概括
基因 5093
象征 PCBP1
同义词 HEL-S-85 | hnrpe1 | hnrpx | hnrnp-e1 | hnrnp-x
描述 聚(RC)结合蛋白1
参考 MIM:601209|HGNC:HGNC:8647|ENSEMBL:ENSG00000169564|HPRD:03128|Vega:Otthumg00000129645
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2P13-P12
Pascal P值 0.091
Sherlock P值 0.011
胎儿β 0.087
支持 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2CDB.HUMAN_TAP-PSD-95核

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
nfib 0.90 0.80
myo5b 0.89 0.79
Sox5 0.89 0.84
FEZF2 0.88 0.81
ITSN1 0.87 0.76
USP6NL 0.87 0.80
PELI2 0.87 0.72
ZFPM2 0.86 0.76
XPR1 0.86 0.77
Bcl11a 0.86 0.72
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
serpinb6 -0.53 -0.60
C5orf53 -0.52 -0.65
FXYD1 -0.50 -0.71
HLA-F -0.50 -0.61
AF347015.27 -0.49 -0.70
TNFSF12 -0.49 -0.48
S100B -0.49 -0.68
AF347015.31 -0.49 -0.71
AIFM3 -0.49 -0.62
HDDC2 -0.49 -0.48

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg剪接体 128 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
含有前mRNA的封顶内含子的反应组处理 140 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome mRNA处理 161 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome mRNA剪接 111 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bidus转移 214 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞 530 342 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rahman TP53靶向磷酸化 21 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath SOX2目标 734 436 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭谷氨酰胺剥夺DN 337 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEI MYB目标 318 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MariaDason对姜黄素Sulindac 7的反应 19 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性 374 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马滕斯三维诺蛋白响应DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad2或Smad3的Koinuma目标 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1和SATB1的Purbey目标 87 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
boudoukha由IGF2BP2绑定 111 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍尔曼泼尼松龙抗性B 22 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍尔曼泼尼松龙的抗性 19 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因