概括
基因 50632
象征 卡莉
同义词 drd1ip | nsg3
描述 结石神经元特异性囊泡蛋白
参考 MIM:604647|HGNC:HGNC:17938|Ensembl:ENSG00000130643|HPRD:06871|Vega:Otthumg0000000019310
基因类型 蛋白质编码
地图位置 10q26.3
Pascal P值 0.079
Sherlock P值 0.498
胎儿β -2.421

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
ADT:SUN_2012 系统研究抗精神病药及其靶标 共有382个药物目标关联涉及43种抗精神病药和49个靶基因。
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:2

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0050780 多巴胺受体结合 IEA 多巴胺(GO期限:6) -
GO:0032051 网格林轻链结合 艾达 16595675
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007212 多巴胺受体信号通路 IEA 多巴胺(GO期限:8) -
GO:0048268 网格蛋白外套组件 艾达 16595675
GO:0045807 内吞作用的阳性调节 小鬼 16595675
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005886 质膜 IEA -
去:0005887 质膜的积分 艾达 14534309
GO:0031410 细胞质囊泡 艾达 14534309|16595675
去:0030659 细胞质囊泡膜 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
周的炎症反应生活 485 293 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pDGFB DN的Johansson神经胶质作用 21 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
约翰逊脑癌早期与晚期DN 45 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OSADA ASCL1靶向 46 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 ICP,带有H3K4ME3和H3K27ME3 34 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF ICP,带有H3K4ME3和H3K27ME3 38 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen IPS ICP带有H3K4ME3和H327Me3 126 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因