基因页：OPA1
概括？
| 基因 | 4976 |
| 象征 | OPA1 |
| 同义词 | mgm1 | npg | ntg | groung |
| 描述 | OPA1，线粒体动力蛋白如GTPase |
| 参考 | MIM：605290|HGNC：HGNC：8140|ENSEMBL：ENSG00000198836|HPRD：05596|Vega：Otthumg00000149897 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 3Q29 |
| Pascal P值 | 0.227 |
| Sherlock P值 | 0.859 |
| 胎儿β | 0.185 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
| 支持 | G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS G2CDB.HUMAN_MITOCHONDRIA COMPOSITESET |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG02562809 | 3 | 193311018 | OPA1 | 3.6e-9 | -0.007 | 2.32E-6 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS10994209 | Chr10 | 61877705 | OPA1 | 4976 | 0.19 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| GPR183 | 0.63 | 0.32 |
| CD69 | 0.60 | 0.23 |
| IL1B | 0.58 | 0.24 |
| S100A9 | 0.58 | 0.26 |
| CCL3 | 0.57 | 0.48 |
| C5AR1 | 0.56 | 0.44 |
| IL8 | 0.55 | 0.37 |
| RP11-208G20.1 | 0.52 | 0.25 |
| S100A8 | 0.52 | 0.23 |
| S100A12 | 0.51 | 0.21 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| GTF2H2 | -0.19 | -0.12 |
| anp32c | -0.17 | -0.11 |
| PCDHA9 | -0.16 | -0.06 |
| AL139819.3 | -0.16 | -0.17 |
| AC019043.1 | -0.16 | -0.15 |
| FAM21B | -0.16 | -0.01 |
| HRCT1 | -0.16 | -0.21 |
| grin2b | -0.16 | -0.09 |
| PLEC1 | -0.15 | -0.08 |
| AC004449.1 | -0.15 | -0.05 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
| 去：0000287 | 镁离子结合 | nas | 11017080 | |
| 去：0003924 | GTPase活性 | 塔斯 | 11017080 | |
| 去：0005525 | GTP结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0019896 | 线粒体的轴突运输 | 塔斯 | 轴突（GO术语级别：9） | 11017080 |
| 去：0000266 | 线粒体裂变 | 塔斯 | 12509422 | |
| 去：0008053 | 线粒体融合 | 塔斯 | 12509422 | |
| 去：0007605 | 声音的感官感知 | IEA | - | |
| 去：0007601 | 视觉感知 | 小鬼 | 11017080 | |
| 去：0007007 | 内部线粒体膜组织 | 艾达 | 12509422 | |
| 去：0006915 | 凋亡 | IEA | - | |
| GO：0050896 | 对刺激的反应 | IEA | - | |
| GO：0045768 | 抗凋亡的阳性调节 | 艾达 | 12509422 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0030425 | 树突 | ISS | 神经元，轴突，树突（GO期限：6） | 11847212 |
| 去：0005739 | 线粒体 | IEA | - | |
| 去：0005741 | 线粒体外膜 | 艾达 | 12504110 | |
| 去：0005758 | 线粒体膜间空间 | ISS | 11847212 | |
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
| 去：0030061 | 线粒体crista | 艾达 | 12504110 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Piccaluga血管免疫细胞淋巴瘤DN | 136 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Liu Sox4靶向DN | 309 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Slebos头和颈癌与HPV | 84 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Tien肠益生菌2小时DN | 88 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| tien肠益生菌24小时 | 557 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 洛克伍德在肺癌中放大 | 214 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kaab心脏中心与心室DN | 261 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病初期DN | 165 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由E2F4绑定的Marson未刺激 | 728 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 斯坦因·埃斯拉（Stein Esrra）瞄准 | 388 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马丁内斯RB1靶向 | 673 | 430 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez TP53靶向 | 602 | 364 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1和TP53靶向 | 601 | 369 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bonome卵巢癌的生存最佳逃亡 | 246 | 152 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mootha Human Mitodb 6 2002 | 429 | 260 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Stein Esrra目标 | 535 | 325 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PYEON CANCAR CANCAR HEAD和NECK与颈椎 | 193 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Johnstone Parvb目标2 DN | 336 | 211 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |