基因页:ATP5A1
Summary?
基因ID | 498 |
Symbol | ATP5A1 |
同义词 | ATP5A|ATP5AL2|ATPM|COXPD22|HEL-S-123m|MC5DN4|MOM2|OMR|ORM|hATP1 |
描述 | ATP合酶,H+运输,线粒体F1复合物,α亚基1,心肌 |
参考 | MIM:164360|HGNC:HGNC:823|ENSEMBL:ENSG00000152234|HPRD:01258|Vega:Otthumg00000132637 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 18Q21 |
Pascal P值 | 0.275 |
Sherlock P值 | 0.407 |
胎儿β | 0.711 |
主持人 | 元 |
支持 | G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS G2CDB.HUMAN_CLATHRIN G2CDB.HUMAN_MITOCHONDRIA G2Cdb.human_Synaptosome G2CDB.HUMAN_TAP-PSD-95核 G2Cdb.humanNRC g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP CompositeSet Darnell FMRP目标 |
基因in Data Sources
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
Literature | 高通量文献搜索 | Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenias | 点击显示详细信息 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ATP5A1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
DOCK1 | 0.83 | 0.78 |
myo6 | 0.81 | 0.78 |
ACSS3 | 0.80 | 0.78 |
PPAP2B | 0.80 | 0.82 |
PPARA | 0.80 | 0.76 |
BMPR1B | 0.80 | 0.72 |
aldh6a1 | 0.79 | 0.76 |
ATP13A4 | 0.79 | 0.67 |
MYO10 | 0.79 | 0.74 |
MSI2 | 0.78 | 0.79 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SLC26A4 | -0.44 | -0.46 |
AC011491.1 | -0.38 | -0.36 |
FAM19A1 | -0.37 | -0.33 |
AC093307.1 | -0.36 | -0.30 |
RTN4RL1 | -0.35 | -0.28 |
TTC9B | -0.35 | -0.37 |
gnrhr | -0.34 | -0.34 |
纳米3 | -0.34 | -0.35 |
ARHGAP20 | -0.34 | -0.27 |
RTN2 | -0.33 | -0.31 |
第三节。基因本体论注释
Molecular function | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 11410595 | |
去:0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
GO:0016820 | 水解酶活性,作用在酸酐上,催化物质的跨膜运动 | IEA | - | |
去:0005215 | 转运蛋白活性 | nas | 1830491 | |
GO:0016887 | ATPase活性 | 艾达 | 12110673 | |
GO:0042288 | MHC I类蛋白结合 | 艾达 | 17643490 | |
GO:0043499 | eukaryotic cell surface binding | 艾达 | 10077593 | |
去:0046933 | 氢离子转运ATP合酶活性,旋转机制 | IEA | - | |
GO:0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
去:0046961 | 氢离子运输ATPase活性,旋转机制 | IEA | - | |
Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0001937 | 内皮细胞增殖的负调节 | IMP | 10077593 | |
去:0006811 | 离子运输 | IEA | - | |
去:0015992 | 质子运输 | IEA | - | |
GO:0015986 | ATP合成耦合质子转运 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005739 | 线粒体 | TAS | 1830491 | |
去:0005753 | mitochondrial proton-transporting ATP synthase complex | 艾达 | 12110673 | |
去:0005759 | 线粒体基质 | EXP | 4517936 | |
去:0005886 | 质膜 | 艾达 | 10077593 | |
GO:0016469 | 质子传输两扇门ATPase复合物 | IEA | - | |
GO:0045261 | 质子传输ATP合酶复合物,催化核F(1) | IEA | - |
Section V. Pathway annotation
第六节。microRNA注释
miRNA family | 目标位置 | miRNA ID | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
miR-493-5p | 93 | 99 | M8 | HSA-MIR-493-5p | uuguacaugguaggcuuucauu |