基因页面:CLDN11

总结吗?
GeneID 5010年
象征 CLDN11
同义词 百|移动
描述 claudin 11
参考 MIM: 601326|HGNC: HGNC: 8514|HPRD: 03207|
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 3 q26.2-q26.3
帕斯卡假定值 0.017
夏洛克假定值 0.418
eGene 迈尔斯的顺式和反式
支持 G2Cdb.humanPSD

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:GWAScat 全基因组关联研究 这个数据集包含560个snp与精神分裂症有关。总共有486个基因映射到这些snp在50 kb。
简历:GWASdb 全基因组关联研究 精神分裂症GWASdb记录
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
PMID: cooccur 高通量文献检索 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。
文学 高通量文献检索 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 点击显示详细信息
GO_Annotation neuro-related关键字映射到基因本体论注释 支安打与neuro-related关键词:2

部分即遗传学和表观遗传学注释

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs651185 chr1 233871029 CLDN11 5010年 0.12 反式

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
加里 0.88 0.85
PABPCP5 0.88 0.89
ZNF512 0.87 0.85
TMEM57 0.87 0.85
PRPSAP2 0.87 0.84
DHX57 0.87 0.86
XRN2 0.87 0.87
TRAFD1 0.87 0.84
CEP57 0.87 0.87
ARFGAP3 0.87 0.83
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
HLA-F -0.71 -0.77
C5orf53 -0.70 -0.74
AF347015.31 -0.68 -0.81
MT-CO2 -0.68 -0.83
AF347015.27 -0.67 -0.80
AF347015.33 -0.67 -0.81
AIFM3 -0.67 -0.69
FBXO2 -0.66 -0.65
CA4 -0.66 -0.72
MT-CYB -0.66 -0.80

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005198 结构分子活动 国际能源机构 - - - - - -
去:0042802 相同的蛋白结合 国际空间站 - - - - - -
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0008366 轴突ensheathment 国际能源机构 神经元,轴突(术语层面:12) - - - - - -
去:0007155 细胞粘附 国际能源机构 - - - - - -
去:0007283 精子发生 国际能源机构 - - - - - -
去:0016338 calcium-independent信息附着力 国际空间站 - - - - - -
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005923 紧密连接 国际空间站 大脑(词级:10) - - - - - -
去:0016021 不可或缺的膜 国际能源机构 - - - - - -
去:0005886 等离子体膜 国际能源机构 - - - - - -
去:0030054 细胞结 国际能源机构 - - - - - -

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
KEGG细胞粘附分子凸轮 134年 93年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG紧密连接 134年 86年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG白细胞TRANSENDOTHELIAL迁移 118年 78年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME细胞细胞通讯 120年 77年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME细胞细胞连接组织 56 31日 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME紧密连接的交互 29日 11 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME细胞组织结 78年 43 所有SZGR 2.0基因通路
TURASHVILI乳腺导管癌与导管正常的DN 198年 110年 所有SZGR 2.0基因通路
如多发性骨髓瘤起来 74年 45 所有SZGR 2.0基因通路
罗德里格斯甲状腺未分化癌DN 537年 339年 所有SZGR 2.0基因通路
WT1 ZIRN维甲酸反应 23 14 所有SZGR 2.0基因通路
DN NUYTTEN EZH2目标 1024年 594年 所有SZGR 2.0基因通路
布伊泰尔特说光动力治疗压力DN 637年 377年 所有SZGR 2.0基因通路
里克曼肿瘤分化好与差 236年 139年 所有SZGR 2.0基因通路
里克曼头颈癌 One hundred. 63年 所有SZGR 2.0基因通路
唱转移基质上 110年 70年 所有SZGR 2.0基因通路
桑塞姆APC的目标 212年 121年 所有SZGR 2.0基因通路
马丁内斯RB1目标了 673年 430年 所有SZGR 2.0基因通路
马丁内斯TP53的目标了 602年 364年 所有SZGR 2.0基因通路
马丁内斯RB1和TP53的目标 601年 369年 所有SZGR 2.0基因通路
里奇尤因肉瘤祖DN 191年 123年 所有SZGR 2.0基因通路
郑胶质母细胞瘤可塑性高 250年 168年 所有SZGR 2.0基因通路
MATZUK男性生殖足 28 23 所有SZGR 2.0基因通路
拉贝风WNT3A DN的目标 97年 53 所有SZGR 2.0基因通路
DN PIONTEK PKD1目标 18 12 所有SZGR 2.0基因通路
迈斯纳和H3 UNMETHYLATED人大HCP 536年 296年 所有SZGR 2.0基因通路
迈斯纳大脑HCP H3K4ME3和H3K27ME3 1069年 729年 所有SZGR 2.0基因通路
国外RB1增长目标 243年 155年 所有SZGR 2.0基因通路
国外RB1目标融合性的 567年 365年 所有SZGR 2.0基因通路
陆EZH2 DN的目标 414年 237年 所有SZGR 2.0基因通路
棕熊短波紫外线反应通过TP53集团 898年 516年 所有SZGR 2.0基因通路
王THOC1 DN的目标 20. 14 所有SZGR 2.0基因通路
杨BCL3目标了 364年 236年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir - 124.1 179年 186年 1、m8 hsa - mir - 124 a UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
miR-124/506 179年 185年 1 hsa - mir - 506 UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA
hsa - mir - 124大脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir - 205 981年 988年 1、m8 hsa - mir - 205 UCCUUCAUUCCACCGGAGUCUG
miR-25/32/92/363/367 1314年 1321年 1、m8 hsa-miR-25大脑 CAUUGCACUUGUCUCGGUCUGA
hsa-miR-32 UAUUGCACAUUACUAAGUUGC
hsa - mir - 92 UAUUGCACUUGUCCCGGCCUG
hsa - mir - 367 AAUUGCACUUUAGCAAUGGUGA
hsa - mir - 92 b深圳 UAUUGCACUCGUCCCGGCCUC