基因页：弗林

概括？
基因 5045
象征 弗林
同义词 皮毛| pace | pcsk3 | spc1
描述 弗林，配对的碱性氨基酸切割酶
参考 MIM：136950|HGNC：HGNC：8568|ENSEMBL：ENSG00000140564|HPRD：00653|Vega：Otthumg00000149831
基因类型 蛋白质编码
地图位置 15Q26.1
Pascal P值 3.671E-10
Sherlock P值 0.749
胎儿β -0.303
DMG 1（＃研究）
主持人 元

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
CV：GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历：PGC128 全基因组协会研究 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Vaneijk_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点，对应于精神分裂症患者（n = 260）和未受影响的对照（n = 250）之间的391个独特的转录本。 1
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中：1
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献：0.1637

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历：PGC128

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离
RS4702 CHR15 91426560 Ag 2.298e-12 UTR3 弗林 NM_002569：c。*1452a> g，NM_001289823：c。*1452a> g，nm_001289824：c。*1452a> g

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG09169633 15 91447749 弗林 9.823E-4 -5.604 DMG：Vaneijk_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0004252 丝氨酸型内肽酶活性 IEA 谷氨酸（GO期限：7） -
去：0002020 蛋白酶结合 IPI 14744861
去：0004867 丝氨酸型内肽酶抑制剂活性 艾达 10567353
去：0005509 钙离子结合 IEA -
去：0005515 蛋白质结合 IEA -
去：0008233 肽酶活性 艾达 15082773
GO：0042277 肽结合 艾达 8940009
GO：0048406 神经生长因子结合 艾达 8615794
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0006465 信号肽处理 艾达 16912035
GO：0052548 调节内肽酶活性 艾达 14744861
去：0008283 细胞增殖 小鬼 15899807
GO：0042176 调节蛋白质分解代谢过程 小鬼 15899807
GO：0051605 通过蛋白水解蛋白质成熟 艾达 9242664|10567353|14744861
GO：0051605 通过蛋白水解蛋白质成熟 小鬼 15899807
GO：0019067 病毒组装，成熟，出口和释放 IEP 8940009
GO：0032804 低密度脂蛋白受体分解代谢过程的负调控 艾达 16912035
GO：0032904 神经生长因子产生的负调节 艾达 10567353
GO：0032911 转化生长因子-beta1产生的负调节 小鬼 15899807
GO：0032940 细胞分泌 艾达 8615794
GO：0032455 神经生长因子处理 经验 12787574
去：0043043 肽生物合成过程 艾达 8262946
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0000139 高尔基膜 经验 8615794
去：0005794 高尔基体 IEA -
去：0005802 反式高尔基网络 艾达 14744861
去：0005615 细胞外空间 艾达 10567353
GO：0016021 膜不可或缺 IEA -
去：0009986 细胞表面 艾达 16537537
去：0005886 质膜 IEA -
GO：0030140 跨高尔基网络传输囊泡 艾达 15078902

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
PID Notch途径 59 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID P75 NTR途径 69 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID HIF1 TFPathway 66 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome PTM伽马羧酸羧酸盐酸盐和芳基硫酸酯酶激活 27 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NGF的Reactome信号传导 217 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
淋巴结的反应组信号传导 18 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Gamma羧化运输和蛋白质的氨基末端切割 11 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
细胞外基质的反应组降解 29 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Pre Notch表达和处理 44 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞外基质组织 87 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Golgi中的Reactome Pre Notch处理 16 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome TGF Beta受体信号传导激活SMADS 26 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PDGF的Reactome信号传导 122 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
蛋白质的反应组代谢 518 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome术后翻译蛋白修饰 188 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Notch的Reactome信号传导 103 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TGFβ受体复合物的反应组信号传导 63 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ginestier乳腺癌Znf217扩增DN 335 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ginestier乳腺癌20Q13扩增DN 180 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发6小时DN 514 330 该途径中的所有SZGR 2.0基因
gotzmann上皮到间充质过渡 69 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
唱歌转移基质 110 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HSIAO肝特异性基因 244 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nemeth炎症反应LPS 88 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 412 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染20小时 240 152 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamazaki TCEB3靶向 175 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
safford t淋巴细胞厌食 87 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
约瑟夫对丁酸钠的反应 31 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌DN 540 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Labbe TGFB1靶向 102 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TGFB1和WNT3A的LABBE目标 111 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性DN 210 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌子类CTNNB1 DN 170 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带8 21易位 368 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
li诱导了自然杀手 307 182 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verhaak胶质母细胞瘤间充质 216 130 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标2 UP 140 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad2或Smad3的Koinuma目标 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rarg Bound MEF 367 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg KDM3A靶向缺氧 208 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOSCO过敏原诱导TH2相关模块 151 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-103/107 828 834 M8 HSA-MIR-103脑 agcagcauuguacggcuauga
HSA-MIR-107脑 agcagcauuguacgggcuauca
mir-124/506 1287 1293 M8 HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-128 1225 1231 M8 HSA-MIR-128A ucacagugaaccggucuuuu
HSA-MIR-128B ucacagugaaccggucuuc
mir-137 365 372 1A，M8 HSA-MIR-137 uauugcuuaagaauacgcguag
mir-15/16/195/424/497 829 835 M8 HSA-MIR-15A脑 uagcagcacauaugguugug
HSA-MIR-16脑 uagcagcacguaaauauuggcg
HSA-MIR-15B脑 uagcagcacaucaugguuaca
HSA-MIR-195SZ uagcagaaaaauauuggc
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
HSA-MIR-497 cagcagcacacuguguuugu
mir-153 1567年 1574年 1A，M8 HSA-MIR-153 Uugcauagucacaaaaguga
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D 42 48 M8 HSA-MIR-17-5P caaagugcuuacugcagguagu
HSA-MIR-20A脑 uaaagugcuuauagugcagguag
HSA-MIR-106A aaaagugcuuacugugcagguagc
HSA-MIR-106BSZ uaaagugcugacagugcagau
HSA-MIR-20BSZ caaagugcuugugcagguag
HSA-MIR-519D caaagugccucccuuuagugugu
HSA-MIR-17-5P caaagugcuuacugcagguagu
HSA-MIR-20A脑 uaaagugcuuauagugcagguag
HSA-MIR-106A aaaagugcuuacugugcagguagc
HSA-MIR-106BSZ uaaagugcugacagugcagau
HSA-MIR-20BSZ caaagugcuugugcagguag
HSA-MIR-519D caaagugccucccuuuagugugu
mir-185 431 437 1a HSA-MIR-185脑 Uggagaaaggcaguuc
mir-219 1312 1319 1A，M8 HSA-MIR-219脑 ugauuguccaaacgcaauucu
mir-22 249 255 M8 HSA-MIR-22脑 Aagcugccaguugaagaacugu
mir-24 724 730 M8 HSA-MIR-24SZ uggcucucagagcaggaagag
mir-331 1387 1393 M8 HSA-MIR-331脑 gccccugggccuauccuagaa
mir-448 1568年 1574年 1a HSA-MIR-448 uugcauauguaggauguccccau
mir-452 1570年 1576年 M8 HSA-MIR-452 UguuugcaggaaacugagaC
mir-543 1532年 1538年 1a HSA-MIR-543 aaacauucgcggugcacuucu
mir-9 56 62 M8 HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga