基因页：ROR1

概括？
基因 4919
象征 ROR1
同义词 ntrkr1 | dj537f10.1
描述 受体酪氨酸激酶样孤儿受体1
参考 MIM：602336|HGNC：HGNC：10256|ENSEMBL：ENSG00000185483|HPRD：03821|Vega：Otthumg00000009022
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p31.3
Pascal P值 0.74
胎儿β 0.517
DMG 1（＃研究）
主持人 小脑半球
小脑
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV：GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 2
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析（所有样品） PSR：0.02692
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中：1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG03768622 1 64239401 ROR1 5.35e-5 -0.627 0.022 DMG：Wockner_2014
CG04885825 1 64538523 ROR1 7.86e-5 -0.423 0.025 DMG：Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS780587 CHR1 4505965 ROR1 4919 0.02 反式
RS2502827 CHR1 176044216 ROR1 4919 0.15 反式
RS16829545 CHR2 151977407 ROR1 4919 7.474E-4 反式
RS16841750 CHR2 158288461 ROR1 4919 0.01 反式
RS10183246 CHR2 237187882 ROR1 4919 0.13 反式
RS10195546 CHR2 237187933 ROR1 4919 0.16 反式
RS9810143 CHR3 5060209 ROR1 4919 0.04 反式
RS6797307 CHR3 8601563 ROR1 4919 0.01 反式
RS7692715 CHR4 125335209 ROR1 4919 0.19 反式
RS11937178 CHR4 148847598 ROR1 4919 7.699E-4 反式
RS11934409 CHR4 148848884 ROR1 4919 7.699E-4 反式
RS17136024 CHR7 54016166 ROR1 4919 0.19 反式
RS6467726 CHR7 137610394 ROR1 4919 0.13 反式
RS4921990 CHR8 18935646 ROR1 4919 5.331E-4 反式
RS10500981 Chr11 24543474 ROR1 4919 0.09 反式
RS504578 Chr11 78862291 ROR1 4919 0.04 反式
RS11564157 CHR12 40554096 ROR1 4919 0.09 反式
RS7488439 CHR12 105155814 ROR1 4919 0.12 反式
RS17036489 CHR12 105292283 ROR1 4919 0.02 反式
RS7337531 CHR13 109611085 ROR1 4919 0 反式
RS16955618 CHR15 29937543 ROR1 4919 3.499E-6 反式
RS4785436 CHR16 50590846 ROR1 4919 0.19 反式
RS8068272 CHR17 49952680 ROR1 4919 0.01 反式
RS17651763 CHR18 34232106 ROR1 4919 0.01 反式
RS17681878 CHR18 34767223 ROR1 4919 2.137E-4 反式
RS17782355 CHR19 55807585 ROR1 4919 0.03 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MDS1 0.77 0.78
EVI1 0.76 0.78
cobll1 0.75 0.78
FZD6 0.75 0.72
FLI1 0.75 0.76
Tek 0.74 0.78
FLT1 0.73 0.75
TGFBR2 0.72 0.80
Stat3 0.72 0.74
ZNF366 0.71 0.75
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SNHG12 -0.40 -0.48
Znf32 -0.38 -0.42
AC009171.1 -0.37 -0.41
ACSM3 -0.37 -0.41
PFDN5 -0.37 -0.45
Commd3 -0.36 -0.37
RPL31 -0.36 -0.48
RPL35 -0.36 -0.45
NDUFAF2 -0.36 -0.38
AC008763.1 -0.36 -0.46

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0004714 跨膜受体蛋白酪氨酸激酶活性 塔斯 神经突（GO期限：8） 8875995
去：0000166 核苷酸结合 IEA -
去：0004872 受体活性 IEA -
去：0005524 ATP结合 IEA -
GO：0016740 转移酶活性 IEA -
去：0016301 激酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007169 跨膜受体蛋白酪氨酸激酶信号传导途径 塔斯 1334494
去：0006468 蛋白氨基酸磷酸化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005737 细胞质 塔斯 8875995
去：0005886 质膜 塔斯 1334494|8875995
去：0005887 质膜的积分 塔斯 1334494

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Schuetz乳腺癌导管侵入性 351 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee神经Crest干细胞向上 146 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 633 376 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌 443 294 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 TTD DN 84 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dacosta ercc3等位基因XPCS vs TTD DN 36 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Buytaert光动力疗法应力DN 637 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向DN 411 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Oct4目标 290 172 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath SOX2目标 734 436 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath NOS目标 179 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2向上 256 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HALMOS CEBPA目标DN 46 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯对trabectedin的反应 50 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ramaswamy转移DN 61 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Xu GH1自分泌目标 268 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Smarce1靶向 280 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞向上 260 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Firestein增殖 175 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gutierrez慢性淋巴细胞性白血病DN 56 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标汇合 567 365 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Servitja肝HNF1A靶向DN 157 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因