SZGR2 - Beplay体育中心

概括?

基因	5050
象征	PAFAH1B3
Synonyms	PAFAHG
Description	血小板激活因子乙酰水合酶1B催化亚基3
Reference	MIM:603074\|HGNC：HGNC：8576\|Ensembl:ENSG00000079462\|HPRD:04354\|Vega:OTTHUMG00000182795
Gene type	protein-coding
Map location	19q13.1
Pascal p-value	0.095
Sherlock P值	0.812
Fetal beta	2.468

数据源中的基因

Gene set name	Method of gene set	Description	Info
PMID:cooccur	High-throughput literature-search	Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学	High-throughput literature-search	与精神分裂症Co-occurance关键词:schizophrenia,schizophrenic,schizophrenias	Click to show details
GO_Annotation	Mapping neuro-related keywords to Gene Ontology annotations	与神经相关的关键字的命中：1

第一节遗传学和表观遗传学注释

Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

大脑区域的顶级共表达基因

Top 10 positively co-expressed genes
Gene	Pearson's Correlation	Spearman's Correlation
SMAD4	0.96	0.93
STAG1	0.96	0.93
SP3	0.96	0.94
DHX9	0.96	0.93
ppm1d	0.95	0.94
ZFP161	0.95	0.94
HNRNPK	0.95	0.93
SFRS1	0.95	0.94
ALDH18A1	0.95	0.93
CORO1C	0.95	0.93

Top 10 negatively co-expressed genes
Gene	Pearson's Correlation	Spearman's Correlation
FXYD1	-0.70	-0.87
MT-CO2	-0.70	-0.86
AF347015.31	-0.69	-0.85
IFI27	-0.69	-0.86
HLA-F	-0.69	-0.76
AF347015.33	-0.68	-0.82
AF347015.27	-0.67	-0.82
C5orf53	-0.67	-0.71
PTH1R	-0.67	-0.75
mt-cyb	-0.66	-0.82

Section III. Gene Ontology annotation

分子功能	GO term	Evidence	Neuro keywords	PubMed ID
GO:0003847	1-烷基-2-乙酰甘油磷酸酯酶酯酶活性	IEA		-
GO:0005515	protein binding	新闻学会		16189514
GO:0016788	hydrolase activity, acting on ester bonds	IEA		-
生物过程	GO term	Evidence	Neuro keywords	PubMed ID
GO:0007399	神经系统的发展	塔斯	neurite (GO term level: 5)	7669037
GO：0016042	lipid catabolic process	IEA		-
Cellular component	GO term	Evidence	Neuro keywords	PubMed ID
GO:0005737	细胞质	IEA		-

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者	Aliases B	Official full name B	Experimental	资源	PubMed ID
BRD7	BP75 \| CELTIX1 \| NAG4	bromodomain containing 7	两个杂交	BioGRID	16169070
C14orf1	ERG28 \| NET51	染色体14开放阅读框1	两个杂交	BioGRID	16169070
C1orf103	FLJ11269 \| RIF1 \| RP11-96K19.1	染色体1开放阅读框103	两个杂交	BioGRID	16169070
C7orf64	DKFZP564O0523 \| DKFZp686D1651 \| HSPC304	chromosome 7 open reading frame 64	两个杂交	BioGRID	16169070
CCDC90B	MDS011 \| MDS025 \| MGC104239	包含90b	两个杂交	BioGRID	16169070
CHMP7	MGC29816	CHMP家族，成员7	两个杂交	BioGRID	16189514
COPS6	CSN6 \| MOV34-34KD	COP9 constitutive photomorphogenic homolog subunit 6 (Arabidopsis)	两个杂交	BioGRID	16169070
CRMP1	DPYSL1 \| DRP-1 \| DRP1	collapsin response mediator protein 1	两个杂交	BioGRID	16169070
DDX24	-	DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 24	两个杂交	BioGRID	16169070
ECH1	HPXEL	enoyl Coenzyme A hydratase 1, peroxisomal	两个杂交	BioGRID	16169070
EEF1A1	CCS-3 \| CCS3 \| EEF-1 \| EEF1A \| EF-Tu \| EF1A \| FLJ25721 \| GRAF-1EF \| HNGC:16303 \| LENG7 \| MGC102687 \| MGC131894 \| MGC16224 \| PTI1 \| eEF1A-1	真核翻译伸长因子1 alpha 1	两个杂交	BioGRID	16169070
gapdh	G3PD \| GAPD \| MGC88685	glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase	两个杂交	BioGRID	16169070
GBP2	-	鸟烯基结合蛋白2，干扰素诱导	两个杂交	BioGRID	16169070
GDF9	-	growth differentiation factor 9	两个杂交	BioGRID	16169070
HSPH1	DKFZp686M05240 \| HSP105 \| HSP105A \| HSP105B \| KIAA0201 \| NY-CO-25	heat shock 105kDa/110kDa protein 1	Reconstituted Complex	BioGRID	14733918
IGSF21	FLJ41177 \| MGC15730	免疫球蛋白超家族，成员21	两个杂交	BioGRID	16169070
LNX1	lnx \|mpdz \|PDZRN2	Numb蛋白X 1的配体	Affinity Capture-Western 两个杂交	BioGRID	16189514
MED31	3110004H13Rik \| CGI-125 \| FLJ27436 \| FLJ36714 \| Soh1	mediator complex subunit 31	两个杂交	BioGRID	16169070
PAFAH1B1	LIS1 \| LIS2 \| MDCR \| MDS \| PAFAH	血小板激活因子乙酰水合酶，同工型IB，α亚基45KDA	-	HPRD,BioGRID	10727864
PAFAH1B2	-	platelet-activating factor acetylhydrolase, isoform Ib, beta subunit 30kDa	两个杂交	BioGRID	16189514
PAFAH1B3	-	platelet-activating factor acetylhydrolase, isoform Ib, gamma subunit 29kDa	两个杂交	BioGRID	16189514
plekhm1	AP162 \| B2 \| KIAA0356 \| OPTB6	pleckstrin homology domain containing, family M (with RUN domain) member 1	两个杂交	BioGRID	16169070
SDCBP2	FLJ12256 \| SITAC18 \| ST-2	联合结合蛋白（同步）2	两个杂交	BioGRID	16189514
SETDB1	eset \|kg1t \|KIAA0067 \|KMT1E	SET domain, bifurcated 1	两个杂交	BioGRID	16169070
TLE1	ESG \| ESG1 \| GRG1	分裂1（E（SP1）同源物，果蝇）的透明蛋白样增强剂	两个杂交	BioGRID	16169070
TP53	FLJ92943 \|LFS1 \|trp53 \|p53	tumor protein p53	两个杂交	BioGRID	16169070
TUBB2A	tubb \|tubb2 \|DJ40E16.7	tubulin, beta 2A	两个杂交	BioGRID	16169070
UNC119	HRG4	unc-119 homolog (C. elegans)	两个杂交	BioGRID	16169070
XRCC6	CTC75 \| CTCBF \| G22P1 \| KU70 \| ML8 \| TLAA	X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 6	两个杂交	BioGRID	16169070
ZBTB16	PLZF \| ZNF145	锌指和包含16的BTB结构域	两个杂交	BioGRID	16169070
ZHX1	-	zinc fingers and homeoboxes 1	两个杂交	BioGRID	16169070

V.途径注释

Pathway name	Pathway size	# SZGR 2.0 genes in pathway	Info
KEGG ETHER LIPID METABOLISM	33	15	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID LIS1 PATHWAY	28	22	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CASORELLI ACUTE PROMYELOCYTIC LEUKEMIA DN	663	425	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV RESPONSE EPIDERMIS UP	293	179	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇1 DN	378	231	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton Akt1通过mtor dn信令	23	16	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN DN	1781年	1082	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ROSTY CERVICAL CANCER PROLIFERATION CLUSTER	140	73	该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌	747	453	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 UP	309	199	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHETH LIVER CANCER VS TXNIP LOSS PAM1	229	137	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC NETWORK	1652	1023	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA ATM PCC NETWORK	1442	892	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC网络	779	480	该途径中的所有SZGR 2.0基因
狮子转移	539	324	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MORI SMALL PRE BII LYMPHOCYTE UP	86	57	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MORI MATURE B LYMPHOCYTE DN	75	43	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML Fab标记	191	131	该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德斯癌元签名	64	47	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21 TARGETS 2 UP	428	266	该途径中的所有SZGR 2.0基因
kayo卡路里限制肌肉	95	64	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KYNG DNA DAMAGE BY 4NQO OR UV	63	44	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KYNG DNA DAMAGE DN	195	135	该途径中的所有SZGR 2.0基因
IWANAGA CARCINOGENESIS BY KRAS UP	170	107	该途径中的所有SZGR 2.0基因
怀特福德小儿癌标记	116	63	该途径中的所有SZGR 2.0基因
等级结肠和直肠癌	285	167	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLUM RESPONSE TO SALIRASIB DN	342	220	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mueller AML融合的共同靶标	14	10	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SWEET LUNG CANCER KRAS UP	491	316	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SWEET KRAS ONCOGENIC SIGNATURE	89	56	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHIANG LIVER CANCER SUBCLASS PROLIFERATION UP	178	108	该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝脏开发	166	105	该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 13	172	107	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM ALL DISORDERS OLIGODENDROCYTE NUMBER CORR UP	756	494	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM BIPOLAR DISORDER OLIGODENDROCYTE DENSITY CORR UP	682	440	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM ALL DISORDERS DURATION CORR DN	146	90	该途径中的所有SZGR 2.0基因
VERHAAK GLIOBLASTOMA PRONEURAL	177	132	该途径中的所有SZGR 2.0基因
QI HYPOXIA	140	96	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOBERT OLIGODENDROCYTE DIFFERENTIATION UP	570	339	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ALFANO MYC TARGETS	239	156	该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIM MAMMARY STEM CELL DN	428	246	该途径中的所有SZGR 2.0基因

Gene Page:PAFAH1B3