概括
基因 5020
象征
同义词 ot | ot-npi | oxt-npi
描述 催产素/神经蛋白I I预肽
参考 MIM:167050|HGNC:HGNC:8528|ENSEMBL:ENSG00000101405|HPRD:08880|Vega:Otthumg0000000031724
基因类型 蛋白质编码
地图位置 20p13
Pascal P值 0.244
胎儿β -0.57
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 神经营养蛋白信号传导
潜在的突触基因

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2494875 CHR1 50652317 5020 0.04 反式
RS6688407 CHR1 111796110 5020 0.04 反式
RS17047497 CHR2 56347610 5020 0.03 反式
RS11679895 CHR2 104914347 5020 0.13 反式
RS17203661 CHR4 8527262 5020 0.18 反式
RS13146859 CHR4 8528027 5020 0.19 反式
RS17211228 CHR5 81742122 5020 0.06 反式
RS2546197 CHR5 95172280 5020 0.15 反式
RS9371139 CHR6 169955205 5020 0.07 反式
RS4391437 CHR8 9373515 5020 0.08 反式
RS6601322 CHR8 9375852 5020 0.02 反式
RS17062725 Chr9 79168620 5020 1.405E-5 反式
RS17824714 CHR12 65764276 5020 0.13 反式
RS6581637 CHR12 65852923 5020 0.13 反式
RS12585923 CHR13 76625287 5020 0.15 反式
RS1330442 CHR13 76680920 5020 0.04 反式
RS1499605 CHR15 63706224 5020 0.08 反式
RS289811 CHR15 63710672 5020 0.02 反式
RS16953493 CHR17 3714057 5020 0.05 反式
RS16953498 CHR17 3719619 5020 0.06 反式
RS1183148 CHR17 3733846 5020 0.04 反式
RS7272436 CHR20 52558686 5020 0.16 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Rab9a 0.68 0.72
AKR7A2 0.68 0.66
fuca2 0.65 0.66
MRPL40 0.65 0.62
TMEM59 0.64 0.66
FAM96A 0.64 0.54
C2ORF28 0.64 0.62
斯里 0.64 0.64
Grhpr 0.63 0.63
SDHC 0.63 0.62
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
jag2 -0.41 -0.40
BAT2D1 -0.40 -0.43
cacna1c -0.40 -0.35
Hivep3 -0.39 -0.33
cacna1b -0.39 -0.34
ADCY1 -0.39 -0.29
XKR4 -0.37 -0.30
myt1l -0.37 -0.31
AL391628.1 -0.36 -0.38
tnrc6c -0.36 -0.34

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Reactome胃胃CREB信号传导途径通过PKC和MAPK 205 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GPCR的反应组信号传导 920 449 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组肽配体结合受体 188 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome A1级Rhodopsin喜欢受体 305 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G alpha Q信号事件 184 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPCR下游信号传导 805 368 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPCR配体结合 408 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoebeke淋巴干细胞DN 86 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee衰老的新皮层 89 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MATZUK植入后和产后 14 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 536 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamashita肝癌与Epcam Up 53 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME2和H3K27ME3 59 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因