基因页:卡莉
概括?
基因 | 50632 |
象征 | 卡莉 |
同义词 | drd1ip | nsg3 |
描述 | 结石神经元特异性囊泡蛋白 |
参考 | MIM:604647|HGNC:HGNC:17938|Ensembl:ENSG00000130643|HPRD:06871|Vega:Otthumg0000000019310 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 10q26.3 |
Pascal P值 | 0.079 |
Sherlock P值 | 0.498 |
胎儿β | -2.421 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
ADT:SUN_2012 | 系统研究抗精神病药及其靶标 | 共有382个药物目标关联涉及43种抗精神病药和49个靶基因。 | |
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中:2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CALY_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
GO:0050780 | 多巴胺受体结合 | IEA | 多巴胺(GO期限:6) | - |
GO:0032051 | 网格林轻链结合 | 艾达 | 16595675 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007212 | 多巴胺受体信号通路 | IEA | 多巴胺(GO期限:8) | - |
GO:0048268 | 网格蛋白外套组件 | 艾达 | 16595675 | |
GO:0045807 | 内吞作用的阳性调节 | 小鬼 | 16595675 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005886 | 质膜 | IEA | - | |
去:0005887 | 质膜的积分 | 艾达 | 14534309 | |
GO:0031410 | 细胞质囊泡 | 艾达 | 14534309|16595675 | |
去:0030659 | 细胞质囊泡膜 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
周的炎症反应生活 | 485 | 293 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pDGFB DN的Johansson神经胶质作用 | 21 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
约翰逊脑癌早期与晚期DN | 45 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
OSADA ASCL1靶向 | 46 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MCV6 ICP,带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 34 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF ICP,带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 38 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen IPS ICP带有H3K4ME3和H327Me3 | 126 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |