概括
基因 50651
象征 SLC45A1
同义词 DNB5
描述 Solute Carrier家族45会员1
参考 MIM:605763|HGNC:HGNC:17939|ENSEMBL:ENSG00000162426|Vega:Otthumg00000000503
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p36.23
Pascal P值 8.007e-9
Sherlock P值 0.674
主持人 小脑半球
梭子基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS953043 1 8774451 SLC45A1 ENSG00000162426.10 2.75988E-6 0.05 396565 gtex_brain_putamen_basal
RS12128827 1 8788155 SLC45A1 ENSG00000162426.10 2.94556E-6 0.05 410269 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TCGA胶质母细胞瘤副本编号DN 31 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MariaDason对丁酸酯Sulindac 6的反应 52 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 536 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen IPS HCP与H3未甲基化 80 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇3 dn 42 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因