Gene Page:ODC1

概括?
GeneID 4953
Symbol ODC1
同义词 ODC
描述 ornithine decarboxylase 1
参考 MIM:165640|HGNC:HGNC:8109|Ensembl：ENSG00000115758|HPRD:01324|Vega:OTTHUMG00000090450
Gene type protein-coding
Map location 2p25
Pascal p-value 0.268
Fetal beta 2.048
DMG 1（＃研究）

数据源中的基因
Gene set name Method of gene set 描述 Info
CV:PGCnp Genome-wide Association Study GWAS
DMG:Nishioka_2013 Genome-wide DNA methylation analysis The authors investigated the methylation profiles of DNA in peripheral blood cells from 18 patients with first-episode schizophrenia (FESZ) and from 15 normal controls. 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@Differentially methylated gene

Probe Chromosome Position Nearest gene P (dis) beta（dis） FDR (dis) Study
cg04169469 2 10588434 ODC1 -0.018 0.6 DMG:Nishioka_2013


Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Not available

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
SYT12 0.89 0.81
KCNT1 0.86 0.81
mast3 0.85 0.82
KCNAB2 0.85 0.81
AC105206.1 0.85 0.79
RP5-1187M17.1 0.84 0.80
STAT6 0.84 0.77
KCNK1 0.84 0.77
ZFYVE28 0.84 0.77
CAMKK1 0.84 0.74
Top 10 negatively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
HEBP2 -0.46 -0.66
Bcl7c -0.45 -0.56
FADS2 -0.44 -0.45
FAM36A -0.44 -0.38
TUBB2B -0.43 -0.55
GTF3C6 -0.43 -0.45
UBE2L6 -0.43 -0.42
KIAA1949 -0.42 -0.43
C9orf46 -0.42 -0.49
TRAF4 -0.42 -0.52

V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
KEGG ARGININE AND PROLINE METABOLISM 54 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG GLUTATHIONE METABOLISM 50 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID MYC ACTIV PATHWAY 79 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME METABOLISM OF AMINO ACIDS AND DERIVATIVES 200 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME REGULATION OF ORNITHINE DECARBOXYLASE ODC 49 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME METABOLISM OF POLYAMINES 15 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FOURNIER ACINAR DEVELOPMENT LATE DN 21 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHEMNITZ RESPONSE TO PROSTAGLANDIN E2 DN 391 222 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHONG RESPONSE TO AZACITIDINE AND TSA UP 183 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CASORELLI ACUTE PROMYELOCYTIC LEUKEMIA DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DIAZ CHRONIC MEYLOGENOUS LEUKEMIA UP 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HORIUCHI WTAP TARGETS DN 310 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ELVIDGE HYPOXIA DN 146 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DMOG DN的Elvidge缺氧 59 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIDUS METASTASIS UP 214 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV RESPONSE EPIDERMIS DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞 530 342 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DELYS THYROID CANCER UP 443 294 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VANHARANTA UTERINE FIBROID DN 67 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CAIRO PML TARGETS BOUND BY MYC UP 23 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BERENJENO TRANSFORMED BY RHOA UP 536 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG ESOPHAGUS CANCER VS NORMAL UP 121 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LASTOWSKA COAMPLIFIED WITH MYCN 43 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI AMPLIFIED IN LUNG CANCER 178 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LUI TARGETS OF PAX8 PPARG FUSION 34 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser MYC靶标和血清反应DN 47 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHLOSSER MYC TARGETS AND SERUM RESPONSE UP 47 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LUND SILENCED BY METHYLATION 16 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM MYC AMPLIFICATION TARGETS UP 201 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YANG BREAST CANCER ESR1 LASER DN 50 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SPIELMAN LYMPHOBLAST EUROPEAN VS ASIAN DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC NETWORK 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA ATM PCC NETWORK 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC NETWORK 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEI MYCN TARGETS WITH E BOX 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
gotzmann上皮到间充质过渡 69 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMIT EGF RESPONSE 480 MCF10A 43 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHEN NEUROBLASTOMA COPY NUMBER GAINS 50 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜Kras靶向DN 66 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHEPARD CRUSH AND BURN MUTANT UP 197 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MANALO缺氧DN 289 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHUHMACHER MYC TARGETS UP 80 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SANA RESPONSE TO IFNG DN 85 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
COLLER MYC TARGETS UP 25 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭谷氨酰胺剥夺DN 337 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GALINDO IMMUNE RESPONSE TO ENTEROTOXIN 85 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWN MYELOID CELL DEVELOPMENT DN 129 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NEMETH INFLAMMATORY RESPONSE LPS UP 88 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HESS TARGETS OF HOXA9 AND MEIS1 UP 65 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KUMAR TARGETS OF MLL AF9 FUSION 405 264 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHLINGEMANN SKIN CARCINOGENESIS TPA UP 42 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAL PRMT5 TARGETS UP 203 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE UP 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard对紫外线nhek的反应 244 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BAELDE DIABETIC NEPHROPATHY DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SESTO RESPONSE TO UV C7 68 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BILD HRAS ONCOGENIC SIGNATURE 261 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DURCHDEWALD SKIN CARCINOGENESIS DN 264 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MONNIER POSTRADIATION TUMOR ESCAPE UP 393 244 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群T4 94 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P6 91 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FOSTER TOLERANT MACROPHAGE DN 409 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HELLER HDAC TARGETS SILENCED BY METHYLATION UP 461 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WALLACE PROSTATE CANCER UP 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SARRIO EPITHELIAL MESENCHYMAL TRANSITION UP 180 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由喀斯特IWANAGA致癌PTEN 181 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FUJII YBX1 TARGETS DN 202 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO LIVER TUMOR VS NORMAL ADJACENT TISSUE UP 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER BASAL UP 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IZADPANAH STEM CELL ADIPOSE VS BONE UP 126 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WHITEFORD PEDIATRIC CANCER MARKERS 116 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRADE COLON CANCER UP 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WINTER HYPOXIA METAGENE 242 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CROMER TUMORIGENESIS UP 63 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha Human Mitodb 6 2002 429 260 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer生存DN 175 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TOOKER GEMCITABINE RESISTANCE UP 79 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HUNSBERGER EXERCISE REGULATED GENES 31 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Goldrath抗原反应 346 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS DN 366 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUIZ TNC TARGETS DN 142 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VANTVEER BREAST CANCER ESR1 DN 240 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌肉中的罗马胰岛素靶标 442 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOBAYASHI EGFR SIGNALING 24HR DN 251 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FOURNIER ACINAR DEVELOPMENT LATE 2 277 172 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DANG MYC TARGETS UP 143 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DANG BOUND BY MYC 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 14 143 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RAGHAVACHARI PLATELET SPECIFIC GENES 70 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHICAS RB1 TARGETS SENESCENT 572 352 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Acosta增殖独立MYC靶向 84 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JOHNSTONE PARVB TARGETS 3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE BMP2 TARGETS DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOBERT OLIGODENDROCYTE DIFFERENTIATION UP 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因