Summary
GeneID 5046
Symbol PCSK6
同义词 PACE4 | SPC4
描述 普罗蛋白转化酶枯草蛋白/KEXIN类型6
参考 MIM:167405|HGNC:HGNC:8569|ENSEMBL:ENSG00000140479|HPRD:01329|Vega:Otthumg00000172097
基因类型 蛋白质编码
地图位置 15Q26.3
Pascal P值 0.028
胎儿β -1.464
主持人 小脑半球

Gene in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizotypy,schizophrenias,schizotypal 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 Hits with neuro-related keywords: 2

Section I. Genetics and epigenetics annotation


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004252 丝氨酸型内肽酶活性 IEA 谷氨酸(GO期限:7) -
去:0005509 calcium ion binding IEA -
去:0008201 肝素约束 艾达 12535616
去:0008270 锌离子结合 IEA -
去:0008233 肽酶活性 IEA -
GO:0048406 神经生长因子结合 艾达 8615794
GO:0043499 eukaryotic cell surface binding 艾达 12535616
Biological process 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0032902 神经生长因子产生 艾达 神经元(GO期限:11) 8615794
去:0009100 糖蛋白代谢过程 艾达 8218226
去:0006508 蛋白水解 IEA -
去:0007368 确定左/右对称性 IEA -
去:0007354 前轴的二吻性测定,胚胎 IEA -
GO:0051605 通过蛋白水解蛋白质成熟 艾达 8218226|9242664|9738469
去:0030510 BMP信号通路的调节 塔斯 10467177
GO:0032940 细胞分泌 艾达 8615794
GO:0032455 神经生长因子处理 EXP 12787574
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005796 Golgi lumen EXP 8615794
去:0005576 细胞外区域 IEA -
去:0005615 细胞外空间 艾达 8906861
去:0005622 细胞内 IEA -
去:0005625 可溶性部分 艾达 8218226
去:0005783 内质网 IEA -
GO:0016020 IEA -
GO:0009986 细胞表面 艾达 12535616
GO:0031012 细胞外基质 艾达 12535616

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
NGF的Reactome信号传导 217 167 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome发育生物学 396 292 All SZGR 2.0 genes in this pathway
淋巴结的反应组信号传导 18 11 All SZGR 2.0 genes in this pathway
西部肾上腺皮质肿瘤标记 21 13 All SZGR 2.0 genes in this pathway
中村肿瘤区周围与中央DN 634 384 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bertucci髓质与导管乳腺癌 206 111 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Davicioni分子臂与ERMS 332 228 All SZGR 2.0 genes in this pathway
威尔科克斯对孕酮的反应 152 90 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Basaki YBX1靶向DN 384 230 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mullighan NPM1突变签名1 DN 126 86 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mullighan NPM1签名3 DN 162 116 All SZGR 2.0 genes in this pathway
多德鼻咽癌DN 1375 806 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 All SZGR 2.0 genes in this pathway
lINDGREN BLADDER CANCER CLUSTER 1 DN 378 231 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gaussmann MLL AF4融合靶向 191 128 All SZGR 2.0 genes in this pathway
农民乳腺癌根源与腔内 326 213 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Buytaert光动力疗法应力DN 637 377 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nikolsky乳腺癌15Q26 AMPLICON 22 19 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Iizuka肝癌进展G2 G3 UP 28 14 All SZGR 2.0 genes in this pathway
tarte浆细胞与Plasmablast向上 398 262 All SZGR 2.0 genes in this pathway
VANTVEER BREAST CANCER METASTASIS UP 56 31 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HSIAO肝特异性基因 244 154 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Petrova内皮淋巴vs血液 131 87 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kaab心脏中心与心室DN 261 183 All SZGR 2.0 genes in this pathway
道格拉斯BMI1靶向 566 371 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CREIGHTON ENDOCRINE THERAPY RESISTANCE 2 473 224 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CREIGHTON ENDOCRINE THERAPY RESISTANCE 3 720 440 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lein Medulla标记 81 48 All SZGR 2.0 genes in this pathway
马丁内斯RB1靶向 673 430 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez TP53靶向 602 364 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Rizki肿瘤侵入性3D 210 124 All SZGR 2.0 genes in this pathway
肝脏DN中的Smid乳腺癌复发 10 9 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SMID乳腺癌腔内B 172 109 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Smid乳腺癌基础DN 701 446 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Izadpanah干细胞脂肪与骨DN 108 68 All SZGR 2.0 genes in this pathway
西部肾上腺皮质肿瘤 294 199 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Qi Plasmacytoma Up 259 185 All SZGR 2.0 genes in this pathway
李肝癌的生存 185 112 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Vantveer乳腺癌ESR1 UP 167 99 All SZGR 2.0 genes in this pathway
张TLX目标60小时 293 203 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ROME INSULIN TARGETS IN MUSCLE DN 204 114 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boyault肝癌子类G3 DN 51 32 All SZGR 2.0 genes in this pathway
清肝癌亚类未经注释 85 50 All SZGR 2.0 genes in this pathway
fontaine卵泡甲状腺腺瘤DN 68 45 All SZGR 2.0 genes in this pathway
FONTAINE THYROID TUMOR UNCERTAIN MALIGNANCY DN 26 14 All SZGR 2.0 genes in this pathway
fontaine乳头状甲状腺癌DN 80 53 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Demagalhaes老化 55 39 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA ECM监管机构 238 125 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA女性相关 753 411 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA矩阵 1028 559 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-124.1 1135 1142 1A,M8 HSA-MIR-124A UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-124/506 1135 1141 1a HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-21 1019 1026 1A,M8 HSA-MIR-21 UAGCUUAUCAGACUGAUGUUGA
hsa-miR-590 GAGCUUAUUCAUAAAAGUGCAG
mir-543 1288 1294 1a HSA-MIR-543 aaacauucgcggugcacuucu
mir-544 327 333 1a HSA-MIR-544 auucugcauuuuuuagcaagu
mir-9 321 327 M8 HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga