | 7.654e-5 |
| Sherlock P值 | 0.88 |
| 胎儿β | 0.198 |
| 支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：3 | |
| 网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献：0.3152 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0004714 | 跨膜受体蛋白酪氨酸激酶活性 | IEA | 神经突（GO期限：8） | - |
| GO：0043121 | 神经营养蛋白结合 | 塔斯 | 神经元（GO期限：5） | 7806211 |
| 去：0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
| 去：0004872 | 受体活性 | IEA | - | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
| 去：0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
| 去：0004713 | 蛋白酪氨酸激酶活性 | IEA | - | |
| GO：0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007399 | 神经系统的发展 | IEA | 神经突（GO期限：5） | - |
| 去：0007169 | 跨膜受体蛋白酪氨酸激酶信号传导途径 | 塔斯 | 7806211 | |
| 去：0006468 | 蛋白氨基酸磷酸化 | IEA | - | |
| 去：0007275 | 多细胞生物发育 | IEA | - | |
| 去：0030154 | 细胞分化 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - | |
| 去：0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 7806211 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG神经营养蛋白信号传导途径 | 126 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID SHP2途径 | 58 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID TRKR途径 | 62 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Davicioni分子臂与ERMS | 332 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| thum收缩性心力衰竭 | 423 | 283 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gal白血病干细胞向上 | 133 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| vecchi胃癌早期DN | 367 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| runx1 runx1t1融合HSC的TONKS目标UP | 185 | 126 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mohankumar TLX1靶向 | 414 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 丁肺癌显着突变 | 26 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| pomeroy髓母细胞瘤脱毛质vs经典DN | 59 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| pomeroy髓母细胞瘤预后 | 47 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 彭谷氨酰胺剥夺DN | 337 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 松本自然杀手差分 | 475 | 313 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 | 412 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TACI UP淋巴细胞的淋巴细胞成熟 | 92 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血干细胞 | 254 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 布朗HCMV感染48小时 | 180 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血细胞和祖细胞 | 681 | 420 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gavin Foxp3目标集群P7 | 90 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| H3K27ME3 DN的Acevedo肝癌 | 228 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Labbe TGFB1靶向DN | 108 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LIN NPAS4靶向 | 163 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 格雷希克癌症复制号码 | 323 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML带8 21易位 | 368 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML与T 9 11易位 | 130 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hoelzel NF1靶向DN | 115 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 霍尔曼天冬酰胺酶抗性B | 26 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 霍尔曼天冬酰胺酶抗性全部 | 22 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-128 | 209 | 215 | M8 | HSA-MIR-128A | ucacagugaaccggucuuuu |
| HSA-MIR-128B | ucacagugaaccggucuuc | ||||
| mir-142-5p | 1963年 | 1969年 | M8 | HSA-MIR-142-5P | cauaaaguagaaagcacuac |
| mir-149 | 542 | 548 | M8 | HSA-MIR-149脑 | Ucuggcuccucuucuucacuccc |
| mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D | 1962年 | 1968年 | 1a | HSA-MIR-17-5P | caaagugcuuacugcagguagu |
| HSA-MIR-20A脑 | uaaagugcuuauagugcagguag | ||||
| HSA-MIR-106A | aaaagugcuuacugugcagguagc | ||||
| HSA-MIR-106BSZ | uaaagugcugacagugcagau | ||||
| HSA-MIR-20BSZ | caaagugcuugugcagguag | ||||
| HSA-MIR-519D | caaagugccucccuuuagugugu | ||||
| mir-24 | 117 | 123 | 1a | HSA-MIR-24SZ | uggcucucagagcaggaagag |
| mir-324-5p | 95 | 101 | M8 | HSA-MIR-324-5p | CGCAUCCCCUAGGGCAUUGGU |
| mir-378* | 369 | 375 | M8 | HSA-MIR-422B | cuggacuuggagagaaggcc |
| HSA-MIR-422A | cuggacuagggucagaaggcc | ||||
| mir-384 | 1188 | 1194 | 1a | HSA-MIR-384 | auuccuagaaauuguucaua |
| mir-9 | 1110 | 1116 | 1a | HSA-MIR-9SZ | ucuuuguuaucuagcuguauga |