基因页：CCDC53
概括？
| 基因 | 51019 |
| 象征 | CCDC53 |
| 同义词 | CGI-116 |
| 描述 | 包含53 |
| 参考 | HGNC：HGNC：24256|ENSEMBL：ENSG00000120860|HPRD：13031|Vega：Otthumg00000168187 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 12q23.2 |
| Pascal P值 | 0.606 |
| Sherlock P值 | 0.059 |
| 胎儿β | -0.588 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 皮质 下丘脑 伏隔核基底神经节 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
| 网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献：0.0105 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG16884940 | 12 | 102455204 | CCDC53 | 3.59e-8 | -0.021 | 1.05e-5 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003674 | Molecular_Function | nd | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0008150 | 生物_Process | nd | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005575 | cellular_component | nd | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| ABI2 | Abi-2 |ABI2B |AIP-1 |ablbp3 |SSH3BP2 |argbpia |argbpib | ABL Interactor 2 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| GDF9 | - | 生长分化因子9 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
| HSBP1 | DKFZP686D1664 |DKFZP686O24200 |NPC-A-13 | 热休克因子结合蛋白1 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| KRT6A | CK6A |CK6C |CK6D |k6a |K6C |k6d |Krt6c |KRT6D | 角蛋白6a | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| LAMC1 | lamb2 |MGC87297 | 拉明蛋白，伽玛1（以前为lamb2） | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
| luc7l2 | CGI-59 |CGI-74 |FLJ10657 |luc7b2 | Luc7样2（S. cerevisiae） | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
| MCRS1 | ICP22bp |INO80Q |MCRS2 |MSP58 |P78 | 微球蛋白1 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| NDC80 | Hec |Hec1 |kntc2 |tid3 |HSNDC80 | NDC80同源物，动力学复合物成分（S. cerevisiae） | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| NUP62 | DKFZP547L134 |FLJ20822 |FLJ43869 |IBSN |MGC841 |sndi |p62 | 核孔蛋白62KDA | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| OPTN | fip2 |Glc1e |hip7 ||NRP |tfiiia-intp | Optineurin | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| PBXIP1 | HPIP | 前B细胞白血病同型相互作用蛋白1 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| PCM1 | PTC4 | 丁香三醇材料1 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| PLDN | PA |苍白 | pallidin同源物（鼠标） | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
| PTN | 竖琴|HBGF8 |hbnf |negf1 | pleiotiotirophin | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Davicioni分子臂与ERMS | 332 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 刘cmyb靶向 | 165 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 刘vmyb的目标 | 127 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| UDayakumar Med1靶向DN | 240 | 171 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| hahtola兄弟姐妹fungoides CD4 DN | 116 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Berenjeno由Rhoa DN转变 | 394 | 258 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Teramoto OPN目标集群5 | 7 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KIM MYCN扩增靶向DN | 103 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten Nipp1靶向 | 769 | 437 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甜蜜的克拉斯靶向 | 84 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boyault肝癌子类G6 UP | 65 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 清肝癌子类CTNNB1 UP | 176 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝母细胞瘤课程DN | 210 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 | 445 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chicas RB1目标增长 | 243 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chicas RB1目标汇合 | 567 | 365 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |