概括
基因 4982
象征 tnfrsf11b
同义词 OCIF | OPG | PDB5 | TR1
描述 肿瘤坏死因子受体超家族成员11B
参考 MIM:602643|HGNC:HGNC:11909|ENSEMBL:ENSG00000164761|HPRD:04032|Vega:Otthumg00000164969
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8Q24
Pascal P值 0.197
胎儿β -0.652
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
简历:Phewas 全球整个关联研究(PHEWAS) 157个与精神分裂症相关的SNP 3

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历:Phewas

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离
RS6993813 8 120052238 无效的 0.6515 tnfrsf11b 无效的
RS4355801 8 119923873 无效的 0.6482 tnfrsf11b 无效的
RS6469804 8 120044829 无效的 0.6666 tnfrsf11b 无效的

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17131472 CHR1 91962966 tnfrsf11b 4982 2.161E-4 反式
RS546975 CHR1 91963738 tnfrsf11b 4982 0.02 反式
RS17535450 CHR2 39900012 tnfrsf11b 4982 0.01 反式
RS272110 CHR2 131546319 tnfrsf11b 4982 0.18 反式
RS9814206 CHR3 74573226 tnfrsf11b 4982 0.11 反式
RS1691463 CHR3 84914366 tnfrsf11b 4982 0.01 反式
RS394185 CHR3 84959076 tnfrsf11b 4982 0.09 反式
RS9288980 CHR3 112964991 tnfrsf11b 4982 0.16 反式
RS3995908 CHR3 112998529 tnfrsf11b 4982 0.16 反式
RS7652801 CHR3 113008605 tnfrsf11b 4982 0.16 反式
RS2922180 CHR3 125280472 tnfrsf11b 4982 7.331E-10 反式
RS2971271 CHR3 125450402 tnfrsf11b 4982 0.01 反式
RS2976809 CHR3 125451738 tnfrsf11b 4982 2.874E-6 反式
RS9917710 CHR3 176280218 tnfrsf11b 4982 0.18 反式
RS16889842 CHR4 9872012 tnfrsf11b 4982 0.03 反式
SNP_A-1976228 0 tnfrsf11b 4982 0.13 反式
SNP_A-2065799 0 tnfrsf11b 4982 0.06 反式
RS6856952 CHR4 74394402 tnfrsf11b 4982 0.06 反式
RS17005214 CHR4 82845432 tnfrsf11b 4982 0.06 反式
RS2732167 CHR4 88706292 tnfrsf11b 4982 0.17 反式
RS313946 CHR4 113975904 tnfrsf11b 4982 0.07 反式
RS17034860 CHR4 135177933 tnfrsf11b 4982 0.14 反式
RS17636193 CHR5 3540160 tnfrsf11b 4982 0.09 反式
RS1867710 CHR5 3576228 tnfrsf11b 4982 0.15 反式
RS11747698 CHR5 3577007 tnfrsf11b 4982 0.15 反式
RS13174189 CHR5 3579173 tnfrsf11b 4982 0.19 反式
RS13187916 CHR5 3580498 tnfrsf11b 4982 0.15 反式
RS13170862 CHR5 3582215 tnfrsf11b 4982 0.15 反式
RS10050805 CHR5 30805352 tnfrsf11b 4982 0 反式
RS837115 CHR5 40736290 tnfrsf11b 4982 0.03 反式
RS16894149 CHR5 61013724 tnfrsf11b 4982 0.1 反式
RS17143695 CHR5 117520843 tnfrsf11b 4982 0.06 反式
RS11954814 CHR5 155088338 tnfrsf11b 4982 0.2 反式
RS17056435 CHR5 158453782 tnfrsf11b 4982 0.02 反式
RS17135501 CHR6 2704474 tnfrsf11b 4982 0.04 反式
RS17135521 CHR6 2707631 tnfrsf11b 4982 0.04 反式
SNP_A-1787926 0 tnfrsf11b 4982 0.04 反式
RS6920042 CHR6 67907570 tnfrsf11b 4982 0.14 反式
RS6939897 CHR6 67913123 tnfrsf11b 4982 0.14 反式
RS6455226 CHR6 67930295 tnfrsf11b 4982 6.269E-4 反式
RS2064428 CHR6 85067126 tnfrsf11b 4982 0.01 反式
RS9451867 CHR6 92659609 tnfrsf11b 4982 0.01 反式
RS283058 CHR6 118625224 tnfrsf11b 4982 0.14 反式
RS2398707 CHR7 2113428 tnfrsf11b 4982 0.03 反式
RS3778948 CHR7 2123290 tnfrsf11b 4982 0.09 反式
RS3778951 CHR7 2125319 tnfrsf11b 4982 0.03 反式
RS3778957 CHR7 2127710 tnfrsf11b 4982 0.03 反式
RS3778958 CHR7 2127794 tnfrsf11b 4982 0.09 反式
RS3778968 CHR7 2139903 tnfrsf11b 4982 0.09 反式
RS2286089 CHR7 38789903 tnfrsf11b 4982 0.11 反式
RS10085487 CHR7 38870379 tnfrsf11b 4982 0.06 反式
RS7782277 CHR7 38938053 tnfrsf11b 4982 0.16 反式
RS2430483 CHR7 104548631 tnfrsf11b 4982 0.02 反式
RS1960369 CHR8 6379235 tnfrsf11b 4982 0.1 反式
RS2199402 CHR8 9201002 tnfrsf11b 4982 0.02 反式
RS2169384 CHR8 9216985 tnfrsf11b 4982 0.06 反式
RS1381350 CHR8 9217194 tnfrsf11b 4982 0.17 反式
RS7841407 CHR8 9243427 tnfrsf11b 4982 0 反式
RS2739708 CHR8 17992280 tnfrsf11b 4982 0.01 反式
RS714131 CHR8 17992832 tnfrsf11b 4982 0.02 反式
RS2739726 CHR8 17998576 tnfrsf11b 4982 0.02 反式
RS2919377 CHR8 32573740 tnfrsf11b 4982 0.04 反式
RS9410375 Chr9 91444622 tnfrsf11b 4982 0.06 反式
RS2253777 Chr9 93467893 tnfrsf11b 4982 0.02 反式
RS4743989 Chr9 97859191 tnfrsf11b 4982 0.13 反式
RS998410 Chr9 117622673 tnfrsf11b 4982 0.06 反式
RS9423711 Chr10 2574802 tnfrsf11b 4982 0.03 反式
RS651134 Chr10 27549960 tnfrsf11b 4982 0.17 反式
RS748375 Chr10 33440178 tnfrsf11b 4982 0.07 反式
RS4514358 Chr10 43861923 tnfrsf11b 4982 0.05 反式
RS7081666 Chr10 47673800 tnfrsf11b 4982 0.01 反式
RS10886877 Chr10 85425690 tnfrsf11b 4982 0.03 反式
RS10488758 Chr11 103493095 tnfrsf11b 4982 0.04 反式
RS1905067 Chr11 103493989 tnfrsf11b 4982 0.01 反式
RS10895512 Chr11 103553194 tnfrsf11b 4982 0.04 反式
RS11604394 Chr11 103554879 tnfrsf11b 4982 0.02 反式
RS11603978 Chr11 103555057 tnfrsf11b 4982 0.02 反式
RS11225972 Chr11 103555992 tnfrsf11b 4982 0.02 反式
RS11225974 Chr11 103560499 tnfrsf11b 4982 0.02 反式
RS11225990 Chr11 103608380 tnfrsf11b 4982 0.04 反式
RS10747972 0 tnfrsf11b 4982 0.08 反式
RS10879027 CHR12 70237156 tnfrsf11b 4982 2.689E-4 反式
RS11112163 CHR12 105072508 tnfrsf11b 4982 0 反式
RS9551590 CHR13 29589464 tnfrsf11b 4982 0.05 反式
RS17073665 CHR13 81541961 tnfrsf11b 4982 0 反式
RS11840833 CHR13 94378306 tnfrsf11b 4982 0.02 反式
RS16975617 CHR13 110867407 tnfrsf11b 4982 0.09 反式
RS10142086 CHR14 35135892 tnfrsf11b 4982 0.02 反式
RS1951867 CHR14 54407191 tnfrsf11b 4982 0.01 反式
RS2093759 CHR14 97171024 tnfrsf11b 4982 0 反式
RS17244419 CHR14 97171074 tnfrsf11b 4982 5.97E-5 反式
RS17629301 CHR14 99467034 tnfrsf11b 4982 0.05 反式
RS7177212 CHR15 34425413 tnfrsf11b 4982 0.11 反式
RS16976022 CHR15 55454260 tnfrsf11b 4982 0.19 反式
RS16976029 CHR15 55455268 tnfrsf11b 4982 0.17 反式
RS16976036 CHR15 55456921 tnfrsf11b 4982 0.13 反式
RS8034402 CHR15 55480932 tnfrsf11b 4982 0.02 反式
RS8043029 CHR15 55486010 tnfrsf11b 4982 0.02 反式
RS3809540 CHR15 55489411 tnfrsf11b 4982 0.02 反式
RS7165491 CHR15 55500454 tnfrsf11b 4982 0.18 反式
RS7165622 CHR15 93979910 tnfrsf11b 4982 0.19 反式
RS4984405 CHR15 95260170 tnfrsf11b 4982 0.14 反式
RS13380712 CHR16 25601181 tnfrsf11b 4982 0.05 反式
RS16977927 CHR17 72154232 tnfrsf11b 4982 0.08 反式
RS7236104 CHR18 14032818 tnfrsf11b 4982 0.18 反式
RS4987765 CHR18 60905021 tnfrsf11b 4982 0.12 反式
RS11873703 CHR18 61448702 tnfrsf11b 4982 0 反式
RS6017989 CHR20 45329846 tnfrsf11b 4982 0.19 反式
RS6095741 CHR20 48666589 tnfrsf11b 4982 6e-7 反式
RS5991662 Chrx 43335796 tnfrsf11b 4982 0.01 反式
RS2254586 Chrx 117855503 tnfrsf11b 4982 0.14 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG细胞因子细胞因子受体相互作用 267 161 该途径中的所有SZGR 2.0基因
家长mtor信号向上 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP 408 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Piepoli LGI1靶向 15 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
thum收缩性心力衰竭 423 283 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1靶向 457 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1和HDAC2靶向 238 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC2靶向 114 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nagashima NRG1信号向上发出 176 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nagashima EGF信号向上 58 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向12小时 162 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌变性DN 537 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌DN 232 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chebotaev gr目标dn 120 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向F 185 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Berenjeno由Rhoa DN转变 394 258 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hernandez异常有丝分裂构成多维克尔4nm 23 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
埃尔南德斯有丝分裂逮捕Docetaxel 1 Up 36 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
真菌IL2信号2 12 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
具有STAT5结合位点的真菌IL2目标T1 9 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
留置权乳腺癌化生型与导管 83 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SASAI对肿瘤转移的耐药性 50 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
buytaert光动力疗法压力 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼头颈癌 100 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌8Q23 Q24 AMPLICON 157 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rozanov MMP14目标子集 33 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rozanov MMP14靶向 266 171 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Willert Wnt信令 24 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
康(Kang)因tert而永生 89 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN 408 274 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病初期 390 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Smarce1靶向DN 371 218 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bandres对Carmustin Mgmt 24小时DN的响应 33 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
大脑衰老 262 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染18小时DN 178 121 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏没有血液 222 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏 487 303 该途径中的所有SZGR 2.0基因
衰老中间 14 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra靶向DN 105 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
de yy1靶向DN 92 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
骨骼DN中的Smid乳腺癌复发 315 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID乳腺癌腔B DN 564 326 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TSAI对放射治疗的反应 32 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindstedt树突状细胞成熟C 69 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 356 214 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村脂肪形成早期DN 38 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍夫曼时钟定位 11 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sasson对促性腺营养蛋白DN的反应 87 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sasson对Forskolin DN的反应 88 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
li诱导了自然杀手 307 182 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 549 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 ETS融合DN的Miyagawa目标 229 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1靶向10小时 199 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
基础质量靶标 27 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rarg Bound MEF 367 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix RAR目标 48 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向 279 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pedrioli mir31靶向 221 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过p38完成的phong TNF响应 227 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因