Summary
基因ID 5021
Symbol Oxtr
同义词 OT-R
描述 催产素受体
参考 MIM:167055|HGNC:HGNC:8529|Ensembl:ENSG00000180914|HPRD:01328|Vega:OTTHUMG00000090537
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3p25
Pascal P值 0.622
Sherlock P值 0.074
胎儿β -0.156
主持人 尾状基底神经节
小脑半球
Hypothalamus
伏隔核基底神经节
梭子基底神经节
迈尔斯的顺式和跨性别
支持 潜在的突触基因

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
表达 基因表达的荟萃分析 p价值:1.48
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS591585 CHR4 43424979 Oxtr 5021 0.09 反式
RS9405470 CHR6 1363889 Oxtr 5021 0.18 反式
RS9392285 CHR6 1365265 Oxtr 5021 0.1 反式
RS16873760 CHR6 45729388 Oxtr 5021 0.07 反式
rs16873861 CHR6 45752854 Oxtr 5021 0.06 反式
rs17109578 Chr10 90351347 Oxtr 5021 0.11 反式
RS6598553 CHR15 99339208 Oxtr 5021 0.17 反式
RS17342483 Chrx 102250155 Oxtr 5021 0.05 反式
RS5957194 Chrx 118769609 Oxtr 5021 0.05 反式
RS237897 3 8808285 Oxtr ENSG00000180914.6 1.337E-6 0.03 3029 gtex_brain_putamen_basal
rs3806675 3 8811646 Oxtr ENSG00000180914.6 7.558e-7 0.03 -332 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
chn1 0.84 0.87
SYTL2 0.84 0.86
RGS4 0.83 0.86
CASQ1 0.83 0.76
GCNT4 0.81 0.81
KCNK1 0.80 0.82
HLF 0.80 0.84
NRSN1 0.79 0.72
KIAA0748 0.79 0.84
galntl5 0.79 0.80
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
PKN1 -0.54 -0.63
pde9a -0.54 -0.68
FADS2 -0.53 -0.57
SH3BP2 -0.53 -0.69
Bcl7c -0.52 -0.69
KIAA1949 -0.52 -0.59
tubb2b -0.52 -0.66
SH2B2 -0.51 -0.67
traf4 -0.51 -0.66
KCTD11 -0.51 -0.62

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 pubMed ID
去:0004872 受体活性 IEA -
去:0004990 催产素受体活性 塔斯 10858434
去:0005000 加压素受体活性 IEA -
Biological process 去学期 证据 神经关键字 pubMed ID
去:0007186 G-protein coupled receptor protein signaling pathway IEA -
去:0007595 lactation 塔斯 1313946
GO:0007565 女性怀孕 塔斯 1313946
去:0006936 肌肉收缩 塔斯 1313946
GO:0045777 血压阳性调节 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 pubMed ID
去:0005886 质膜 塔斯 10858434|10910058
去:0005887 质膜的积分 塔斯 10858434

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg钙信号通路 178 134 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KEGG神经活性配体受体相互作用 272 195 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome胃胃CREB信号传导途径通过PKC和MAPK 205 136 All SZGR 2.0 genes in this pathway
GPCR的反应组信号传导 920 449 All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组肽配体结合受体 188 108 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome A1级Rhodopsin喜欢受体 305 177 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome G alpha Q信号事件 184 116 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome GPCR下游信号传导 805 368 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome GPCR配体结合 408 246 All SZGR 2.0 genes in this pathway
钟对偶氮替丁的反应和tsa 183 119 All SZGR 2.0 genes in this pathway
turashvili乳房导管癌与导管正常DN 198 110 All SZGR 2.0 genes in this pathway
turashvili乳房小叶癌与导管正常DN 91 53 All SZGR 2.0 genes in this pathway
turashvili乳房小叶癌与小叶正常 94 59 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wilcox对孕酮DN的反应 66 44 All SZGR 2.0 genes in this pathway
VMYB vs CMYB DN的LIU目标 43 30 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Morosetti facioscapulohumeral肌肉分散dn 12 6 All SZGR 2.0 genes in this pathway
多德鼻咽癌 1821年 933 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Perez TP63目标 355 243 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nuytten EZH2靶向 1037 673 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BALDWIN PRKCI TARGETS UP 35 26 All SZGR 2.0 genes in this pathway
韦斯顿Vegfa目标6HR 59 38 All SZGR 2.0 genes in this pathway
韦斯顿Vegfa目标12HR 35 23 All SZGR 2.0 genes in this pathway
韦斯顿Vegfa目标 108 71 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wang Smarce1靶向 280 183 All SZGR 2.0 genes in this pathway
恩格曼癌祖细胞dn 70 44 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SMID BREAST CANCER NORMAL LIKE UP 476 285 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zheng IL22发出信号 56 36 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MATZUK植入后和产后 14 13 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS UP 1305 895 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 536 296 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Poola侵入性乳腺癌DN 134 83 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 435 318 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Chicas RB1目标增长 243 155 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Chicas RB1目标汇合 567 365 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lee BMP2目标 745 475 All SZGR 2.0 genes in this pathway
phong tnf响应不是通过p38 337 236 All SZGR 2.0 genes in this pathway
林乳腺干细胞向上 489 314 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 516 308 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-29 426 433 1A,M8 HSA-MIR-29ASZ uagcaccaucugaaaucgguu
HSA-MIR-29BSZ uagcaccauuugaaaucaguguu
HSA-MIR-29CSZ uagcaccauuugaaaucggu