概括
基因 51010
象征 exosc3
同义词 CGI-102 | PCH1B | RRP40 | RRP40P | BA3J10.7 | HRRP-40 | P10
描述 外泌体组件3
参考 MIM:606489|HGNC:HGNC:17944|ENSEMBL:ENSG00000107371|HPRD:16220|Vega:Otthumg0000000019932
基因类型 蛋白质编码
地图位置 9P11
Pascal P值 0.098
Sherlock P值 0.159
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1364669 CHR2 53452494 exosc3 51010 0.18 反式
RS4789947 CHR17 77135790 exosc3 51010 0.15 反式
RS1795952 CHR17 77136677 exosc3 51010 0.15 反式
RS2707040 CHR17 77136833 exosc3 51010 0.15 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
dis3 DKFZP667L1817 |exosc11 |FLJ10484 |KIAA1008 |MGC33035 |RP11-342J4.3 |RRP44 |BA555G22.1 |dis3p DIS3有丝分裂控制同源物(S. cerevisiae) - HPRD 12419256
exosc1 CGI-108 |CSL4 |CSL4P |Ski4 |Ski4p |HCSL4P |P13 外泌体组件1 - HPRD 11812149|12419256
Exosc10 PM-SCL |PM/SCL-100 |PMSCL |PMSCL2 |RRP6 |RRP6P |P2 |P3 |P4 外泌体组件10 - HPRD 11110791|12419256
exosc2 RRP4 |RRP4P |HRRP4P |P7 外泌体组件2 - HPRD 11110791|12419256
exosc4 FLJ20591 |RRP41 |RRP41A |RRP41P |Ski6 |Ski6p |HRRP41P |P12A 外泌体组件4 - HPRD 11110791|12419256
exosc5 MGC111224 |MGC12901 |RRP41B |RRP46 |RRP46P |HRRP46P |P12B 外泌体组件5 - HPRD 11110791|12419256 | 12419256
exosc5 MGC111224 |MGC12901 |RRP41B |RRP46 |RRP46P |HRRP46P |P12B 外泌体组件5 HRRP40P与HRRP46P相互作用。 绑定 12419256
exosc6 EAP4 |mtr3 |mtr3p |HMTR3P |P11 外泌体组件6 - HPRD 12419256
exosc7 EAP1 |FLJ26543 |KIAA0116 |RRP42 |RRP42P |HRRP42P |P8 外泌体组件7 - HPRD 11879549|12419256
exosc8 CIP3 |EAP2 |OIP2 |RP11-421P11.3 |RRP43 |RRP43P |BA421P11.3 |P9 外泌体组件8 - HPRD 12419256
exosc9 PM/SCL-75 |PMSCL1 |RRP45 |RRP45P |P5 |P6 外泌体组件9 - HPRD 12419256
KHSRP FBP2 |fubp2 |KSRP |MGC99676 KH型剪接调节蛋白 - HPRD 11719186|15175153 | 15175153
KHSRP FBP2 |fubp2 |KSRP |MGC99676 KH型剪接调节蛋白 KSRP与HRRP40P相互作用。 绑定 15175153


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KeGG RNA降解 59 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome糖尿病途径 133 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Perk调控基因表达 29 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ATF4对基因激活的反应组激活 26 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome展开的蛋白质反应 80 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
mRNA的反应组代谢 284 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome mRNA衰减3至5个驱虫核酸酶 11 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome deadenylation依赖mRNA衰减 48 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
READEM RNA的代谢 330 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRF1对mRNA的反应组不稳定 17 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过结合富元元素的蛋白质对mRNA稳定性的反应组调节 84 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KSRP对mRNA的反应组不稳定 17 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tristraprolin TTP对mRNA的反应组不稳定 17 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向DN 1024 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mueller Plurinet 299 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇2向上 54 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇3 170 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇4 112 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇6 140 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇7 118 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1和SATB1 DN的Purbey目标 180 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因