基因页:SLC45A1
概括?
基因 | 50651 |
象征 | SLC45A1 |
同义词 | DNB5 |
描述 | Solute Carrier家族45会员1 |
参考 | MIM:605763|HGNC:HGNC:17939|ENSEMBL:ENSG00000162426|Vega:Otthumg00000000503 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1p36.23 |
Pascal P值 | 8.007e-9 |
Sherlock P值 | 0.674 |
主持人 | 小脑半球 梭子基底神经节 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS953043 | 1 | 8774451 | SLC45A1 | ENSG00000162426.10 | 2.75988E-6 | 0.05 | 396565 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12128827 | 1 | 8788155 | SLC45A1 | ENSG00000162426.10 | 2.94556E-6 | 0.05 | 410269 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/SLC45A1_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TCGA胶质母细胞瘤副本编号DN | 31 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MariaDason对丁酸酯Sulindac 6的反应 | 52 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen IPS HCP与H3未甲基化 | 80 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇3 dn | 42 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |