基因页：DDR2
Summary？
| 基因ID | 4921 |
| Symbol | DDR2 |
| 同义词 | mig20a | ntrkr3 | tkt | tyro10 |
| 描述 | 盘状蛋白结构域受体酪氨酸激酶2 |
| 参考 | MIM：191311|HGNC：HGNC：2731|ENSEMBL：ENSG00000162733|HPRD：01868|Vega:OTTHUMG00000034423 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1q23.3 |
| Sherlock P值 | 1.748E-4 |
| 胎儿β | -0.45 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
基因in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.00814 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | Hits with neuro-related keywords: 2 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS878715 | CHR7 | 156383236 | DDR2 | 4921 | 0.14 | 反式 | ||
| RS878716 | CHR7 | 156383347 | DDR2 | 4921 | 0.08 | 反式 | ||
| RS7039404 | Chr9 | 90934986 | DDR2 | 4921 | 0.03 | 反式 | ||
| RS5915856 | Chrx | 4792060 | DDR2 | 4921 | 0.17 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ATAD1 | 0.93 | 0.93 |
| AVL9 | 0.92 | 0.94 |
| LRPPRC | 0.92 | 0.94 |
| SCAMP1 | 0.92 | 0.94 |
| arcn1 | 0.92 | 0.94 |
| ATF2 | 0.92 | 0.93 |
| USP33 | 0.91 | 0.93 |
| MBTPS2 | 0.91 | 0.93 |
| Elavl2 | 0.91 | 0.92 |
| Spin1 | 0.91 | 0.92 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| FXYD1 | -0.73 | -0.76 |
| MT-CO2 | -0.73 | -0.77 |
| AF347015.31 | -0.72 | -0.76 |
| higd1b | -0.71 | -0.76 |
| AF347015.8 | -0.70 | -0.76 |
| AF347015.33 | -0.70 | -0.74 |
| AF347015.2 | -0.70 | -0.74 |
| mt-cyb | -0.69 | -0.73 |
| AF347015.21 | -0.69 | -0.74 |
| ifi27 | -0.68 | -0.73 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| GO:0004714 | 跨膜受体蛋白酪氨酸激酶活性 | IEA | 神经突（GO期限：8） | - |
| GO:0004714 | 跨膜受体蛋白酪氨酸激酶活性 | 塔斯 | 神经突（GO期限：8） | 9659899 |
| 去：0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
| 去：0004872 | 受体活性 | IEA | - | |
| 去：0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
| GO:0004713 | 蛋白酪氨酸激酶活性 | IEA | - | |
| GO：0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
| 去：0016301 | 激酶活性 | IEA | - | |
| Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007169 | 跨膜受体蛋白酪氨酸激酶信号传导途径 | IEA | - | |
| 去：0007155 | 细胞粘附 | IEA | - | |
| 去：0007155 | 细胞粘附 | 塔斯 | 9659899 | |
| GO:0006468 | 蛋白氨基酸磷酸化 | IEA | - | |
| 去：0007165 | 信号转导 | 塔斯 | 9659899 | |
| 去：0008284 | 细胞增殖的阳性调节 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO:0016020 | 膜 | IEA | - | |
| 去：0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 9659899 |
部分诉通路注释
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-122 | 75 | 81 | 1a | HSA-MIR-122A | uggagugugacaaugguuuugu |