基因页:PABPC3
概括?
基因 | 5042 |
象征 | PABPC3 |
同义词 | pabp3 | pabpl3 | tpabp |
描述 | 聚(A)结合蛋白,细胞质3 |
参考 | MIM:604680|HGNC:HGNC:8556|HPRD:05248| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 13Q12-Q13 |
Pascal P值 | 0.28 |
Sherlock P值 | 7.698E-4 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG00094319 | 13 | 25670530 | PABPC3 | 4.522E-4 | 0.362 | 0.045 | DMG:Wockner_2014 |
CG25752797 | 13 | 25670228 | PABPC3 | 4.778E-4 | 0.327 | 0.046 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS3804338 | CHR6 | 106772772 | PABPC3 | 5042 | 0.06 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PABPC3_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
crispld1 | 0.78 | 0.74 |
VCAM1 | 0.75 | 0.64 |
C5orf33 | 0.74 | 0.72 |
是的1 | 0.73 | 0.68 |
RP2 | 0.72 | 0.68 |
PABPC5 | 0.72 | 0.70 |
TFPI | 0.72 | 0.60 |
GNG12 | 0.72 | 0.62 |
UNC119B | 0.71 | 0.63 |
ARHGAP12 | 0.71 | 0.69 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.38 | -0.44 |
FXYD1 | -0.38 | -0.42 |
AF347015.33 | -0.37 | -0.41 |
CA4 | -0.36 | -0.36 |
AF347015.8 | -0.36 | -0.42 |
AC018755.7 | -0.36 | -0.44 |
S100A1 | -0.36 | -0.37 |
HLA-F | -0.36 | -0.36 |
mt-cyb | -0.35 | -0.41 |
AF347015.27 | -0.35 | -0.39 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Puiffe入侵被腹水抑制 | 82 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 | 479 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病初期 | 390 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
等级结肠和直肠癌 | 285 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |