基因页:PBX3
概括?
基因 | 5090 |
象征 | PBX3 |
同义词 | - |
描述 | 前B细胞白血病HONEOBOX 3 |
参考 | MIM:176312|HGNC:HGNC:8634|ENSEMBL:ENSG00000167081|HPRD:15938|Vega:Otthumg00000020684 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 9q33.3 |
Pascal P值 | 0.001 |
Sherlock P值 | 0.37 |
胎儿β | 0.498 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 皮质 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG04794505 | 9 | 128508709 | PBX3 | -0.027 | 0.25 | DMG:Nishioka_2013 | |
CG09429153 | 9 | 128509852 | PBX3 | -0.021 | 0.93 | DMG:Nishioka_2013 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS10753758 | CHR1 | 162089330 | PBX3 | 5090 | 0.16 | 反式 | ||
RS1981925 | CHR4 | 34348578 | PBX3 | 5090 | 0 | 反式 | ||
RS1481721 | CHR8 | 3614304 | PBX3 | 5090 | 0.06 | 反式 | ||
RS10979495 | Chr9 | 111554622 | PBX3 | 5090 | 0.18 | 反式 | ||
RS11044062 | CHR12 | 8371319 | PBX3 | 5090 | 0.09 | 反式 | ||
RS322609 | CHR16 | 63875352 | PBX3 | 5090 | 0.15 | 反式 | ||
RS7268640 | CHR20 | 47150267 | PBX3 | 5090 | 4.55e-4 | 反式 | ||
RS7062071 | Chrx | 17724830 | PBX3 | 5090 | 0.04 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FMN1 | 0.91 | 0.76 |
Gabra1 | 0.90 | 0.84 |
GABRB2 | 0.90 | 0.70 |
diras2 | 0.90 | 0.79 |
Mkx | 0.90 | 0.74 |
KCNH1 | 0.89 | 0.79 |
AC110760.2 | 0.89 | 0.78 |
CACNB4 | 0.89 | 0.67 |
htr2a | 0.88 | 0.80 |
HCN1 | 0.88 | 0.56 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FADS2 | -0.48 | -0.51 |
Bcl7c | -0.48 | -0.65 |
SEMA4B | -0.46 | -0.54 |
AC006276.2 | -0.44 | -0.45 |
GPR125 | -0.44 | -0.40 |
traf4 | -0.44 | -0.63 |
RPL23A | -0.43 | -0.59 |
NME4 | -0.43 | -0.59 |
SH3BP2 | -0.43 | -0.63 |
cdc42ep4 | -0.42 | -0.46 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 6hr的Takeda目标 | 85 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 3D的Takeda目标 | 182 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1突变签名1向上 | 276 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1突变签名2向上 | 139 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan mll签名1 | 380 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名2 UP | 418 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1签名3 | 341 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应表皮DN | 508 | 354 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌 | 443 | 294 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Berenjeno由Rhoa转变为可逆DN | 29 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindgren膀胱癌群集1 | 121 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindgren膀胱癌簇2A DN | 141 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
berenjeno由Rhoa Up Troment | 536 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riz红细胞分化hemgn | 31 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RIZ红细胞分化12小时 | 43 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN | 514 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gruetzmann胰腺癌DN | 203 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
co牛MYCN目标 | 43 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向 | 769 | 437 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pomeroy髓母细胞瘤脱毛质vs经典DN | 59 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ross AML带有MLL融合 | 78 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yao Hoxa10通过孕酮靶向 | 79 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NPM1本地化的Alcalay AML | 140 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 DN | 163 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NPM1的Verhaak AML突变 | 183 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FAELT B CLL具有VH重排DN | 48 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vernell视网膜母细胞瘤路径 | 70 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nguyen Notch1靶向DN | 86 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chiaretti急性淋巴细胞白血病ZAP70 | 67 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Radmacher AML预后 | 78 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
用VH3 21 DN的FAELT B CLL | 49 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McClung Creb1靶向DN | 57 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DASU IL6信号疤痕向上 | 30 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
welcsh brca1靶向 | 198 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成生7 | 51 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Xu GH1自分泌目标 | 268 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sesto对UV C5的反应 | 46 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性5 | 482 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Massarweh tamoxifen抗性 | 578 | 341 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 | 354 | 216 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗斯白血病与MLL融合 | 78 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍夫曼不成熟到成熟的B淋巴细胞 | 43 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
flt3 itd的valk aml | 40 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML与T 9 11易位 | 130 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML与11q23重新排列 | 351 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gutierrez慢性淋巴细胞性白血病DN | 56 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kasler HDAC7靶向1个 | 194 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ewsr1 fli1融合的骨靶标 | 271 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN | 448 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
前列腺癌模型中的Acevedo FGFR1靶标 | 289 | 184 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |