Summary
基因ID 498
Symbol ATP5A1
同义词 ATP5A|ATP5AL2|ATPM|COXPD22|HEL-S-123m|MC5DN4|MOM2|OMR|ORM|hATP1
描述 ATP合酶,H+运输,线粒体F1复合物,α亚基1,心肌
参考 MIM:164360|HGNC:HGNC:823|ENSEMBL:ENSG00000152234|HPRD:01258|Vega:Otthumg00000132637
基因类型 蛋白质编码
地图位置 18Q21
Pascal P值 0.275
Sherlock P值 0.407
胎儿β 0.711
主持人
支持 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS
G2CDB.HUMAN_CLATHRIN
G2CDB.HUMAN_MITOCHONDRIA
G2Cdb.human_Synaptosome
G2CDB.HUMAN_TAP-PSD-95核
G2Cdb.humanNRC
g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP
CompositeSet
Darnell FMRP目标

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
Literature 高通量文献搜索 Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenias 点击显示详细信息

Section I. Genetics and epigenetics annotation


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
DOCK1 0.83 0.78
myo6 0.81 0.78
ACSS3 0.80 0.78
PPAP2B 0.80 0.82
PPARA 0.80 0.76
BMPR1B 0.80 0.72
aldh6a1 0.79 0.76
ATP13A4 0.79 0.67
MYO10 0.79 0.74
MSI2 0.78 0.79
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SLC26A4 -0.44 -0.46
AC011491.1 -0.38 -0.36
FAM19A1 -0.37 -0.33
AC093307.1 -0.36 -0.30
RTN4RL1 -0.35 -0.28
TTC9B -0.35 -0.37
gnrhr -0.34 -0.34
纳米3 -0.34 -0.35
ARHGAP20 -0.34 -0.27
RTN2 -0.33 -0.31

第三节。基因本体论注释

Molecular function 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IPI 11410595
去:0005524 ATP结合 IEA -
GO:0016820 水解酶活性,作用在酸酐上,催化物质的跨膜运动 IEA -
去:0005215 转运蛋白活性 nas 1830491
GO:0016887 ATPase活性 艾达 12110673
GO:0042288 MHC I类蛋白结合 艾达 17643490
GO:0043499 eukaryotic cell surface binding 艾达 10077593
去:0046933 氢离子转运ATP合酶活性,旋转机制 IEA -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
去:0046961 氢离子运输ATPase活性,旋转机制 IEA -
Biological process 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0001937 内皮细胞增殖的负调节 IMP 10077593
去:0006811 离子运输 IEA -
去:0015992 质子运输 IEA -
GO:0015986 ATP合成耦合质子转运 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005739 线粒体 TAS 1830491
去:0005753 mitochondrial proton-transporting ATP synthase complex 艾达 12110673
去:0005759 线粒体基质 EXP 4517936
去:0005886 质膜 艾达 10077593
GO:0016469 质子传输两扇门ATPase复合物 IEA -
GO:0045261 质子传输ATP合酶复合物,催化核F(1) IEA -

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG氧化磷酸化 135 73 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kegg阿尔茨海默氏病 169 110 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kegg帕金森氏病 133 78 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kegg Huntingtons病 185 109 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BIOCARTA ETC PATHWAY 12 7 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome TCA循环和呼吸电子传输 141 85 All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组线粒体蛋白进口 58 24 All SZGR 2.0 genes in this pathway
蛋白质的反应组代谢 518 242 All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组呼吸电子传输ATP通过化学含量耦合和热量产生通过解偶联蛋白来合成 98 56 All SZGR 2.0 genes in this pathway
通过化学含量耦合对ATP的反应组形成 16 9 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BORCZUK MALIGNANT MESOTHELIOMA UP 305 185 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dittmer Pthlh靶向 112 68 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Odonnell TFRC靶向 456 228 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ENK UV RESPONSE KERATINOCYTE UP 530 342 All SZGR 2.0 genes in this pathway
McBryan Pubertal乳房5 6WK DN 137 97 All SZGR 2.0 genes in this pathway
McBryan Pubertal乳房6 7WK UP 197 135 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LUI甲状腺癌PAX8 PPARG DN 45 29 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Choi ATL阶段预测变量 44 24 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LUI THYROID CANCER CLUSTER 3 28 16 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PAX8 PPARG融合的LUI目标 34 23 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pujana ATM PCC网络 1442 892 All SZGR 2.0 genes in this pathway
里克曼肿瘤区分良好,而不是很差 236 139 All SZGR 2.0 genes in this pathway
宁慢性阻塞性肺疾病DN 121 79 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SANA TNF信号DN 90 57 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Flechner PBL肾脏移植OK vs捐助者 151 100 All SZGR 2.0 genes in this pathway
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SASAKI ADULT T CELL LEUKEMIA 176 122 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Cromer转移DN 81 58 All SZGR 2.0 genes in this pathway
lu衰老的脑dn 153 120 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 All SZGR 2.0 genes in this pathway
罗德韦尔衰老肾脏无血DN 150 93 All SZGR 2.0 genes in this pathway
JI对FSH DN的响应 58 43 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KAYO AGING MUSCLE DN 123 76 All SZGR 2.0 genes in this pathway
罗德韦尔老化的肾脏DN 145 88 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kaab心脏中心与心室DN 261 183 All SZGR 2.0 genes in this pathway
dazard对UV SCC的反应 123 75 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿塞维多肝癌DN 540 340 All SZGR 2.0 genes in this pathway
王肿瘤的侵入性 374 247 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mootha PGC 420 269 All SZGR 2.0 genes in this pathway
AGUIRRE PANCREATIC CANCER COPY NUMBER DN 238 145 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hsiao家政基因 389 245 All SZGR 2.0 genes in this pathway
APC和MBD2的Phesse目标 20 14 All SZGR 2.0 genes in this pathway
双龙雷帕霉素通过TSC1和TSC2敏感 73 37 All SZGR 2.0 genes in this pathway
FEVR CTNNB1靶向 682 433 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

miRNA family 目标位置 miRNA ID mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
miR-493-5p 93 99 M8 HSA-MIR-493-5p uuguacaugguaggcuuucauu