基因页:PCBP1
概括?
基因 | 5093 |
象征 | PCBP1 |
同义词 | HEL-S-85 | hnrpe1 | hnrpx | hnrnp-e1 | hnrnp-x |
描述 | 聚(RC)结合蛋白1 |
参考 | MIM:601209|HGNC:HGNC:8647|ENSEMBL:ENSG00000169564|HPRD:03128|Vega:Otthumg00000129645 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2P13-P12 |
Pascal P值 | 0.091 |
Sherlock P值 | 0.011 |
胎儿β | 0.087 |
支持 | G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_TAP-PSD-95核 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PCBP1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
nfib | 0.90 | 0.80 |
myo5b | 0.89 | 0.79 |
Sox5 | 0.89 | 0.84 |
FEZF2 | 0.88 | 0.81 |
ITSN1 | 0.87 | 0.76 |
USP6NL | 0.87 | 0.80 |
PELI2 | 0.87 | 0.72 |
ZFPM2 | 0.86 | 0.76 |
XPR1 | 0.86 | 0.77 |
Bcl11a | 0.86 | 0.72 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
serpinb6 | -0.53 | -0.60 |
C5orf53 | -0.52 | -0.65 |
FXYD1 | -0.50 | -0.71 |
HLA-F | -0.50 | -0.61 |
AF347015.27 | -0.49 | -0.70 |
TNFSF12 | -0.49 | -0.48 |
S100B | -0.49 | -0.68 |
AF347015.31 | -0.49 | -0.71 |
AIFM3 | -0.49 | -0.62 |
HDDC2 | -0.49 | -0.48 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg剪接体 | 128 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
含有前mRNA的封顶内含子的反应组处理 | 140 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome mRNA处理 | 161 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome mRNA剪接 | 111 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bidus转移 | 214 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞 | 530 | 342 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rahman TP53靶向磷酸化 | 21 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭谷氨酰胺剥夺DN | 337 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LEI MYB目标 | 318 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MariaDason对姜黄素Sulindac 7的反应 | 19 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王肿瘤的侵入性 | 374 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马滕斯三维诺蛋白响应DN | 841 | 431 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1和SATB1的Purbey目标 | 87 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
boudoukha由IGF2BP2绑定 | 111 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍尔曼泼尼松龙抗性B | 22 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍尔曼泼尼松龙的抗性 | 19 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |