基因页面:OPRM1
总结吗?
GeneID | 4988年 |
象征 | OPRM1 |
同义词 | LMOR | M-OR-1 |拖把|铁道部| MOR1 | OPRM |
描述 | 阿片受体,μ1 |
参考 | MIM: 600018|HGNC: HGNC: 8156|运用:ENSG00000112038|HPRD: 02484|织女:OTTHUMG00000015870 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 6 q24-q25 |
帕斯卡假定值 | 0.42 |
胎儿β | -0.415 |
eGene | 小脑 迈尔斯的顺式和反式 |
支持 | GPCR信号 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
ADT: Sun_2012 | 系统的抗精神病药物及其目标的调查 | 共有382个药物协会涉及43个抗精神病药物和49目标基因。 | |
简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,神经 | 点击显示详细信息 |
GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:1 | |
网络 | 最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络 | 贡献在PPI网络最短路径:0.006 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs10994209 | chr10 | 61877705 | OPRM1 | 4988年 | 0.13 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/OPRM1_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
前10名中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AVP | 1.00 | 0.27 |
HCRT | 1.00 | 0.08 |
PMCH | 0.99 | -0.01 |
TMEM190 | 0.98 | 0.05 |
FMO3 | 0.95 | 0.05 |
TMEM146 | 0.94 | -0.02 |
FAM81B | 0.94 | -0.00 |
WDR38 | 0.93 | 0.05 |
CD36 | 0.93 | -0.15 |
STOML3 | 0.92 | -0.08 |
十大负面中的基因 | ||
基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AC008073.2 | -0.09 | 0.02 |
FBXO32 | -0.08 | 0.04 |
NDRG1 | -0.08 | -0.06 |
RTN4RL2 | -0.07 | 0.05 |
CD163L1 | -0.07 | 0.12 |
MGLL | -0.07 | 0.07 |
AC016910.1 | -0.07 | -0.06 |
ARHGEF2 | -0.07 | -0.03 |
DUSP1 | -0.07 | 0.02 |
SLC26A4 | -0.07 | 0.02 |
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004872 | 受体的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0004988 | mu-opioid受体活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0004988 | mu-opioid受体活动 | 助教 | 9689128 | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0007191 | 多巴胺受体,腺苷酸环化酶激活途径 | 国际能源机构 | 多巴胺(术语层面:12) | - - - - - - |
去:0007187 | 蛋白信号耦合环核苷酸的第二信使 | 助教 | 7905839 | |
去:0007186 | g蛋白耦合受体蛋白信号通路 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0007193 | 蛋白信号,腺苷酸环化酶抑制途径 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0007165 | 信号转导 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0008285 | 负调节细胞增殖 | 助教 | 2159143 | |
去:0007626 | 运动的行为 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0007600 | 感官知觉 | 助教 | 9689128 | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0005794 | 高尔基体 | 助教 | 9242668 | |
去:0005624 | 膜分数 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005783 | 内质网 | 助教 | 9242668 | |
去:0016021 | 不可或缺的膜 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005886 | 等离子体膜 | 助教 | 9242668 | |
去:0005887 | 不可或缺的质膜 | 助教 | 7905839 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG刺激神经组织的配体受体的相互作用 | 272年 | 195年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PID IL4 2通道 | 65年 | 43 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME GPCR信号的 | 920年 | 449年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME肽配体受体有约束力 | 188年 | 108年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME类A1受体等视紫红质 | 305年 | 177年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME阿片类信号 | 78年 | 56 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME G蛋白激活 | 27 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
下游REACTOME GPCR信号 | 805年 | 368年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
我REACTOME Gα信号事件 | 195年 | 114年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
REACTOME GPCR配体结合 | 408年 | 246年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GAUSSMANN MLL AF4融合目标G | 238年 | 135年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
沈SMARCA2 DN的目标 | 357年 | 212年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
挞挞VS PLASMABLAST浆细胞 | 398年 | 262年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
松田自然杀伤细胞分化 | 475年 | 313年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
郑受FOXP3 | 491年 | 310年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
拉贝风WNT3A DN的目标 | 97年 | 53 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
YOSHIMURA MAPK8目标了 | 1305年 | 895年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
八木AML和发票16易位 | 422年 | 277年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
开罗肝脏DN发展 | 222年 | 141年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米凯尔森ES与H3K4ME3 ICP | 718年 | 401年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ZWANG仅由二EGF脉冲瞬变 | 1725年 | 838年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
let-7/98 | 399年 | 405年 | m8 | hsa-let-7a大脑 | UGAGGUAGUAGGUUGUAUAGUU |
hsa-let-7b大脑 | UGAGGUAGUAGGUUGUGUGGUU | ||||
hsa-let-7c大脑 | UGAGGUAGUAGGUUGUAUGGUU | ||||
hsa-let-7d大脑 | AGAGGUAGUAGGUUGCAUAGU | ||||
hsa-let-7e大脑 | UGAGGUAGGAGGUUGUAUAGU | ||||
hsa-let-7f大脑 | UGAGGUAGUAGAUUGUAUAGUU | ||||
hsa - mir - 98大脑 | UGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUU | ||||
hsa-let-7g深圳 | UGAGGUAGUAGUUUGUACAGU | ||||
hsa-let-7i大脑 | UGAGGUAGUAGUUUGUGCUGU | ||||
miR-23 | 268年 | 274年 | 1 | hsa-miR-23a大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUUCC |
hsa-miR-23b大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUACC |