基因页:维尔
Summary?
基因 | 50853 |
象征 | 维尔 |
同义词 | - |
描述 | 像villin一样 |
参考 | HGNC:HGNC:30906|ENSEMBL:ENSG00000136059|HPRD:18283|Vega:Otthumg00000130814 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3P21.3 |
Pascal P值 | 0.158 |
Sherlock P值 | 0.202 |
胎儿β | -0.417 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 前扣带回皮层BA24 尾状基底神经节 小脑 皮质 额叶皮质BA9 海马 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | Psr: 0.006 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG25663755 | 3 | 38035463 | 维尔 | 1.062E-4 | 0.508 | 0.028 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1967256 | CHR5 | 90299222 | 维尔 | 50853 | 0.14 | 反式 | ||
RS11954387 | CHR5 | 90302116 | 维尔 | 50853 | 0.14 | 反式 | ||
RS17182597 | CHR7 | 12393594 | 维尔 | 50853 | 0.06 | 反式 | ||
RS3011362 | Chr10 | 122553193 | 维尔 | 50853 | 0.02 | 反式 | ||
RS2997307 | Chr10 | 122561073 | 维尔 | 50853 | 0.03 | 反式 | ||
RS897740 | CHR19 | 6901558 | 维尔 | 50853 | 0.2 | 反式 | ||
RS9826470 | 3 | 38019428 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 7.745e-7 | 0.02 | -10122 | gtex_brain_ba24 |
RS7632911 | 3 | 38030899 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 2.407E-6 | 0.02 | 1349 | gtex_brain_ba24 |
RS7644531 | 3 | 38030933 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 2.411E-6 | 0.02 | 1383 | gtex_brain_ba24 |
RS9872804 | 3 | 38033462 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 2.606E-6 | 0.02 | 3912 | gtex_brain_ba24 |
RS9823482 | 3 | 38036807 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 2.44e-6 | 0.02 | 7257 | gtex_brain_ba24 |
RS9829569 | 3 | 38038329 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 2.45e-6 | 0.02 | 8779 | gtex_brain_ba24 |
RS928807 | 3 | 38042182 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 2.467E-6 | 0.02 | 12632 | gtex_brain_ba24 |
RS9311172 | 3 | 38044143 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 2.481E-6 | 0.02 | 14593 | gtex_brain_ba24 |
RS9875248 | 3 | 38044592 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 2.484e-6 | 0.02 | 15042 | gtex_brain_ba24 |
RS6793254 | 3 | 38044951 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 2.496E-6 | 0.02 | 15401 | gtex_brain_ba24 |
RS6769106 | 3 | 38044969 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 2.496E-6 | 0.02 | 15419 | gtex_brain_ba24 |
RS9311173 | 3 | 38045528 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 2.501E-6 | 0.02 | 15978 | gtex_brain_ba24 |
RS9843506 | 3 | 38046023 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 2.505E-6 | 0.02 | 16473 | gtex_brain_ba24 |
RS9311176 | 3 | 38047607 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 2.516E-6 | 0.02 | 18057 | gtex_brain_ba24 |
RS6776745 | 3 | 38004661 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 3.742E-7 | 0 | -24889 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6801985 | 3 | 38005183 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 3.742E-7 | 0 | -24367 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1573291 | 3 | 38009749 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 3.713E-7 | 0 | -19801 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9826470 | 3 | 38019428 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 9.025e-10 | 0 | -10122 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11717282 | 3 | 38019924 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 5.642e-8 | 0 | -9626 | gtex_brain_putamen_basal |
RS10095 | 3 | 38023553 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 1.281E-8 | 0 | -5997 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11129775 | 3 | 38024408 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 1.281E-8 | 0 | -5142 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11709029 | 3 | 38024420 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 1.281E-8 | 0 | -5130 | gtex_brain_putamen_basal |
RS60500371 | 3 | 38025750 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 1.281E-8 | 0 | -3800 | gtex_brain_putamen_basal |
RS73825449 | 3 | 38025991 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 1.281E-8 | 0 | -3559 | gtex_brain_putamen_basal |
RS17037286 | 3 | 38026387 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 5.178e-8 | 0 | -3163 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11711286 | 3 | 38026652 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 9.725e-9 | 0 | -2898 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11715511 | 3 | 38026914 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 9.144e-9 | 0 | -2636 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11719260 | 3 | 38027101 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 1.281E-8 | 0 | -2449 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11712625 | 3 | 38028345 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 3.693E-9 | 0 | -1205 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11713558 | 3 | 38028614 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 2.941E-7 | 0 | -936 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11129776 | 3 | 38028675 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 1.281E-8 | 0 | -875 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11922163 | 3 | 38028851 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 1.281E-8 | 0 | -699 | gtex_brain_putamen_basal |
RS56264852 | 3 | 38030567 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 3.826e-7 | 0 | 1017 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11715770 | 3 | 38030747 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 3.127E-13 | 0 | 1197 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7632911 | 3 | 38030899 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 5.274E-15 | 0 | 1349 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7644531 | 3 | 38030933 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 5.256e-15 | 0 | 1383 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11715803 | 3 | 38031020 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 2.169E-8 | 0 | 1470 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7611147 | 3 | 38031372 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 1.215E-9 | 0 | 1822年 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9872804 | 3 | 38033462 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 5.312e-15 | 0 | 3912 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7648182 | 3 | 38035508 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 1.195E-10 | 0 | 5958 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9823482 | 3 | 38036807 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 5.087e-15 | 0 | 7257 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9829569 | 3 | 38038329 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 4.972E-15 | 0 | 8779 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6809649 | 3 | 38038982 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 1.152E-10 | 0 | 9432 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6550514 | 3 | 38039187 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 1.149E-10 | 0 | 9637 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7641519 | 3 | 38039302 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 1.428e-10 | 0 | 9752 | gtex_brain_putamen_basal |
RS928807 | 3 | 38042182 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 5.453e-15 | 0 | 12632 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9843296 | 3 | 38043904 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 2.45e-10 | 0 | 14354 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9311172 | 3 | 38044143 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 4.781E-15 | 0 | 14593 | gtex_brain_putamen_basal |
RS146852558 | 3 | 38044327 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 8.138E-11 | 0 | 14777 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9875248 | 3 | 38044592 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 4.765e-15 | 0 | 15042 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6793254 | 3 | 38044951 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 4.75e-15 | 0 | 15401 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6769106 | 3 | 38044969 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 4.75e-15 | 0 | 15419 | gtex_brain_putamen_basal |
rs35261592 | 3 | 38044996 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 7.151e-11 | 0 | 15446 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9311173 | 3 | 38045528 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 4.717E-15 | 0 | 15978 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9843506 | 3 | 38046023 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 4.703E-15 | 0 | 16473 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9311175 | 3 | 38047211 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 7.142e-11 | 0 | 17661 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9311176 | 3 | 38047607 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 4.657E-15 | 0 | 18057 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9816693 | 3 | 38047954 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 1.145e-10 | 0 | 18404 | gtex_brain_putamen_basal |
RS57208122 | 3 | 38049029 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 2.397E-9 | 0 | 19479 | gtex_brain_putamen_basal |
RS113213588 | 3 | 38050159 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 5.855e-8 | 0 | 20609 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9857730 | 3 | 38051941 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 8.71e-14 | 0 | 22391 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9842880 | 3 | 38052613 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 9.087e-10 | 0 | 23063 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9758003 | 3 | 38053206 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 8.926e-10 | 0 | 23656 | gtex_brain_putamen_basal |
RS57948844 | 3 | 38053322 | 维尔 | ENSG00000136059.10 | 1.574E-9 | 0 | 23772 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003779 | 肌动蛋白结合 | IEA | - | |
去:0005509 | 钙离子结合 | IEA | - | |
去:0005200 | 细胞骨架的结构成分 | 塔斯 | 9179494 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007010 | 细胞骨架组织 | IEA | - | |
去:0051016 | 带刺肌动蛋白细丝封盖 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0015629 | 肌动蛋白细胞骨架 | 塔斯 | 9179494 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Sengupta鼻咽癌DN | 349 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Borczuk恶性间皮瘤DN | 104 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vecchi胃癌先进与早期DN | 138 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
血清剥夺的Graessmann凋亡 | 552 | 347 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heidenblad Amplicon 12P11 12 DN | 30 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌正常 | 476 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHYLA CBFA2T3靶向 | 387 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
前列腺癌模型中的Acevedo FGFR1靶标 | 289 | 184 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林乳腺干细胞DN | 428 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |