基因页:Oxtr
Summary?
基因ID | 5021 |
Symbol | Oxtr |
同义词 | OT-R |
描述 | 催产素受体 |
参考 | MIM:167055|HGNC:HGNC:8529|Ensembl:ENSG00000180914|HPRD:01328|Vega:OTTHUMG00000090537 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3p25 |
Pascal P值 | 0.622 |
Sherlock P值 | 0.074 |
胎儿β | -0.156 |
主持人 | 尾状基底神经节 小脑半球 Hypothalamus 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
支持 | 潜在的突触基因 |
基因in Data Sources
Section I. Genetics and epigenetics annotation
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS591585 | CHR4 | 43424979 | Oxtr | 5021 | 0.09 | 反式 | ||
RS9405470 | CHR6 | 1363889 | Oxtr | 5021 | 0.18 | 反式 | ||
RS9392285 | CHR6 | 1365265 | Oxtr | 5021 | 0.1 | 反式 | ||
RS16873760 | CHR6 | 45729388 | Oxtr | 5021 | 0.07 | 反式 | ||
rs16873861 | CHR6 | 45752854 | Oxtr | 5021 | 0.06 | 反式 | ||
rs17109578 | Chr10 | 90351347 | Oxtr | 5021 | 0.11 | 反式 | ||
RS6598553 | CHR15 | 99339208 | Oxtr | 5021 | 0.17 | 反式 | ||
RS17342483 | Chrx | 102250155 | Oxtr | 5021 | 0.05 | 反式 | ||
RS5957194 | Chrx | 118769609 | Oxtr | 5021 | 0.05 | 反式 | ||
RS237897 | 3 | 8808285 | Oxtr | ENSG00000180914.6 | 1.337E-6 | 0.03 | 3029 | gtex_brain_putamen_basal |
rs3806675 | 3 | 8811646 | Oxtr | ENSG00000180914.6 | 7.558e-7 | 0.03 | -332 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/OXTR_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
chn1 | 0.84 | 0.87 |
SYTL2 | 0.84 | 0.86 |
RGS4 | 0.83 | 0.86 |
CASQ1 | 0.83 | 0.76 |
GCNT4 | 0.81 | 0.81 |
KCNK1 | 0.80 | 0.82 |
HLF | 0.80 | 0.84 |
NRSN1 | 0.79 | 0.72 |
KIAA0748 | 0.79 | 0.84 |
galntl5 | 0.79 | 0.80 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
PKN1 | -0.54 | -0.63 |
pde9a | -0.54 | -0.68 |
FADS2 | -0.53 | -0.57 |
SH3BP2 | -0.53 | -0.69 |
Bcl7c | -0.52 | -0.69 |
KIAA1949 | -0.52 | -0.59 |
tubb2b | -0.52 | -0.66 |
SH2B2 | -0.51 | -0.67 |
traf4 | -0.51 | -0.66 |
KCTD11 | -0.51 | -0.62 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | pubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004872 | 受体活性 | IEA | - | |
去:0004990 | 催产素受体活性 | 塔斯 | 10858434 | |
去:0005000 | 加压素受体活性 | IEA | - | |
Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | pubMed ID |
去:0007186 | G-protein coupled receptor protein signaling pathway | IEA | - | |
去:0007595 | lactation | 塔斯 | 1313946 | |
GO:0007565 | 女性怀孕 | 塔斯 | 1313946 | |
去:0006936 | 肌肉收缩 | 塔斯 | 1313946 | |
GO:0045777 | 血压阳性调节 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | pubMed ID |
去:0005886 | 质膜 | 塔斯 | 10858434|10910058 | |
去:0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 10858434 |
Section V. Pathway annotation
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-29 | 426 | 433 | 1A,M8 | HSA-MIR-29ASZ | uagcaccaucugaaaucgguu |
HSA-MIR-29BSZ | uagcaccauuugaaaucaguguu | ||||
HSA-MIR-29CSZ | uagcaccauuugaaaucggu |