概括
基因 5095
象征 PCCA
同义词 -
描述 丙二酮-COA羧化酶α亚基
参考 MIM:232000|HGNC:HGNC:8653|Ensembl:ENSG00000175198|HPRD:01981|Vega:Otthumg0000000017284
基因类型 蛋白质编码
地图位置 13Q32
Pascal P值 0.779
Sherlock P值 0.064
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG09977852 13 101178575 PCCA 2.89E-5 0.549 0.018 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS7132482 CHR12 64745312 PCCA 5095 0.05 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
PPP5C 0.90 0.88
AGPAT1 0.89 0.88
BTBD2 0.88 0.87
STK25 0.88 0.84
SNAP47 0.88 0.84
GSK3A 0.88 0.85
REEP2 0.88 0.88
TCF25 0.88 0.84
katnb1 0.87 0.82
arfip2 0.87 0.81
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.75 -0.65
MT-CO2 -0.70 -0.57
AF347015.8 -0.69 -0.58
AF347015.31 -0.69 -0.58
AL139819.3 -0.68 -0.66
AF347015.2 -0.68 -0.55
AF347015.33 -0.67 -0.57
mt-cyb -0.67 -0.55
AF347015.27 -0.67 -0.60
AF347015.18 -0.66 -0.58

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg Valine亮氨酸和异亮氨酸降解 44 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg丙酸代谢 33 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组线粒体脂肪酸β氧化 14 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组脂肪酸三酰甘油和酮体代谢 168 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
家长mtor信号向上 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX FOXO1融合的Davicioni目标 255 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
莱茵所有糖皮质激素治疗DN 362 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1目标8小时DN 129 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Provenzani转移 194 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWS FLI1融合DN的Siligan目标 18 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈马凋亡通过Trail Up 584 356 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 XPCS DN 88 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 261 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯对trabectedin的反应 50 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血中间祖先 149 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯RB1靶向 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53靶向 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha Human Mitodb 6 2002 429 260 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha线粒体 447 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向 395 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S3 266 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向 504 321 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG RXRA与H4K20me1标记结合 145 82 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Alfano MYC目标 239 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因