基因页:exosc3
概括?
基因 | 51010 |
象征 | exosc3 |
同义词 | CGI-102 | PCH1B | RRP40 | RRP40P | BA3J10.7 | HRRP-40 | P10 |
描述 | 外泌体组件3 |
参考 | MIM:606489|HGNC:HGNC:17944|ENSEMBL:ENSG00000107371|HPRD:16220|Vega:Otthumg0000000019932 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 9P11 |
Pascal P值 | 0.098 |
Sherlock P值 | 0.159 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1364669 | CHR2 | 53452494 | exosc3 | 51010 | 0.18 | 反式 | ||
RS4789947 | CHR17 | 77135790 | exosc3 | 51010 | 0.15 | 反式 | ||
RS1795952 | CHR17 | 77136677 | exosc3 | 51010 | 0.15 | 反式 | ||
RS2707040 | CHR17 | 77136833 | exosc3 | 51010 | 0.15 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/EXOSC3_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
dis3 | DKFZP667L1817 |exosc11 |FLJ10484 |KIAA1008 |MGC33035 |RP11-342J4.3 |RRP44 |BA555G22.1 |dis3p | DIS3有丝分裂控制同源物(S. cerevisiae) | - | HPRD | 12419256 |
exosc1 | CGI-108 |CSL4 |CSL4P |Ski4 |Ski4p |HCSL4P |P13 | 外泌体组件1 | - | HPRD | 11812149|12419256 |
Exosc10 | PM-SCL |PM/SCL-100 |PMSCL |PMSCL2 |RRP6 |RRP6P |P2 |P3 |P4 | 外泌体组件10 | - | HPRD | 11110791|12419256 |
exosc2 | RRP4 |RRP4P |HRRP4P |P7 | 外泌体组件2 | - | HPRD | 11110791|12419256 |
exosc4 | FLJ20591 |RRP41 |RRP41A |RRP41P |Ski6 |Ski6p |HRRP41P |P12A | 外泌体组件4 | - | HPRD | 11110791|12419256 |
exosc5 | MGC111224 |MGC12901 |RRP41B |RRP46 |RRP46P |HRRP46P |P12B | 外泌体组件5 | - | HPRD | 11110791|12419256 | 12419256 |
exosc5 | MGC111224 |MGC12901 |RRP41B |RRP46 |RRP46P |HRRP46P |P12B | 外泌体组件5 | HRRP40P与HRRP46P相互作用。 | 绑定 | 12419256 |
exosc6 | EAP4 |mtr3 |mtr3p |HMTR3P |P11 | 外泌体组件6 | - | HPRD | 12419256 |
exosc7 | EAP1 |FLJ26543 |KIAA0116 |RRP42 |RRP42P |HRRP42P |P8 | 外泌体组件7 | - | HPRD | 11879549|12419256 |
exosc8 | CIP3 |EAP2 |OIP2 |RP11-421P11.3 |RRP43 |RRP43P |BA421P11.3 |P9 | 外泌体组件8 | - | HPRD | 12419256 |
exosc9 | PM/SCL-75 |PMSCL1 |RRP45 |RRP45P |P5 |P6 | 外泌体组件9 | - | HPRD | 12419256 |
KHSRP | FBP2 |fubp2 |KSRP |MGC99676 | KH型剪接调节蛋白 | - | HPRD | 11719186|15175153 | 15175153 |
KHSRP | FBP2 |fubp2 |KSRP |MGC99676 | KH型剪接调节蛋白 | KSRP与HRRP40P相互作用。 | 绑定 | 15175153 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KeGG RNA降解 | 59 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome糖尿病途径 | 133 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Perk调控基因表达 | 29 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ATF4对基因激活的反应组激活 | 26 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome展开的蛋白质反应 | 80 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
mRNA的反应组代谢 | 284 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome mRNA衰减3至5个驱虫核酸酶 | 11 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome deadenylation依赖mRNA衰减 | 48 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
READEM RNA的代谢 | 330 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BRF1对mRNA的反应组不稳定 | 17 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过结合富元元素的蛋白质对mRNA稳定性的反应组调节 | 84 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KSRP对mRNA的反应组不稳定 | 17 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tristraprolin TTP对mRNA的反应组不稳定 | 17 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mueller Plurinet | 299 | 189 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇2向上 | 54 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇3 | 170 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇4 | 112 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇6 | 140 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇7 | 118 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1和SATB1 DN的Purbey目标 | 180 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |