基因页:OAZ1
概括?
基因 | 4946 |
象征 | OAZ1 |
同义词 | Azi | Oaz |
描述 | 鸟氨酸脱羧酶抗酶1 |
参考 | MIM:601579|HGNC:HGNC:8095|ENSEMBL:ENSG00000104904|HPRD:03346|Vega:Otthumg00000178459 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19p13.3 |
Sherlock P值 | 0.737 |
胎儿β | -0.732 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG01859460 | 19 | 2273050 | OAZ1 | 9.83e-5 | 0.494 | 0.028 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/OAZ1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
GABRB3 | 0.88 | 0.91 |
NRCAM | 0.87 | 0.89 |
FAM20B | 0.87 | 0.89 |
clcn4 | 0.86 | 0.90 |
tspyl5 | 0.85 | 0.90 |
MAP2 | 0.85 | 0.89 |
A2BP1 | 0.84 | 0.88 |
是的 | 0.84 | 0.90 |
SLC4A8 | 0.84 | 0.87 |
FAM135B | 0.83 | 0.88 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AL139819.3 | -0.57 | -0.63 |
FXYD1 | -0.56 | -0.59 |
Rab34 | -0.56 | -0.63 |
higd1b | -0.55 | -0.60 |
AP002478.3 | -0.55 | -0.63 |
ACSF2 | -0.55 | -0.59 |
AF347015.21 | -0.55 | -0.59 |
EIF4EBP3 | -0.55 | -0.60 |
AF347015.31 | -0.54 | -0.58 |
Rhoc | -0.54 | -0.61 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
pid aurora a通道 | 31 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
氨基酸和衍生物的反应组代谢 | 200 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
鸟氨酸脱羧酶ODC的反应组调节 | 49 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan mll签名1 | 380 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名2 UP | 418 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞 | 530 | 342 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Darwiche Papilloma风险高与低DN | 32 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 | 479 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gnatenko血小板签名 | 48 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tarte浆细胞与Plasmablast向上 | 398 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞 | 225 | 163 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周TNF信号4小时 | 54 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染24小时DN | 148 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gavin Foxp3目标集群T7 | 98 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA损伤DN | 195 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng环境压力反应 | 56 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 | 354 | 216 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
等级转移DN | 45 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西部肾上腺皮质肿瘤 | 294 | 199 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hsiao家政基因 | 389 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌亚类S1 | 237 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由PML Rara Fusion绑定的Martens | 456 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 | 344 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |