基因页:SLC22A18AS
概括?
基因 | 5003 |
象征 | SLC22A18AS |
同义词 | bwr1b | bwscr1b | orctl2s | slc22a1ls | p27-bwr1b |
描述 | 溶质载体家族22成员18反义 |
参考 | MIM:603240|HGNC:HGNC:10965|HPRD:09127| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11P15.5 |
Pascal P值 | 0.006 |
胎儿β | -1.705 |
DMG | 2(#研究) |
主持人 | 皮质 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 2 |
DMG:Montano_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括CPG与精神分裂症之间的172个复制关联。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG21019522 | 11 | 2920789 | SLC22A18AS | 2.27E-4 | -0.005 | 0.164 | DMG:Montano_2016 |
CG17992161 | 11 | 2923525 | SLC22A18AS | 1.43e-8 | 0.007 | 5.53e-6 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SLC22A18AS_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。