基因页：Sycp3
概括？
| 基因 | 50511 |
| 象征 | Sycp3 |
| 同义词 | cor1 | rprgl4 | scp3 | spgf4 |
| 描述 | 突触核复合蛋白3 |
| 参考 | MIM：604759|HGNC：HGNC：18130|ENSEMBL：ENSG00000139351|HPRD：07265|Vega：Otthumg00000150132 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 12q |
| Pascal P值 | 0.511 |
| 胎儿β | 1.241 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG09676606 | 12 | 102132872 | Sycp3 | 2.894E-4 | 0.386 | 0.039 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003677 | DNA结合 | IEA | - | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007130 | 突发型复合体组件 | IEA | 突触（GO期限：11） | - |
| 去：0000705 | Achiasmate减数分裂i | IEA | - | |
| 去：0007141 | 男性减数分裂i | nas | 15218256 | |
| 去：0007283 | 精子发生 | IEA | - | |
| 去：0007049 | 细胞周期 | IEA | - | |
| 去：0007066 | 女性减数分裂姐妹染色单体凝聚力 | IEA | - | |
| 去：0007067 | 有丝分裂 | IEA | - | |
| 去：0007126 | 减数分裂 | IEA | - | |
| 去：0043066 | 凋亡的负调节 | IEA | - | |
| 去：0051301 | 细胞分裂 | IEA | - | |
| GO：0035093 | 精子发生，染色体蛋白的交换 | 小鬼 | 14643120 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0000793 | 冷凝染色体 | IEA | - | |
| 去：0000800 | 横向元素 | IEA | - | |
| GO：0000802 | 横向灯丝 | IEA | - | |
| 去：0005634 | 核 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Reactome减数分裂 | 116 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组细胞周期 | 421 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome染色体维护 | 122 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Meiotic Synapsis | 73 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 血清剥夺的Graessmann凋亡 | 552 | 347 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graessmann对MC和血清剥夺的反应 | 211 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血干细胞 | 254 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yamazaki TCEB3靶向DN | 215 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Matzuk减数分裂和DNA修复 | 39 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MATZUK精子细胞 | 72 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner NPC HCP，含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP与H3未甲基化 | 37 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MEF HCP与H3未甲基化 | 228 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FEVR CTNNB1靶向DN | 553 | 343 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-26 | 19 | 25 | 1a | HSA-MIR-26A脑 | Uucaaguaauccaggauaggc |
| HSA-MIR-26BSZ | uucaaguaauucaggauagguu | ||||