Summary
基因 50853
象征 维尔
同义词 -
描述 像villin一样
参考 HGNC:HGNC:30906|ENSEMBL:ENSG00000136059|HPRD:18283|Vega:Otthumg00000130814
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3P21.3
Pascal P值 0.158
Sherlock P值 0.202
胎儿β -0.417
DMG 1(#研究)
主持人 前扣带回皮层BA24
尾状基底神经节
小脑
皮质
额叶皮质BA9
海马
伏隔核基底神经节
梭子基底神经节
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 Psr: 0.006

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG25663755 3 38035463 维尔 1.062E-4 0.508 0.028 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1967256 CHR5 90299222 维尔 50853 0.14 反式
RS11954387 CHR5 90302116 维尔 50853 0.14 反式
RS17182597 CHR7 12393594 维尔 50853 0.06 反式
RS3011362 Chr10 122553193 维尔 50853 0.02 反式
RS2997307 Chr10 122561073 维尔 50853 0.03 反式
RS897740 CHR19 6901558 维尔 50853 0.2 反式
RS9826470 3 38019428 维尔 ENSG00000136059.10 7.745e-7 0.02 -10122 gtex_brain_ba24
RS7632911 3 38030899 维尔 ENSG00000136059.10 2.407E-6 0.02 1349 gtex_brain_ba24
RS7644531 3 38030933 维尔 ENSG00000136059.10 2.411E-6 0.02 1383 gtex_brain_ba24
RS9872804 3 38033462 维尔 ENSG00000136059.10 2.606E-6 0.02 3912 gtex_brain_ba24
RS9823482 3 38036807 维尔 ENSG00000136059.10 2.44e-6 0.02 7257 gtex_brain_ba24
RS9829569 3 38038329 维尔 ENSG00000136059.10 2.45e-6 0.02 8779 gtex_brain_ba24
RS928807 3 38042182 维尔 ENSG00000136059.10 2.467E-6 0.02 12632 gtex_brain_ba24
RS9311172 3 38044143 维尔 ENSG00000136059.10 2.481E-6 0.02 14593 gtex_brain_ba24
RS9875248 3 38044592 维尔 ENSG00000136059.10 2.484e-6 0.02 15042 gtex_brain_ba24
RS6793254 3 38044951 维尔 ENSG00000136059.10 2.496E-6 0.02 15401 gtex_brain_ba24
RS6769106 3 38044969 维尔 ENSG00000136059.10 2.496E-6 0.02 15419 gtex_brain_ba24
RS9311173 3 38045528 维尔 ENSG00000136059.10 2.501E-6 0.02 15978 gtex_brain_ba24
RS9843506 3 38046023 维尔 ENSG00000136059.10 2.505E-6 0.02 16473 gtex_brain_ba24
RS9311176 3 38047607 维尔 ENSG00000136059.10 2.516E-6 0.02 18057 gtex_brain_ba24
RS6776745 3 38004661 维尔 ENSG00000136059.10 3.742E-7 0 -24889 gtex_brain_putamen_basal
RS6801985 3 38005183 维尔 ENSG00000136059.10 3.742E-7 0 -24367 gtex_brain_putamen_basal
RS1573291 3 38009749 维尔 ENSG00000136059.10 3.713E-7 0 -19801 gtex_brain_putamen_basal
RS9826470 3 38019428 维尔 ENSG00000136059.10 9.025e-10 0 -10122 gtex_brain_putamen_basal
RS11717282 3 38019924 维尔 ENSG00000136059.10 5.642e-8 0 -9626 gtex_brain_putamen_basal
RS10095 3 38023553 维尔 ENSG00000136059.10 1.281E-8 0 -5997 gtex_brain_putamen_basal
RS11129775 3 38024408 维尔 ENSG00000136059.10 1.281E-8 0 -5142 gtex_brain_putamen_basal
RS11709029 3 38024420 维尔 ENSG00000136059.10 1.281E-8 0 -5130 gtex_brain_putamen_basal
RS60500371 3 38025750 维尔 ENSG00000136059.10 1.281E-8 0 -3800 gtex_brain_putamen_basal
RS73825449 3 38025991 维尔 ENSG00000136059.10 1.281E-8 0 -3559 gtex_brain_putamen_basal
RS17037286 3 38026387 维尔 ENSG00000136059.10 5.178e-8 0 -3163 gtex_brain_putamen_basal
RS11711286 3 38026652 维尔 ENSG00000136059.10 9.725e-9 0 -2898 gtex_brain_putamen_basal
RS11715511 3 38026914 维尔 ENSG00000136059.10 9.144e-9 0 -2636 gtex_brain_putamen_basal
RS11719260 3 38027101 维尔 ENSG00000136059.10 1.281E-8 0 -2449 gtex_brain_putamen_basal
RS11712625 3 38028345 维尔 ENSG00000136059.10 3.693E-9 0 -1205 gtex_brain_putamen_basal
RS11713558 3 38028614 维尔 ENSG00000136059.10 2.941E-7 0 -936 gtex_brain_putamen_basal
RS11129776 3 38028675 维尔 ENSG00000136059.10 1.281E-8 0 -875 gtex_brain_putamen_basal
RS11922163 3 38028851 维尔 ENSG00000136059.10 1.281E-8 0 -699 gtex_brain_putamen_basal
RS56264852 3 38030567 维尔 ENSG00000136059.10 3.826e-7 0 1017 gtex_brain_putamen_basal
RS11715770 3 38030747 维尔 ENSG00000136059.10 3.127E-13 0 1197 gtex_brain_putamen_basal
RS7632911 3 38030899 维尔 ENSG00000136059.10 5.274E-15 0 1349 gtex_brain_putamen_basal
RS7644531 3 38030933 维尔 ENSG00000136059.10 5.256e-15 0 1383 gtex_brain_putamen_basal
RS11715803 3 38031020 维尔 ENSG00000136059.10 2.169E-8 0 1470 gtex_brain_putamen_basal
RS7611147 3 38031372 维尔 ENSG00000136059.10 1.215E-9 0 1822年 gtex_brain_putamen_basal
RS9872804 3 38033462 维尔 ENSG00000136059.10 5.312e-15 0 3912 gtex_brain_putamen_basal
RS7648182 3 38035508 维尔 ENSG00000136059.10 1.195E-10 0 5958 gtex_brain_putamen_basal
RS9823482 3 38036807 维尔 ENSG00000136059.10 5.087e-15 0 7257 gtex_brain_putamen_basal
RS9829569 3 38038329 维尔 ENSG00000136059.10 4.972E-15 0 8779 gtex_brain_putamen_basal
RS6809649 3 38038982 维尔 ENSG00000136059.10 1.152E-10 0 9432 gtex_brain_putamen_basal
RS6550514 3 38039187 维尔 ENSG00000136059.10 1.149E-10 0 9637 gtex_brain_putamen_basal
RS7641519 3 38039302 维尔 ENSG00000136059.10 1.428e-10 0 9752 gtex_brain_putamen_basal
RS928807 3 38042182 维尔 ENSG00000136059.10 5.453e-15 0 12632 gtex_brain_putamen_basal
RS9843296 3 38043904 维尔 ENSG00000136059.10 2.45e-10 0 14354 gtex_brain_putamen_basal
RS9311172 3 38044143 维尔 ENSG00000136059.10 4.781E-15 0 14593 gtex_brain_putamen_basal
RS146852558 3 38044327 维尔 ENSG00000136059.10 8.138E-11 0 14777 gtex_brain_putamen_basal
RS9875248 3 38044592 维尔 ENSG00000136059.10 4.765e-15 0 15042 gtex_brain_putamen_basal
RS6793254 3 38044951 维尔 ENSG00000136059.10 4.75e-15 0 15401 gtex_brain_putamen_basal
RS6769106 3 38044969 维尔 ENSG00000136059.10 4.75e-15 0 15419 gtex_brain_putamen_basal
rs35261592 3 38044996 维尔 ENSG00000136059.10 7.151e-11 0 15446 gtex_brain_putamen_basal
RS9311173 3 38045528 维尔 ENSG00000136059.10 4.717E-15 0 15978 gtex_brain_putamen_basal
RS9843506 3 38046023 维尔 ENSG00000136059.10 4.703E-15 0 16473 gtex_brain_putamen_basal
RS9311175 3 38047211 维尔 ENSG00000136059.10 7.142e-11 0 17661 gtex_brain_putamen_basal
RS9311176 3 38047607 维尔 ENSG00000136059.10 4.657E-15 0 18057 gtex_brain_putamen_basal
RS9816693 3 38047954 维尔 ENSG00000136059.10 1.145e-10 0 18404 gtex_brain_putamen_basal
RS57208122 3 38049029 维尔 ENSG00000136059.10 2.397E-9 0 19479 gtex_brain_putamen_basal
RS113213588 3 38050159 维尔 ENSG00000136059.10 5.855e-8 0 20609 gtex_brain_putamen_basal
RS9857730 3 38051941 维尔 ENSG00000136059.10 8.71e-14 0 22391 gtex_brain_putamen_basal
RS9842880 3 38052613 维尔 ENSG00000136059.10 9.087e-10 0 23063 gtex_brain_putamen_basal
RS9758003 3 38053206 维尔 ENSG00000136059.10 8.926e-10 0 23656 gtex_brain_putamen_basal
RS57948844 3 38053322 维尔 ENSG00000136059.10 1.574E-9 0 23772 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003779 肌动蛋白结合 IEA -
去:0005509 钙离子结合 IEA -
去:0005200 细胞骨架的结构成分 塔斯 9179494
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007010 细胞骨架组织 IEA -
去:0051016 带刺肌动蛋白细丝封盖 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0015629 肌动蛋白细胞骨架 塔斯 9179494

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Sengupta鼻咽癌DN 349 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Borczuk恶性间皮瘤DN 104 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vecchi胃癌先进与早期DN 138 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
血清剥夺的Graessmann凋亡 552 347 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heidenblad Amplicon 12P11 12 DN 30 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌正常 476 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHYLA CBFA2T3靶向 387 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
前列腺癌模型中的Acevedo FGFR1靶标 289 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞DN 428 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因