基因页：VPS36
概括？
| 基因 | 51028 |
| 象征 | VPS36 |
| 同义词 | C13orf9 | CGI-145 | EAP45 |
| 描述 | 液泡蛋白排序36个同源物（S. cerevisiae） |
| 参考 | MIM：610903|HGNC：HGNC：20312|ENSEMBL：ENSG00000136100|HPRD：12620|Vega：Otthumg0000000016964 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 13Q14.3 |
| Pascal P值 | 0.095 |
| Sherlock P值 | 0.01 |
| 胎儿β | 0.683 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG17164340 | 13 | 53025003 | VPS36 | 5.12E-8 | -0.021 | 1.35E-5 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0008289 | 脂质结合 | IEA | - | |
| 去：0043130 | 泛素结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006355 | 调节转录，DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
| 去：0006350 | 转录 | IEA | - | |
| 去：0015031 | 蛋白质运输 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005634 | 核 | IEA | - | |
| 去：0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
| 去：0005764 | 溶酶体 | IEA | - | |
| 去：0005770 | 内体晚期 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG内吞作用 | 183 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome膜贩运 | 129 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组内体分选复合物需要运输escrt | 27 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| igarashi atf4靶向dn | 90 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发6小时DN | 514 | 330 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发和癌症Box4 DN | 32 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 道格拉斯BMI1靶向DN | 314 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| iwanaga癌变由KRAS DN | 120 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 钱德兰转移DN | 306 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gabriely miR21靶标 | 289 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由SALL4同工型绑定的RAO A | 182 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-134 | 2710 | 2716 | 1a | HSA-MIR-134脑 | ugugacuggugaccagaggg |
| mir-29 | 2107 | 2113 | M8 | HSA-MIR-29ASZ | uagcaccaucugaaaucgguu |
| HSA-MIR-29BSZ | uagcaccauuugaaaucaguguu | ||||
| HSA-MIR-29CSZ | uagcaccauuugaaaucggu | ||||
| mir-485-3p | 2859 | 2865 | 1a | HSA-MIR-485-3P | gucauacgggcucucucucucucu |