基因页面:棕榈

总结吗?
GeneID 5064年
象征 棕榈
同义词 - - - - - -
描述 paralemmin
参考 MIM: 608134|HGNC: HGNC: 8594|运用:ENSG00000099864|HPRD: 09734|织女:OTTHUMG00000181785
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 19 p13.3
帕斯卡假定值 0.16
夏洛克假定值 0.611
胎儿β 0.518
DMG 1(#研究)
eGene 伏隔核基底神经节
迈尔斯的顺式和反式
支持 结构可塑性
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSENSUS
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS
CompositeSet

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 1
PMID: cooccur 高通量文献检索 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。
文学 高通量文献检索 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,精神分裂症患者,神经 点击显示详细信息
GO_Annotation neuro-related关键字映射到基因本体论注释 支安打与neuro-related关键词:1

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg01729837 19 719622年 棕榈 7.48 e-5 0.383 0.025 DMG: Wockner_2014

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs5995385 chr22 37519863 棕榈 5064年 0.2 反式

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
TMX2 0.80 0.81
PEX19 0.78 0.83
PRDX3 0.77 0.76
PKM2 0.74 0.79
PPT1 0.73 0.78
SDHD 0.73 0.78
PSAP 0.72 0.75
DAZAP2 0.71 0.73
TM7SF3 0.71 0.73
ATG7 0.71 0.79
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
AC005921.3 -0.53 -0.57
ZNF814 -0.50 -0.53
AC010300.1 -0.46 -0.46
IL3RA -0.45 -0.52
AC004148.1 -0.45 -0.49
C21orf32 -0.45 -0.47
ANKRD36 -0.45 -0.49
ANKRD36B -0.43 -0.48
ARHGAP8 -0.43 -0.43
AC109829.1 -0.43 -0.38

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0031750 多巴胺D3受体结合 国际能源机构 多巴胺(术语层面:7) - - - - - -
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0007194 -腺苷酸环化酶活动的监管 国际能源机构 - - - - - -
去:0007010 细胞骨架组织 国际能源机构 - - - - - -
去:0008360 调节细胞形状 国际能源机构 - - - - - -
去:0008104 蛋白质的定位 国际能源机构 - - - - - -
去:0006928 细胞运动 助教 9813098
去:0030818 消极的阵营生物合成过程的监管 国际能源机构 - - - - - -
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005737 细胞质 国际能源机构 - - - - - -
去:0016023 细胞质面上泡 助教 9813098
去:0005886 等离子体膜 NAS 9615234
去:0005887 不可或缺的质膜 助教 9813098

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
唐克斯的目标RUNX1 RUNX1T1融合红细胞 157年 104年 所有SZGR 2.0基因通路
GOZGIT ESR1目标了 149年 84年 所有SZGR 2.0基因通路
挞挞VS PLASMABLAST浆细胞 398年 262年 所有SZGR 2.0基因通路
罗斯AML AML1 ETO融合 76年 55 所有SZGR 2.0基因通路
HOEGERKORP CD44目标直接DN 14 7 所有SZGR 2.0基因通路
VERHAAK AML NPM1突变的DN 246年 180年 所有SZGR 2.0基因通路
RODWELL老化肾脏没有血液DN 150年 93年 所有SZGR 2.0基因通路
麦克朗可卡因奖励5 d 79年 62年 所有SZGR 2.0基因通路
尼尔森脂肪肉瘤了 18 13 所有SZGR 2.0基因通路
RODWELL老化肾脏DN 145年 88年 所有SZGR 2.0基因通路
崔TCF21目标2 428年 266年 所有SZGR 2.0基因通路
安布罗西尼FLAVOPIRIDOL治疗TP53 109年 63年 所有SZGR 2.0基因通路
塞其炎症反应有限合伙人DN 23 16 所有SZGR 2.0基因通路
60张及目标的人力资源 293年 203年 所有SZGR 2.0基因通路
VALK AML集群11 36 24 所有SZGR 2.0基因通路
八木AML和T 8 21易位 368年 247年 所有SZGR 2.0基因通路
若林史江脂肪生成PPARG 8 d 658年 397年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
miR-29 803年 810年 1、m8 hsa-miR-29a深圳 UAGCACCAUCUGAAAUCGGUU
hsa-miR-29b深圳 UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU
hsa-miR-29c深圳 UAGCACCAUUUGAAAUCGGU
mir - 326 1481年 1488年 1、m8 hsa - mir - 326 CCUCUGGGCCCUUCCUCCAG
hsa - mir - 326 CCUCUGGGCCCUUCCUCCAG