概括
基因 5090
象征 PBX3
同义词 -
描述 前B细胞白血病HONEOBOX 3
参考 MIM:176312|HGNC:HGNC:8634|ENSEMBL:ENSG00000167081|HPRD:15938|Vega:Otthumg00000020684
基因类型 蛋白质编码
地图位置 9q33.3
Pascal P值 0.001
Sherlock P值 0.37
胎儿β 0.498
DMG 1(#研究)
主持人 皮质
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG04794505 9 128508709 PBX3 -0.027 0.25 DMG:Nishioka_2013
CG09429153 9 128509852 PBX3 -0.021 0.93 DMG:Nishioka_2013

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS10753758 CHR1 162089330 PBX3 5090 0.16 反式
RS1981925 CHR4 34348578 PBX3 5090 0 反式
RS1481721 CHR8 3614304 PBX3 5090 0.06 反式
RS10979495 Chr9 111554622 PBX3 5090 0.18 反式
RS11044062 CHR12 8371319 PBX3 5090 0.09 反式
RS322609 CHR16 63875352 PBX3 5090 0.15 反式
RS7268640 CHR20 47150267 PBX3 5090 4.55e-4 反式
RS7062071 Chrx 17724830 PBX3 5090 0.04 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FMN1 0.91 0.76
Gabra1 0.90 0.84
GABRB2 0.90 0.70
diras2 0.90 0.79
Mkx 0.90 0.74
KCNH1 0.89 0.79
AC110760.2 0.89 0.78
CACNB4 0.89 0.67
htr2a 0.88 0.80
HCN1 0.88 0.56
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FADS2 -0.48 -0.51
Bcl7c -0.48 -0.65
SEMA4B -0.46 -0.54
AC006276.2 -0.44 -0.45
GPR125 -0.44 -0.40
traf4 -0.44 -0.63
RPL23A -0.43 -0.59
NME4 -0.43 -0.59
SH3BP2 -0.43 -0.63
cdc42ep4 -0.42 -0.46

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 6hr的Takeda目标 85 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 3D的Takeda目标 182 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1突变签名1向上 276 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1突变签名2向上 139 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan mll签名1 380 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 UP 418 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1签名3 341 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应表皮DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌 443 294 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Berenjeno由Rhoa转变为可逆DN 29 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌群集1 121 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇2A DN 141 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
berenjeno由Rhoa Up Troment 536 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riz红细胞分化hemgn 31 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RIZ红细胞分化12小时 43 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN 514 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gruetzmann胰腺癌DN 203 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
co牛MYCN目标 43 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向 769 437 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pomeroy髓母细胞瘤脱毛质vs经典DN 59 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ross AML带有MLL融合 78 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yao Hoxa10通过孕酮靶向 79 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1本地化的Alcalay AML 140 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 DN 163 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1的Verhaak AML突变 183 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FAELT B CLL具有VH重排DN 48 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vernell视网膜母细胞瘤路径 70 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nguyen Notch1靶向DN 86 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chiaretti急性淋巴细胞白血病ZAP70 67 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Radmacher AML预后 78 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
用VH3 21 DN的FAELT B CLL 49 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McClung Creb1靶向DN 57 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DASU IL6信号疤痕向上 30 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
welcsh brca1靶向 198 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生7 51 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Xu GH1自分泌目标 268 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sesto对UV C5的反应 46 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性5 482 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh tamoxifen抗性 578 341 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 354 216 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌DN 540 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗斯白血病与MLL融合 78 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍夫曼不成熟到成熟的B淋巴细胞 43 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
flt3 itd的valk aml 40 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML与T 9 11易位 130 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML与11q23重新排列 351 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gutierrez慢性淋巴细胞性白血病DN 56 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kasler HDAC7靶向1个 194 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ewsr1 fli1融合的骨靶标 271 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN 448 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因
前列腺癌模型中的Acevedo FGFR1靶标 289 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因