基因页：OPHN1
概括？
| 基因 | 4983 |
| 象征 | OPHN1 |
| 同义词 | arhgap41 | mrx60 | opn1 |
| 描述 | 寡素1 |
| 参考 | MIM：300127|HGNC：HGNC：8148|ENSEMBL：ENSG00000079482|HPRD：02130|Vega：Otthumg00000021744 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | XQ12 |
| 胎儿β | 0.55 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | 潜在的突触基因 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中：2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS2768571 | Chrx | 67258888 | OPHN1 | 4983 | 0.14 | 顺式 | ||
| RS4852316 | CHR2 | 73919657 | OPHN1 | 4983 | 0.13 | 反式 | ||
| RS17350056 | CHR2 | 73922876 | OPHN1 | 4983 | 0.18 | 反式 | ||
| RS12052539 | CHR2 | 73937152 | OPHN1 | 4983 | 0.12 | 反式 | ||
| RS17350188 | CHR2 | 73964841 | OPHN1 | 4983 | 0.1 | 反式 | ||
| RS12624267 | CHR2 | 73986930 | OPHN1 | 4983 | 0.14 | 反式 | ||
| RS9875049 | CHR3 | 56457469 | OPHN1 | 4983 | 0.09 | 反式 | ||
| RS1665659 | Chr10 | 118448297 | OPHN1 | 4983 | 0.18 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| tal1 | 0.87 | 0.16 |
| MAB21L1 | 0.85 | 0.48 |
| KLK10 | 0.84 | 0.21 |
| ano2 | 0.84 | 0.33 |
| SP5 | 0.83 | 0.27 |
| MC4R | 0.81 | 0.17 |
| MAP4K1 | 0.80 | 0.26 |
| lef1 | 0.79 | 0.21 |
| LMO1 | 0.78 | 0.41 |
| CEACAM21 | 0.78 | 0.18 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| SLC26A4 | -0.22 | -0.30 |
| BAIAP2 | -0.22 | -0.22 |
| cacng3 | -0.20 | -0.41 |
| C20ORF39 | -0.20 | -0.15 |
| C1orf115 | -0.19 | -0.29 |
| KIAA1614 | -0.19 | 0.01 |
| GTDC1 | -0.19 | -0.01 |
| pik3ip1 | -0.19 | -0.24 |
| SPARCL1 | -0.19 | -0.52 |
| KCNJ4 | -0.18 | -0.39 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005100 | Rho GTPase激活剂活性 | 塔斯 | 9582072 | |
| 去：0003779 | 肌动蛋白结合 | IEA | - | |
| 去：0005096 | GTPase激活剂活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007411 | 轴突指导 | 塔斯 | Axon（GO期限：13） | 9582072 |
| 去：0007399 | 神经系统的发展 | 塔斯 | 神经突（GO期限：5） | 9582072 |
| 去：0007165 | 信号转导 | 塔斯 | 9582072 | |
| 去：0006930 | 底物结合的细胞迁移，细胞扩展 | 塔斯 | 9582072 | |
| 去：0030036 | 肌动蛋白细胞骨架组织 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005622 | 细胞内 | IEA | - | |
| 去：0005634 | 核 | 艾达 | 18029348 | |
| 去：0005737 | 细胞质 | 艾达 | 18029348 | |
| 去：0005886 | 质膜 | 艾达 | 18029348 | |
| GO：0015629 | 肌动蛋白细胞骨架 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Biocarta Rho途径 | 32 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| pid rhoa reg途径 | 46 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rho GTPases的Reactome信号传导 | 113 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gary CD5目标 | 473 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mattioli Mgus vs PCL | 116 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 | 479 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Koyama Sema3b靶向 | 292 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chang Pou5f1目标 | 15 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 斯托西对雌二醇的反应 | 50 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Xu GH1自分泌目标 | 268 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rizki肿瘤侵入性3D DN | 270 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Acevedo肝癌，H3K27me3 UP | 295 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染30分钟DN | 150 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |