基因页:牛
概括?
基因 | 5020 |
象征 | 牛 |
同义词 | ot | ot-npi | oxt-npi |
描述 | 催产素/神经蛋白I I预肽 |
参考 | MIM:167050|HGNC:HGNC:8528|ENSEMBL:ENSG00000101405|HPRD:08880|Vega:Otthumg0000000031724 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 20p13 |
Pascal P值 | 0.244 |
胎儿β | -0.57 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
支持 | 神经营养蛋白信号传导 潜在的突触基因 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2494875 | CHR1 | 50652317 | 牛 | 5020 | 0.04 | 反式 | ||
RS6688407 | CHR1 | 111796110 | 牛 | 5020 | 0.04 | 反式 | ||
RS17047497 | CHR2 | 56347610 | 牛 | 5020 | 0.03 | 反式 | ||
RS11679895 | CHR2 | 104914347 | 牛 | 5020 | 0.13 | 反式 | ||
RS17203661 | CHR4 | 8527262 | 牛 | 5020 | 0.18 | 反式 | ||
RS13146859 | CHR4 | 8528027 | 牛 | 5020 | 0.19 | 反式 | ||
RS17211228 | CHR5 | 81742122 | 牛 | 5020 | 0.06 | 反式 | ||
RS2546197 | CHR5 | 95172280 | 牛 | 5020 | 0.15 | 反式 | ||
RS9371139 | CHR6 | 169955205 | 牛 | 5020 | 0.07 | 反式 | ||
RS4391437 | CHR8 | 9373515 | 牛 | 5020 | 0.08 | 反式 | ||
RS6601322 | CHR8 | 9375852 | 牛 | 5020 | 0.02 | 反式 | ||
RS17062725 | Chr9 | 79168620 | 牛 | 5020 | 1.405E-5 | 反式 | ||
RS17824714 | CHR12 | 65764276 | 牛 | 5020 | 0.13 | 反式 | ||
RS6581637 | CHR12 | 65852923 | 牛 | 5020 | 0.13 | 反式 | ||
RS12585923 | CHR13 | 76625287 | 牛 | 5020 | 0.15 | 反式 | ||
RS1330442 | CHR13 | 76680920 | 牛 | 5020 | 0.04 | 反式 | ||
RS1499605 | CHR15 | 63706224 | 牛 | 5020 | 0.08 | 反式 | ||
RS289811 | CHR15 | 63710672 | 牛 | 5020 | 0.02 | 反式 | ||
RS16953493 | CHR17 | 3714057 | 牛 | 5020 | 0.05 | 反式 | ||
RS16953498 | CHR17 | 3719619 | 牛 | 5020 | 0.06 | 反式 | ||
RS1183148 | CHR17 | 3733846 | 牛 | 5020 | 0.04 | 反式 | ||
RS7272436 | CHR20 | 52558686 | 牛 | 5020 | 0.16 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/OXT_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Rab9a | 0.68 | 0.72 |
AKR7A2 | 0.68 | 0.66 |
fuca2 | 0.65 | 0.66 |
MRPL40 | 0.65 | 0.62 |
TMEM59 | 0.64 | 0.66 |
FAM96A | 0.64 | 0.54 |
C2ORF28 | 0.64 | 0.62 |
斯里 | 0.64 | 0.64 |
Grhpr | 0.63 | 0.63 |
SDHC | 0.63 | 0.62 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
jag2 | -0.41 | -0.40 |
BAT2D1 | -0.40 | -0.43 |
cacna1c | -0.40 | -0.35 |
Hivep3 | -0.39 | -0.33 |
cacna1b | -0.39 | -0.34 |
ADCY1 | -0.39 | -0.29 |
XKR4 | -0.37 | -0.30 |
myt1l | -0.37 | -0.31 |
AL391628.1 | -0.36 | -0.38 |
tnrc6c | -0.36 | -0.34 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Reactome胃胃CREB信号传导途径通过PKC和MAPK | 205 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组肽配体结合受体 | 188 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome A1级Rhodopsin喜欢受体 | 305 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome G alpha Q信号事件 | 184 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GPCR下游信号传导 | 805 | 368 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GPCR配体结合 | 408 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoebeke淋巴干细胞DN | 86 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee衰老的新皮层 | 89 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MATZUK植入后和产后 | 14 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yamashita肝癌与Epcam Up | 53 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME2和H3K27ME3 | 59 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |