概括
基因 51065
象征 RPS27L
同义词 -
描述 核糖体蛋白S27喜欢
参考 MIM:612055|HGNC:HGNC:18476|HPRD:18003|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 15Q22.2
Pascal P值 0.002
Sherlock P值 0.269
主持人 前扣带回皮层BA24
尾状基底神经节
小脑半球
小脑
皮质
额叶皮质BA9
海马
下丘脑
伏隔核基底神经节
梭子基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS71393126 15 63394010 RPS27L ENSG00000185088.8 8.396E-7 0 56210 gtex_brain_ba24
RS9788649 15 63422817 RPS27L ENSG00000185088.8 7.48e-8 0 27403 gtex_brain_ba24
RS8039716 15 63431286 RPS27L ENSG00000185088.8 1.573E-10 0 18934 gtex_brain_ba24
RS2088929 15 63432495 RPS27L ENSG00000185088.8 1.579E-10 0 17725 gtex_brain_ba24
RS12898885 15 63435129 RPS27L ENSG00000185088.8 2.387E-9 0 15091 gtex_brain_ba24
RS12899931 15 63435196 RPS27L ENSG00000185088.8 1.579E-10 0 15024 gtex_brain_ba24
RS8027689 15 63436518 RPS27L ENSG00000185088.8 1.579E-10 0 13702 gtex_brain_ba24
RS2729812 15 63436628 RPS27L ENSG00000185088.8 1.756E-7 0 13592 gtex_brain_ba24
RS7172351 15 63437047 RPS27L ENSG00000185088.8 1.579E-10 0 13173 gtex_brain_ba24
RS59322122 15 63437539 RPS27L ENSG00000185088.8 1.579E-10 0 12681 gtex_brain_ba24
RS34738270 15 63438372 RPS27L ENSG00000185088.8 1.579E-10 0 11848 gtex_brain_ba24
RS34661422 15 63438404 RPS27L ENSG00000185088.8 1.579E-10 0 11816 gtex_brain_ba24
RS28679339 15 63438601 RPS27L ENSG00000185088.8 2.387E-9 0 11619 gtex_brain_ba24
RS28363750 15 63438772 RPS27L ENSG00000185088.8 1.579E-10 0 11448 gtex_brain_ba24
RS28850420 15 63438974 RPS27L ENSG00000185088.8 2.424e-9 0 11246 gtex_brain_ba24
RS7169792 15 63440483 RPS27L ENSG00000185088.8 1.579E-10 0 9737 gtex_brain_ba24
RS7169648 15 63440515 RPS27L ENSG00000185088.8 1.218e-10 0 9705 gtex_brain_ba24
RS200545481 15 63440599 RPS27L ENSG00000185088.8 1.218e-10 0 9621 gtex_brain_ba24
RS201476446 15 63440600 RPS27L ENSG00000185088.8 1.942E-9 0 9620 gtex_brain_ba24
RS6494395 15 63441055 RPS27L ENSG00000185088.8 3.945e-11 0 9165 gtex_brain_ba24
RS28588736 15 63441810 RPS27L ENSG00000185088.8 2.246E-10 0 8410 gtex_brain_ba24
RS28394803 15 63443968 RPS27L ENSG00000185088.8 2.387E-9 0 6252 gtex_brain_ba24
RS28678549 15 63444349 RPS27L ENSG00000185088.8 1.579E-10 0 5871 gtex_brain_ba24
RS57838635 15 63444715 RPS27L ENSG00000185088.8 1.636E-10 0 5505 gtex_brain_ba24
RS953978 15 63445144 RPS27L ENSG00000185088.8 2.387E-9 0 5076 gtex_brain_ba24
RS28434769 15 63445764 RPS27L ENSG00000185088.8 1.579E-10 0 4456 gtex_brain_ba24
RS28542166 15 63445872 RPS27L ENSG00000185088.8 1.528e-10 0 4348 gtex_brain_ba24
RS28637229 15 63446012 RPS27L ENSG00000185088.8 1.579E-10 0 4208 gtex_brain_ba24
RS59953192 15 63446199 RPS27L ENSG00000185088.8 1.565E-10 0 4021 gtex_brain_ba24
RS35018260 15 63446332 RPS27L ENSG00000185088.8 7.742e-8 0 3888 gtex_brain_ba24
RS28562564 15 63446598 RPS27L ENSG00000185088.8 1.579E-10 0 3622 gtex_brain_ba24
RS8182067 15 63446934 RPS27L ENSG00000185088.8 1.302E-10 0 3286 gtex_brain_ba24
RS3784677 15 63447198 RPS27L ENSG00000185088.8 1.13e-10 0 3022 gtex_brain_ba24
RS28479880 15 63448154 RPS27L ENSG00000185088.8 7.436e-11 0 2066 gtex_brain_ba24
RS11853249 15 63448471 RPS27L ENSG00000185088.8 6.7e-11 0 1749年 gtex_brain_ba24
RS2270948 15 63448780 RPS27L ENSG00000185088.8 6.479e-11 0 1440 gtex_brain_ba24
RS28377261 15 63449005 RPS27L ENSG00000185088.8 6.161e-11 0 1215 gtex_brain_ba24
RS12902921 15 63449777 RPS27L ENSG00000185088.8 5.575e-11 0 443 gtex_brain_ba24
RS8036501 15 63449865 RPS27L ENSG00000185088.8 3.828e-8 0 355 gtex_brain_ba24
RS8039273 15 63461363 RPS27L ENSG00000185088.8 6.843e-11 0 -11143 gtex_brain_ba24
RS11071734 15 63462617 RPS27L ENSG00000185088.8 5.813E-8 0 -12397 gtex_brain_ba24
RS12903970 15 63466226 RPS27L ENSG00000185088.8 1.393E-7 0 -16006 gtex_brain_ba24
RS71393135 15 63466863 RPS27L ENSG00000185088.8 1.317E-7 0 -16643 gtex_brain_ba24
RS34605284 15 63391465 RPS27L ENSG00000185088.8 5.038e-7 0 58755 gtex_brain_putamen_basal
RS71393126 15 63394010 RPS27L ENSG00000185088.8 2.802E-7 0 56210 gtex_brain_putamen_basal
RS35467520 15 63397560 RPS27L ENSG00000185088.8 2.965e-7 0 52660 gtex_brain_putamen_basal
RS9788649 15 63422817 RPS27L ENSG00000185088.8 1.095E-10 0 27403 gtex_brain_putamen_basal
RS8039716 15 63431286 RPS27L ENSG00000185088.8 1.109E-9 0 18934 gtex_brain_putamen_basal
RS2088929 15 63432495 RPS27L ENSG00000185088.8 1.109E-9 0 17725 gtex_brain_putamen_basal
RS12898885 15 63435129 RPS27L ENSG00000185088.8 4.975E-9 0 15091 gtex_brain_putamen_basal
RS12899931 15 63435196 RPS27L ENSG00000185088.8 1.109E-9 0 15024 gtex_brain_putamen_basal
RS8027689 15 63436518 RPS27L ENSG00000185088.8 1.087E-10 0 13702 gtex_brain_putamen_basal
RS7172351 15 63437047 RPS27L ENSG00000185088.8 1.087E-10 0 13173 gtex_brain_putamen_basal
RS59322122 15 63437539 RPS27L ENSG00000185088.8 1.087E-10 0 12681 gtex_brain_putamen_basal
RS34738270 15 63438372 RPS27L ENSG00000185088.8 1.087E-10 0 11848 gtex_brain_putamen_basal
RS34661422 15 63438404 RPS27L ENSG00000185088.8 1.087E-10 0 11816 gtex_brain_putamen_basal
RS28679339 15 63438601 RPS27L ENSG00000185088.8 7.356e-10 0 11619 gtex_brain_putamen_basal
RS28363750 15 63438772 RPS27L ENSG00000185088.8 1.087E-10 0 11448 gtex_brain_putamen_basal
RS28850420 15 63438974 RPS27L ENSG00000185088.8 8.191E-10 0 11246 gtex_brain_putamen_basal
RS7169792 15 63440483 RPS27L ENSG00000185088.8 1.087E-10 0 9737 gtex_brain_putamen_basal
RS7169648 15 63440515 RPS27L ENSG00000185088.8 9.169e-11 0 9705 gtex_brain_putamen_basal
RS200545481 15 63440599 RPS27L ENSG00000185088.8 9.169e-11 0 9621 gtex_brain_putamen_basal
RS201476446 15 63440600 RPS27L ENSG00000185088.8 6.347E-10 0 9620 gtex_brain_putamen_basal
RS6494395 15 63441055 RPS27L ENSG00000185088.8 5.927E-10 0 9165 gtex_brain_putamen_basal
RS28588736 15 63441810 RPS27L ENSG00000185088.8 6.323e-11 0 8410 gtex_brain_putamen_basal
RS28394803 15 63443968 RPS27L ENSG00000185088.8 7.356e-10 0 6252 gtex_brain_putamen_basal
RS28678549 15 63444349 RPS27L ENSG00000185088.8 1.087E-10 0 5871 gtex_brain_putamen_basal
RS57838635 15 63444715 RPS27L ENSG00000185088.8 1.185e-10 0 5505 gtex_brain_putamen_basal
RS398102528 15 63444868 RPS27L ENSG00000185088.8 1.206E-8 0 5352 gtex_brain_putamen_basal
RS953978 15 63445144 RPS27L ENSG00000185088.8 7.356e-10 0 5076 gtex_brain_putamen_basal
RS28434769 15 63445764 RPS27L ENSG00000185088.8 1.087E-10 0 4456 gtex_brain_putamen_basal
RS28542166 15 63445872 RPS27L ENSG00000185088.8 1.882E-10 0 4348 gtex_brain_putamen_basal
RS28637229 15 63446012 RPS27L ENSG00000185088.8 1.087E-10 0 4208 gtex_brain_putamen_basal
RS59953192 15 63446199 RPS27L ENSG00000185088.8 1.094E-10 0 4021 gtex_brain_putamen_basal
RS35018260 15 63446332 RPS27L ENSG00000185088.8 1.089E-10 0 3888 gtex_brain_putamen_basal
RS28562564 15 63446598 RPS27L ENSG00000185088.8 1.087E-10 0 3622 gtex_brain_putamen_basal
RS8182067 15 63446934 RPS27L ENSG00000185088.8 9.795e-11 0 3286 gtex_brain_putamen_basal
RS3784677 15 63447198 RPS27L ENSG00000185088.8 9.102e-11 0 3022 gtex_brain_putamen_basal
RS28479880 15 63448154 RPS27L ENSG00000185088.8 7.528e-11 0 2066 gtex_brain_putamen_basal
RS11853249 15 63448471 RPS27L ENSG00000185088.8 7.257e-11 0 1749年 gtex_brain_putamen_basal
RS2270948 15 63448780 RPS27L ENSG00000185088.8 5.493e-11 0 1440 gtex_brain_putamen_basal
RS28377261 15 63449005 RPS27L ENSG00000185088.8 5.438e-11 0 1215 gtex_brain_putamen_basal
RS12902921 15 63449777 RPS27L ENSG00000185088.8 5.549e-11 0 443 gtex_brain_putamen_basal
RS8036501 15 63449865 RPS27L ENSG00000185088.8 5.59e-11 0 355 gtex_brain_putamen_basal
RS8039273 15 63461363 RPS27L ENSG00000185088.8 6.577E-7 0 -11143 gtex_brain_putamen_basal
RS11071734 15 63462617 RPS27L ENSG00000185088.8 7.703E-7 0 -12397 gtex_brain_putamen_basal
RS12903970 15 63466226 RPS27L ENSG00000185088.8 6.594E-7 0 -16006 gtex_brain_putamen_basal
RS71393135 15 63466863 RPS27L ENSG00000185088.8 6.59E-7 0 -16643 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg核糖体 88 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID P53下游途径 137 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chandran转移Top50 dn 45 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vecchi胃癌先进与早期DN 138 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoebeke淋巴干细胞DN 86 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wamunyokoli卵巢癌LMP 265 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wamunyokoli卵巢癌等级1 2 137 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇1 DN 378 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kerley对Cisplatin的反应 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johansson神经胶质作用是PDGFB 58 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim Myc放大靶向 201 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 479 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard粉碎和燃烧突变体 197 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
结肠癌中的韦伯甲基化 18 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏没有血液 222 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏 487 303 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江缺氧正常 311 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤课程DN 210 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钱德兰转移DN 306 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WARTERS对IR皮肤的反应 83 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因