基因页：PCDH8

Summary？
GeneID 5100
象征 PCDH8
同义词 Arcadlin | PAPC
描述 原钙粘蛋白8
参考 MIM：603580|HGNC：HGNC：8660|Ensembl：ENSG00000136099|HPRD：04660|Vega：Otthumg0000000016979
基因类型 蛋白质编码
地图位置 13Q21.1
Pascal P值 2.078e-5
胎儿β -0.882
DMG 1（＃研究）

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 1
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法（Sun等。2008），协会研究 1 链接到Szgene
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
cg09823679 13 53425813 PCDH8 1.02E-7 -0.01 2.25e-5 DMG：JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005509 钙离子结合 IEA -
去：0005515 蛋白质结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0001756 体型发生 IEA -
去：0007155 细胞粘附 IEA -
去：0007156 同粒细胞粘附 IEA -
去：0007267 细胞细胞信号传导 塔斯 9787079
GO：0016331 胚胎上皮的形态发生 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005886 质膜 塔斯 9787079
去：0005887 质膜的积分 塔斯 9787079

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Lee神经Crest干细胞向上 146 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IGF1和IGF2的Pacher靶标 35 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发12小时DN 57 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
staege ewing家庭肿瘤 33 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
铃木对TSA和Decitabine 1A的反应 23 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2向上 428 266 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村转移 47 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
具有H3K4ME3和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 142 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAGI AML WITH INV 16 TRANSLOCATION 422 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP，带有H3K4ME3和H3K27ME3 210 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马顿人维甲酸的反应 857 456 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 549 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向DN 553 343 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1的Purbey目标不是SATB1 DN 448 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Alfano MYC目标 239 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-101 140 146 M8 hsa-miR-101 uacaguacugauaacugaag
mir-124.1 97 103 M8 HSA-MIR-124A UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-124/506 96 103 1A，M8 HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-129-5p 374 380 1a HSA-MIR-129脑 cuuuuugcgguggggcuugc
HSA-MIR-129-5P cuuuuugcgguggggcuugcu
mir-141/200a 68 74 M8 HSA-MIR-141 UAACACUGUCUGGUAAAGAUGG
HSA-MIR-200A uaacacugucuguguguguaaacgaugu
mir-153 86 92 1a HSA-MIR-153 Uugcauagucacaaaaguga
mir-182 350 357 1A，M8 HSA-MIR-182 uuuggcaaugguagaacucaca
HSA-MIR-182 uuuggcaaugguagaacucaca
MiR-200BC/429 198 204 M8 HSA-MIR-200B uaauacugccugguaaugaugac
HSA-MIR-200C uaauacugccggguaaugaugg
HSA-MIR-429 uaauacuguguguguguguaaaaaccgu
mir-217 196 202 1a HSA-MIR-217 uacugcaucagaacugauuggau
mir-218 549 555 M8 HSA-MIR-218脑 uugugcuugaucuaaccaugu
mir-31 453 459 1a HSA-MIR-31 Aggcaagaugcuggcauagcug
mir-381 293 299 1a HSA-MIR-381 uauacaagggcaagcucucugu
mir-410 312 318 M8 HSA-MIR-410 aauauaacacagauggcugu
HSA-MIR-410 aauauaacacagauggcugu
mir-448 85 92 1A，M8 HSA-MIR-448 uugcauauguaggauguccccau
mir-452 155 162 1A，M8 HSA-MIR-452 UguuugcaggaaacugagaC
miR-495 309 315 1a HSA-MIR-495脑 Aaacaaacauggugcacuuuuu
miR-96 351 357 1a HSA-MIR-96脑 uuuggcacuagcacauuuuugc