概括
基因 5018
象征 OXA1L
同义词 OXA1
描述 氧化酶(细胞色素C)组装1类样
参考 MIM:601066|HGNC:HGNC:8526|ENSEMBL:ENSG00000155463|HPRD:03043|Vega:Otthumg0000000028691
基因类型 蛋白质编码
地图位置 14Q11.2
Pascal P值 0.885
Sherlock P值 0.666
胎儿β 0.672
主持人 皮质
额叶皮质BA9
伏隔核基底神经节
梭子基底神经节
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM:Guipponi_2014 整个外显子组测序分析 通过比较53个散发性SCZ及其未受影响的父母的外显子组来识别49个DNM
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.047

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
OXA1L C t NM_005015 P.G197G 代名词 NA NA 精神分裂症 DNM:Guipponi_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS11062486 CHR12 3185139 OXA1L 5018 0.12 反式
RS67896381 14 23241320 OXA1L ENSG00000155463.8 4.56185E-7 0.01 5589 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
GDAP1L1 0.96 0.94
ZNF821 0.95 0.90
塔布 0.95 0.91
PPP4C 0.95 0.94
HN1 0.94 0.93
traf4 0.94 0.81
marcksl1 0.94 0.84
PPP1R14B 0.94 0.83
CCDC28B 0.94 0.88
DBN1 0.93 0.88
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
HLA-F -0.73 -0.78
AIFM3 -0.70 -0.75
FBXO2 -0.70 -0.65
C5orf53 -0.70 -0.71
aldoc -0.70 -0.72
克鲁 -0.69 -0.74
LDHD -0.68 -0.68
hepn1 -0.68 -0.77
AF347015.27 -0.68 -0.84
CSRP1 -0.67 -0.76

第三节。基因本体论注释

生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006461 蛋白质复合物组件 塔斯 9247084
去:0009060 有氧呼吸 塔斯 9247084
GO:0051205 蛋白质插入膜 IEA -
GO:0055114 还原氧化 塔斯 9247084
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005739 线粒体 IEA -
去:0005746 线粒体呼吸链 塔斯 9247084
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg蛋白出口 24 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向DN 459 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇3 DN 229 142 该途径中的所有SZGR 2.0基因
血清剥夺的Graessmann凋亡 552 347 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和血清剥夺的反应 211 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dairkee Tert目标 380 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC网络 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔卡拉凋亡 88 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath SOX2目标 734 436 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner PBL肾脏移植OK vs捐助者 151 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
宁慢性阻塞性肺疾病 157 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江VHL目标 138 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室DN 261 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 388 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rizki肿瘤侵入性3D DN 270 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rizki肿瘤侵入性2D DN 64 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha Human Mitodb 6 2002 429 260 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha线粒体 447 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肌肉中的罗马胰岛素靶标 442 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇1 125 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇3 170 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因