基因页：ODF1
概括？
| 基因 | 4956 |
| 象征 | ODF1 |
| 同义词 | CT133 | HSPB10 | ODF | ODF2 | ODF27 | ODFP | ODFPG | ODFPGA | ODFPGB | RT7 | SODF |
| 描述 | 精子尾的外部密集纤维1 |
| 参考 | MIM：182878|HGNC：HGNC：8113|Ensembl：ENSG00000155087|HPRD：01687|Vega：Otthumg00000164719 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 8Q22.3 |
| Pascal P值 | 0.744 |
| 胎儿β | 0.424 |
| 主持人 | 梭子基底神经节 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS189013343 | 8 | 104512428 | ODF1 | ENSG00000155087.3 | 3.3529E-6 | 0.04 | 948628 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| TCF7L2 | 0.87 | 0.43 |
| fign | 0.85 | 0.62 |
| GBX2 | 0.82 | 0.31 |
| LHX9 | 0.82 | 0.12 |
| RNF220 | 0.79 | 0.55 |
| SYT9 | 0.79 | 0.53 |
| RGS8 | 0.79 | 0.60 |
| COL23A1 | 0.79 | 0.46 |
| CPNE4 | 0.78 | 0.66 |
| fut1 | 0.77 | 0.62 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| sigirr | -0.26 | -0.52 |
| EMX2 | -0.23 | -0.49 |
| ST6GALNAC4 | -0.22 | -0.26 |
| EFEMP2 | -0.22 | -0.35 |
| GLIPR2 | -0.22 | -0.24 |
| NME4 | -0.21 | -0.51 |
| RPS20 | -0.21 | -0.45 |
| NAPRT1 | -0.21 | -0.26 |
| RPL31 | -0.21 | -0.39 |
| C6orf48 | -0.20 | -0.31 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Ouellet培养的卵巢癌侵入性与LMP DN | 35 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nikolsky乳腺癌8Q12 Q22 AMPLICON | 132 | 82 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 整合素信号传导 | 59 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| POS对组胺的反应 | 13 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MCV6 ICP带有H3K27ME3 | 74 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 巨噬细胞的库马尔病原体负荷 | 275 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |