基因页:tnfrsf11b
概括?
基因 | 4982 |
象征 | tnfrsf11b |
同义词 | OCIF | OPG | PDB5 | TR1 |
描述 | 肿瘤坏死因子受体超家族成员11B |
参考 | MIM:602643|HGNC:HGNC:11909|ENSEMBL:ENSG00000164761|HPRD:04032|Vega:Otthumg00000164969 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 8Q24 |
Pascal P值 | 0.197 |
胎儿β | -0.652 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
简历:Phewas | 全球整个关联研究(PHEWAS) | 157个与精神分裂症相关的SNP | 3 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
简历:Phewas
SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
RS6993813 | 8 | 120052238 | 无效的 | 0.6515 | tnfrsf11b | 无效的 | |
RS4355801 | 8 | 119923873 | 无效的 | 0.6482 | tnfrsf11b | 无效的 | |
RS6469804 | 8 | 120044829 | 无效的 | 0.6666 | tnfrsf11b | 无效的 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS17131472 | CHR1 | 91962966 | tnfrsf11b | 4982 | 2.161E-4 | 反式 | ||
RS546975 | CHR1 | 91963738 | tnfrsf11b | 4982 | 0.02 | 反式 | ||
RS17535450 | CHR2 | 39900012 | tnfrsf11b | 4982 | 0.01 | 反式 | ||
RS272110 | CHR2 | 131546319 | tnfrsf11b | 4982 | 0.18 | 反式 | ||
RS9814206 | CHR3 | 74573226 | tnfrsf11b | 4982 | 0.11 | 反式 | ||
RS1691463 | CHR3 | 84914366 | tnfrsf11b | 4982 | 0.01 | 反式 | ||
RS394185 | CHR3 | 84959076 | tnfrsf11b | 4982 | 0.09 | 反式 | ||
RS9288980 | CHR3 | 112964991 | tnfrsf11b | 4982 | 0.16 | 反式 | ||
RS3995908 | CHR3 | 112998529 | tnfrsf11b | 4982 | 0.16 | 反式 | ||
RS7652801 | CHR3 | 113008605 | tnfrsf11b | 4982 | 0.16 | 反式 | ||
RS2922180 | CHR3 | 125280472 | tnfrsf11b | 4982 | 7.331E-10 | 反式 | ||
RS2971271 | CHR3 | 125450402 | tnfrsf11b | 4982 | 0.01 | 反式 | ||
RS2976809 | CHR3 | 125451738 | tnfrsf11b | 4982 | 2.874E-6 | 反式 | ||
RS9917710 | CHR3 | 176280218 | tnfrsf11b | 4982 | 0.18 | 反式 | ||
RS16889842 | CHR4 | 9872012 | tnfrsf11b | 4982 | 0.03 | 反式 | ||
SNP_A-1976228 | 0 | tnfrsf11b | 4982 | 0.13 | 反式 | |||
SNP_A-2065799 | 0 | tnfrsf11b | 4982 | 0.06 | 反式 | |||
RS6856952 | CHR4 | 74394402 | tnfrsf11b | 4982 | 0.06 | 反式 | ||
RS17005214 | CHR4 | 82845432 | tnfrsf11b | 4982 | 0.06 | 反式 | ||
RS2732167 | CHR4 | 88706292 | tnfrsf11b | 4982 | 0.17 | 反式 | ||
RS313946 | CHR4 | 113975904 | tnfrsf11b | 4982 | 0.07 | 反式 | ||
RS17034860 | CHR4 | 135177933 | tnfrsf11b | 4982 | 0.14 | 反式 | ||
RS17636193 | CHR5 | 3540160 | tnfrsf11b | 4982 | 0.09 | 反式 | ||
RS1867710 | CHR5 | 3576228 | tnfrsf11b | 4982 | 0.15 | 反式 | ||
RS11747698 | CHR5 | 3577007 | tnfrsf11b | 4982 | 0.15 | 反式 | ||
RS13174189 | CHR5 | 3579173 | tnfrsf11b | 4982 | 0.19 | 反式 | ||
RS13187916 | CHR5 | 3580498 | tnfrsf11b | 4982 | 0.15 | 反式 | ||
RS13170862 | CHR5 | 3582215 | tnfrsf11b | 4982 | 0.15 | 反式 | ||
RS10050805 | CHR5 | 30805352 | tnfrsf11b | 4982 | 0 | 反式 | ||
RS837115 | CHR5 | 40736290 | tnfrsf11b | 4982 | 0.03 | 反式 | ||
RS16894149 | CHR5 | 61013724 | tnfrsf11b | 4982 | 0.1 | 反式 | ||
RS17143695 | CHR5 | 117520843 | tnfrsf11b | 4982 | 0.06 | 反式 | ||
RS11954814 | CHR5 | 155088338 | tnfrsf11b | 4982 | 0.2 | 反式 | ||
RS17056435 | CHR5 | 158453782 | tnfrsf11b | 4982 | 0.02 | 反式 | ||
RS17135501 | CHR6 | 2704474 | tnfrsf11b | 4982 | 0.04 | 反式 | ||
RS17135521 | CHR6 | 2707631 | tnfrsf11b | 4982 | 0.04 | 反式 | ||
SNP_A-1787926 | 0 | tnfrsf11b | 4982 | 0.04 | 反式 | |||
RS6920042 | CHR6 | 67907570 | tnfrsf11b | 4982 | 0.14 | 反式 | ||
RS6939897 | CHR6 | 67913123 | tnfrsf11b | 4982 | 0.14 | 反式 | ||
RS6455226 | CHR6 | 67930295 | tnfrsf11b | 4982 | 6.269E-4 | 反式 | ||
RS2064428 | CHR6 | 85067126 | tnfrsf11b | 4982 | 0.01 | 反式 | ||
RS9451867 | CHR6 | 92659609 | tnfrsf11b | 4982 | 0.01 | 反式 | ||
RS283058 | CHR6 | 118625224 | tnfrsf11b | 4982 | 0.14 | 反式 | ||
RS2398707 | CHR7 | 2113428 | tnfrsf11b | 4982 | 0.03 | 反式 | ||
RS3778948 | CHR7 | 2123290 | tnfrsf11b | 4982 | 0.09 | 反式 | ||
RS3778951 | CHR7 | 2125319 | tnfrsf11b | 4982 | 0.03 | 反式 | ||
RS3778957 | CHR7 | 2127710 | tnfrsf11b | 4982 | 0.03 | 反式 | ||
RS3778958 | CHR7 | 2127794 | tnfrsf11b | 4982 | 0.09 | 反式 | ||
RS3778968 | CHR7 | 2139903 | tnfrsf11b | 4982 | 0.09 | 反式 | ||
RS2286089 | CHR7 | 38789903 | tnfrsf11b | 4982 | 0.11 | 反式 | ||
RS10085487 | CHR7 | 38870379 | tnfrsf11b | 4982 | 0.06 | 反式 | ||
RS7782277 | CHR7 | 38938053 | tnfrsf11b | 4982 | 0.16 | 反式 | ||
RS2430483 | CHR7 | 104548631 | tnfrsf11b | 4982 | 0.02 | 反式 | ||
RS1960369 | CHR8 | 6379235 | tnfrsf11b | 4982 | 0.1 | 反式 | ||
RS2199402 | CHR8 | 9201002 | tnfrsf11b | 4982 | 0.02 | 反式 | ||
RS2169384 | CHR8 | 9216985 | tnfrsf11b | 4982 | 0.06 | 反式 | ||
RS1381350 | CHR8 | 9217194 | tnfrsf11b | 4982 | 0.17 | 反式 | ||
RS7841407 | CHR8 | 9243427 | tnfrsf11b | 4982 | 0 | 反式 | ||
RS2739708 | CHR8 | 17992280 | tnfrsf11b | 4982 | 0.01 | 反式 | ||
RS714131 | CHR8 | 17992832 | tnfrsf11b | 4982 | 0.02 | 反式 | ||
RS2739726 | CHR8 | 17998576 | tnfrsf11b | 4982 | 0.02 | 反式 | ||
RS2919377 | CHR8 | 32573740 | tnfrsf11b | 4982 | 0.04 | 反式 | ||
RS9410375 | Chr9 | 91444622 | tnfrsf11b | 4982 | 0.06 | 反式 | ||
RS2253777 | Chr9 | 93467893 | tnfrsf11b | 4982 | 0.02 | 反式 | ||
RS4743989 | Chr9 | 97859191 | tnfrsf11b | 4982 | 0.13 | 反式 | ||
RS998410 | Chr9 | 117622673 | tnfrsf11b | 4982 | 0.06 | 反式 | ||
RS9423711 | Chr10 | 2574802 | tnfrsf11b | 4982 | 0.03 | 反式 | ||
RS651134 | Chr10 | 27549960 | tnfrsf11b | 4982 | 0.17 | 反式 | ||
RS748375 | Chr10 | 33440178 | tnfrsf11b | 4982 | 0.07 | 反式 | ||
RS4514358 | Chr10 | 43861923 | tnfrsf11b | 4982 | 0.05 | 反式 | ||
RS7081666 | Chr10 | 47673800 | tnfrsf11b | 4982 | 0.01 | 反式 | ||
RS10886877 | Chr10 | 85425690 | tnfrsf11b | 4982 | 0.03 | 反式 | ||
RS10488758 | Chr11 | 103493095 | tnfrsf11b | 4982 | 0.04 | 反式 | ||
RS1905067 | Chr11 | 103493989 | tnfrsf11b | 4982 | 0.01 | 反式 | ||
RS10895512 | Chr11 | 103553194 | tnfrsf11b | 4982 | 0.04 | 反式 | ||
RS11604394 | Chr11 | 103554879 | tnfrsf11b | 4982 | 0.02 | 反式 | ||
RS11603978 | Chr11 | 103555057 | tnfrsf11b | 4982 | 0.02 | 反式 | ||
RS11225972 | Chr11 | 103555992 | tnfrsf11b | 4982 | 0.02 | 反式 | ||
RS11225974 | Chr11 | 103560499 | tnfrsf11b | 4982 | 0.02 | 反式 | ||
RS11225990 | Chr11 | 103608380 | tnfrsf11b | 4982 | 0.04 | 反式 | ||
RS10747972 | 0 | tnfrsf11b | 4982 | 0.08 | 反式 | |||
RS10879027 | CHR12 | 70237156 | tnfrsf11b | 4982 | 2.689E-4 | 反式 | ||
RS11112163 | CHR12 | 105072508 | tnfrsf11b | 4982 | 0 | 反式 | ||
RS9551590 | CHR13 | 29589464 | tnfrsf11b | 4982 | 0.05 | 反式 | ||
RS17073665 | CHR13 | 81541961 | tnfrsf11b | 4982 | 0 | 反式 | ||
RS11840833 | CHR13 | 94378306 | tnfrsf11b | 4982 | 0.02 | 反式 | ||
RS16975617 | CHR13 | 110867407 | tnfrsf11b | 4982 | 0.09 | 反式 | ||
RS10142086 | CHR14 | 35135892 | tnfrsf11b | 4982 | 0.02 | 反式 | ||
RS1951867 | CHR14 | 54407191 | tnfrsf11b | 4982 | 0.01 | 反式 | ||
RS2093759 | CHR14 | 97171024 | tnfrsf11b | 4982 | 0 | 反式 | ||
RS17244419 | CHR14 | 97171074 | tnfrsf11b | 4982 | 5.97E-5 | 反式 | ||
RS17629301 | CHR14 | 99467034 | tnfrsf11b | 4982 | 0.05 | 反式 | ||
RS7177212 | CHR15 | 34425413 | tnfrsf11b | 4982 | 0.11 | 反式 | ||
RS16976022 | CHR15 | 55454260 | tnfrsf11b | 4982 | 0.19 | 反式 | ||
RS16976029 | CHR15 | 55455268 | tnfrsf11b | 4982 | 0.17 | 反式 | ||
RS16976036 | CHR15 | 55456921 | tnfrsf11b | 4982 | 0.13 | 反式 | ||
RS8034402 | CHR15 | 55480932 | tnfrsf11b | 4982 | 0.02 | 反式 | ||
RS8043029 | CHR15 | 55486010 | tnfrsf11b | 4982 | 0.02 | 反式 | ||
RS3809540 | CHR15 | 55489411 | tnfrsf11b | 4982 | 0.02 | 反式 | ||
RS7165491 | CHR15 | 55500454 | tnfrsf11b | 4982 | 0.18 | 反式 | ||
RS7165622 | CHR15 | 93979910 | tnfrsf11b | 4982 | 0.19 | 反式 | ||
RS4984405 | CHR15 | 95260170 | tnfrsf11b | 4982 | 0.14 | 反式 | ||
RS13380712 | CHR16 | 25601181 | tnfrsf11b | 4982 | 0.05 | 反式 | ||
RS16977927 | CHR17 | 72154232 | tnfrsf11b | 4982 | 0.08 | 反式 | ||
RS7236104 | CHR18 | 14032818 | tnfrsf11b | 4982 | 0.18 | 反式 | ||
RS4987765 | CHR18 | 60905021 | tnfrsf11b | 4982 | 0.12 | 反式 | ||
RS11873703 | CHR18 | 61448702 | tnfrsf11b | 4982 | 0 | 反式 | ||
RS6017989 | CHR20 | 45329846 | tnfrsf11b | 4982 | 0.19 | 反式 | ||
RS6095741 | CHR20 | 48666589 | tnfrsf11b | 4982 | 6e-7 | 反式 | ||
RS5991662 | Chrx | 43335796 | tnfrsf11b | 4982 | 0.01 | 反式 | ||
RS2254586 | Chrx | 117855503 | tnfrsf11b | 4982 | 0.14 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TNFRSF11B_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG细胞因子细胞因子受体相互作用 | 267 | 161 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP | 408 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Piepoli LGI1靶向 | 15 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
thum收缩性心力衰竭 | 423 | 283 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC1靶向 | 457 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC1和HDAC2靶向 | 238 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC2靶向 | 114 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC3靶向 | 501 | 327 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nagashima NRG1信号向上发出 | 176 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nagashima EGF信号向上 | 58 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim WT1靶向12小时 | 162 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌变性DN | 537 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gozgit ESR1靶向DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌DN | 232 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
chebotaev gr目标dn | 120 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶向F | 185 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Berenjeno由Rhoa DN转变 | 394 | 258 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hernandez异常有丝分裂构成多维克尔4nm | 23 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
埃尔南德斯有丝分裂逮捕Docetaxel 1 Up | 36 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
真菌IL2信号2 | 12 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
具有STAT5结合位点的真菌IL2目标T1 | 9 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
留置权乳腺癌化生型与导管 | 83 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SASAI对肿瘤转移的耐药性 | 50 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼头颈癌 | 100 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌8Q23 Q24 AMPLICON | 157 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rozanov MMP14目标子集 | 33 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rozanov MMP14靶向 | 266 | 171 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Willert Wnt信令 | 24 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn | 546 | 351 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 | 555 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
康(Kang)因tert而永生 | 89 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN | 408 | 274 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病初期 | 390 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang Smarce1靶向DN | 371 | 218 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bandres对Carmustin Mgmt 24小时DN的响应 | 33 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
大脑衰老 | 262 | 186 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染18小时DN | 178 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德韦尔老化的肾脏没有血液 | 222 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德韦尔老化的肾脏 | 487 | 303 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
衰老中间 | 14 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stein Esrra靶向DN | 105 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
de yy1靶向DN | 92 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
骨骼DN中的Smid乳腺癌复发 | 315 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SMID乳腺癌腔B DN | 564 | 326 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞培养与新鲜 | 425 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TSAI对放射治疗的反应 | 32 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindstedt树突状细胞成熟C | 69 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 | 356 | 214 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stein Esrra目标 | 535 | 325 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
中村脂肪形成早期DN | 38 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍夫曼时钟定位 | 11 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sasson对促性腺营养蛋白DN的反应 | 87 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sasson对Forskolin DN的反应 | 88 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
li诱导了自然杀手 | 307 | 182 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 | 549 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 ETS融合DN的Miyagawa目标 | 229 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Plasari TGFB1靶向10小时 | 199 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
基础质量靶标 | 27 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delacroix Rarg Bound MEF | 367 | 231 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delacroix RAR目标 | 48 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fortschegger PHF8靶向 | 279 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pedrioli mir31靶向 | 221 | 120 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过p38完成的phong TNF响应 | 227 | 151 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |