概括
基因 5042
象征 PABPC3
同义词 pabp3 | pabpl3 | tpabp
描述 聚(A)结合蛋白,细胞质3
参考 MIM:604680|HGNC:HGNC:8556|HPRD:05248|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 13Q12-Q13
Pascal P值 0.28
Sherlock P值 7.698E-4
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG00094319 13 25670530 PABPC3 4.522E-4 0.362 0.045 DMG:Wockner_2014
CG25752797 13 25670228 PABPC3 4.778E-4 0.327 0.046 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS3804338 CHR6 106772772 PABPC3 5042 0.06 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
crispld1 0.78 0.74
VCAM1 0.75 0.64
C5orf33 0.74 0.72
是的1 0.73 0.68
RP2 0.72 0.68
PABPC5 0.72 0.70
TFPI 0.72 0.60
GNG12 0.72 0.62
UNC119B 0.71 0.63
ARHGAP12 0.71 0.69
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.38 -0.44
FXYD1 -0.38 -0.42
AF347015.33 -0.37 -0.41
CA4 -0.36 -0.36
AF347015.8 -0.36 -0.42
AC018755.7 -0.36 -0.44
S100A1 -0.36 -0.37
HLA-F -0.36 -0.36
mt-cyb -0.35 -0.41
AF347015.27 -0.35 -0.39

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Puiffe入侵被腹水抑制 82 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 479 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病初期 390 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
等级结肠和直肠癌 285 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因