基因页面:RNF165

总结吗?
GeneID 494470年
象征 RNF165
同义词 ARKL2 | RNF111L2
描述 无名指蛋白质165
参考 HGNC: HGNC: 31696|运用:ENSG00000141622|
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 18 q21.1
帕斯卡假定值 0.003
胎儿β 3.216
DMG 1(#研究)
eGene 迈尔斯的顺式和反式

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 1

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg06418113 18 43915901 RNF165 1.303的军医 0.479 0.03 DMG: Wockner_2014

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs12030788 chr1 66768128 RNF165 494470年 0.14 反式
rs6753473 chr2 26526418 RNF165 494470年 0 反式
rs13011747 chr2 52263123 RNF165 494470年 0.12 反式
rs16829545 chr2 151977407 RNF165 494470年 2.826的军医 反式
rs7584986 chr2 184111432 RNF165 494470年 0.04 反式
rs1026973 chr4 20012154 RNF165 494470年 0.03 反式
rs10491487 chr5 80323367 RNF165 494470年 0.07 反式
rs1368303 chr5 147672388 RNF165 494470年 0 反式
rs11066476 chr12 113465366 RNF165 494470年 0.18 反式
rs7326787 chr13 101985741 RNF165 494470年 0.08 反式
rs16955618 chr15 29937543 RNF165 494470年 1.88 e-6 反式
rs3829539 chr16 19722365 RNF165 494470年 0.11 反式
rs749043 chr20 46995700 RNF165 494470年 0.14 反式

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

没有大脑中的基因区域


第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005515 蛋白结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0008270 锌离子结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0046872 金属离子结合 国际能源机构 - - - - - -

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
多德鼻咽癌DN 1375年 806年 所有SZGR 2.0基因通路
MARTORIATI MDM4目标胎儿肝脏 227年 137年 所有SZGR 2.0基因通路
鲜明的前额叶皮层22 q11删除 195年 138年 所有SZGR 2.0基因通路
结肠癌年级了 871年 505年 所有SZGR 2.0基因通路
罗马胰岛素的目标肌肉DN 204年 114年 所有SZGR 2.0基因通路
DN HOELZEL NF1目标 115年 73年 所有SZGR 2.0基因通路
棕熊短波紫外线反应通过TP53 D组 280年 158年 所有SZGR 2.0基因通路
LIM乳腺干细胞 489年 314年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
let-7/98 3946年 3952年 1 hsa-let-7a大脑 UGAGGUAGUAGGUUGUAUAGUU
hsa-let-7b大脑 UGAGGUAGUAGGUUGUGUGGUU
hsa-let-7c大脑 UGAGGUAGUAGGUUGUAUGGUU
hsa-let-7d大脑 AGAGGUAGUAGGUUGCAUAGU
hsa-let-7e大脑 UGAGGUAGGAGGUUGUAUAGU
hsa-let-7f大脑 UGAGGUAGUAGAUUGUAUAGUU
hsa - mir - 98大脑 UGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUU
hsa-let-7g深圳 UGAGGUAGUAGUUUGUACAGU
hsa-let-7i大脑 UGAGGUAGUAGUUUGUGCUGU
miR-1/206 4121年 4128年 1、m8 hsa-miR-1 UGGAAUGUAAAGAAGUAUGUA
hsa - mir - 206深圳 UGGAAUGUAAGGAAGUGUGUGG
hsa - mir - 613 AGGAAUGUUCCUUCUUUGCC
miR-10 3784年 3790年 m8 hsa-miR-10a UACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUG
hsa-miR-10b UACCCUGUAGAACCGAAUUUGU
mir - 124.1 3805年 3811年 m8 hsa - mir - 124 a UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
miR-124/506 3247年 3253年 m8 hsa - mir - 506 UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA
hsa - mir - 124大脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
hsa - mir - 506 UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA
hsa - mir - 124大脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
miR-126/126-3p 3994年 4000年 1 hsa - mir - 126大脑 UCGUACCGUGAGUAAUAAUGC
mir - 129 - 5 - p 3751年 3757年 1 hsa - mir - 129大脑 CUUUUUGCGGUCUGGGCUUGC
hsa - mir - 129 - 5 - p CUUUUUGCGGUCUGGGCUUGCU
hsa - mir - 129大脑 CUUUUUGCGGUCUGGGCUUGC
hsa - mir - 129 - 5 - p CUUUUUGCGGUCUGGGCUUGCU
miR-130/301 1766年 1772年 m8 hsa - mir - 130 a大脑 CAGUGCAAUGUUAAAAGGGCAU
hsa - mir - 301 CAGUGCAAUAGUAUUGUCAAAGC
hsa - mir - 130 b大脑 CAGUGCAAUGAUGAAAGGGCAU
hsa - mir - 454 - 3 - p UAGUGCAAUAUUGCUUAUAGGGUUU
mir - 142 - 5 - p 4050年 4056年 m8 hsa - mir - 142 - 5 - p CAUAAAGUAGAAAGCACUAC
mir - 143 3677年 3683年 m8 hsa - mir - 143大脑 UGAGAUGAAGCACUGUAGCUCA
miR-148/152 1767年 1773年 m8 hsa - mir - 148 a UCAGUGCACUACAGAACUUUGU
hsa - mir - 152大脑 UCAGUGCAUGACAGAACUUGGG
hsa - mir - 148 b UCAGUGCAUCACAGAACUUUGU
mir - 150 666年 672年 m8 hsa - mir - 150 UCUCCCAACCCUUGUACCAGUG
mir - 153 1083年 1090年 1、m8 hsa - mir - 153 UUGCAUAGUCACAAAAGUGA
miR-19 1765年 1771年 m8 hsa-miR-19a UGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGA
hsa-miR-19b UGUGCAAAUCCAUGCAAAACUGA
mir - 218 113年 119年 m8 hsa - mir - 218大脑 UUGUGCUUGAUCUAACCAUGU
hsa - mir - 218大脑 UUGUGCUUGAUCUAACCAUGU
mir - 219 3818年 3824年 1 hsa - mir - 219大脑 UGAUUGUCCAAACGCAAUUCU
miR-221/222 3646年 3652年 1 hsa - mir - 221大脑 AGCUACAUUGUCUGCUGGGUUUC
hsa - mir - 222大脑 AGCUACAUCUGGCUACUGGGUCUC
miR-24 82年 89年 1、m8 hsa-miR-24深圳 UGGCUCAGUUCAGCAGGAACAG
miR-28 3466年 3472年 m8 hsa-miR-28大脑 AAGGAGCUCACAGUCUAUUGAG
miR-29 4101年 4107年 m8 hsa-miR-29a深圳 UAGCACCAUCUGAAAUCGGUU
hsa-miR-29b深圳 UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU
hsa-miR-29c深圳 UAGCACCAUUUGAAAUCGGU
hsa-miR-29a深圳 UAGCACCAUCUGAAAUCGGUU
hsa-miR-29b深圳 UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU
hsa-miR-29c深圳 UAGCACCAUUUGAAAUCGGU
miR-30-5p 3780年 3786年 1 hsa-miR-30a-5p UGUAAACAUCCUCGACUGGAAG
hsa-miR-30c大脑 UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC
hsa-miR-30d深圳 UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG
hsa-miR-30b深圳 UGUAAACAUCCUACACUCAGCU
hsa-miR-30e-5p UGUAAACAUCCUUGACUGGA
hsa-miR-30a-5p UGUAAACAUCCUCGACUGGAAG
hsa-miR-30c大脑 UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC
hsa-miR-30d深圳 UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG
hsa-miR-30b深圳 UGUAAACAUCCUACACUCAGCU
hsa-miR-30e-5p UGUAAACAUCCUUGACUGGA
mir - 329 4074年 4080年 m8 hsa - mir - 329大脑 AACACACCUGGUUAACCUCUUU
miR-33 4134年 4140年 1 hsa-miR-33 GUGCAUUGUAGUUGCAUUG
hsa-miR-33b GUGCAUUGCUGUUGCAUUGCA
mir - 330 3979年 3985年 m8 hsa - mir - 330大脑 GCAAAGCACACGGCCUGCAGAGA
mir - 374 3895年 3901年 1 hsa - mir - 374 UUAUAAUACAACCUGAUAAGUG
mir - 377 4076年 4082年 m8 hsa - mir - 377 AUCACACAAAGGCAACUUUUGU
mir - 448 1084年 1090年 1 hsa - mir - 448 UUGCAUAUGUAGGAUGUCCCAU
mir - 450 1087年 1093年 1 hsa - mir - 450 UUUUUGCGAUGUGUUCCUAAUA
mir - 452 4136年 4142年 m8 hsa - mir - 452 UGUUUGCAGAGGAAACUGAGAC
mir - 485 - 5 - p 3489年 3495年 m8 hsa - mir - 485 - 5 - p AGAGGCUGGCCGUGAUGAAUUC
mir - 487 b 3995年 4001年 m8 hsa - mir - 487 b AAUCGUACAGGGUCAUCCACUU
mir - 494 3673年 3679年 1 hsa - mir - 494大脑 UGAAACAUACACGGGAAACCUCUU
mir - 539 730年 736年 1 hsa - mir - 539 GGAGAAAUUAUCCUUGGUGUGU
hsa - mir - 539 GGAGAAAUUAUCCUUGGUGUGU