基因页:Arhgef3
概括?
基因 | 50650 |
象征 | Arhgef3 |
同义词 | gef3 | sta3 | xpln |
描述 | Rho鸟嘌呤核苷酸交换因子3 |
参考 | MIM:612115|HGNC:HGNC:683|Ensembl:ENSG00000163947|HPRD:12480|Vega:Otthumg00000158857 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3P14.3 |
Pascal P值 | 0.087 |
Sherlock P值 | 0.744 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG20509080 | 3 | 56835873 | Arhgef3 | 3.57E-10 | -0.01 | 7.34e-7 | DMG:JAFFE_2016 |
CG00478127 | 3 | 57112588 | Arhgef3 | 5.3e-9 | -0.029 | 2.95E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ARHGEF3_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
生物卡塔尔肌球蛋白途径 | 31 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta PAR1途径 | 37 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pid rhoa reg途径 | 46 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rho GTPases的Reactome信号传导 | 113 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NGF的Reactome信号传导 | 217 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Nrage通过JNK发出死亡的信号 | 43 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome细胞死亡信号通过Nrage NRIF和NADE传导 | 60 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome P75 NTR受体介导的信号传导 | 81 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome G alpha1213信号传导事件 | 74 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GPCR下游信号传导 | 805 | 368 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
威尔科克斯对孕酮的反应 | 152 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Doane对雄激素DN的反应 | 241 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 3D的Takeda目标 | 182 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan mll签名1 | 380 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名2 UP | 418 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周的炎症反应FIMA DN | 284 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN | 805 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶向F | 185 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房4 5WK | 271 | 175 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal TGFB1靶向DN | 62 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rodrigues NTN1和DCC目标 | 35 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
buytaert光动力疗法压力 | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿米特血清反应240 MCF10A | 57 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mori成熟B淋巴细胞向上 | 90 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onder CDH1目标2 DN | 464 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕色髓样细胞的发育 | 165 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan多发性骨髓瘤CD1和CD2 DN | 51 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng由Foxp3绑定 | 491 | 310 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng Foxp3目标胸腺 | 196 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kondo EZH2目标 | 245 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB2 CDC25A DN的射线肿瘤发生 | 159 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chang Core血清反应DN | 209 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甜肺癌Kras DN | 435 | 289 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Valk AML群集15 | 31 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
cebpa的valk aml | 37 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boyault肝癌子类G1 UP | 113 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇6的时间反应6 | 75 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHYLA CBFA2T3靶向 | 387 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wierenga Stat5a靶向DN | 213 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
rao由SALL4同工型B绑定 | 517 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 | 516 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |