基因页:nosip
概括?
基因 | 51070 |
象征 | nosip |
同义词 | CGI-25 |
描述 | 一氧化氮合酶相互作用蛋白 |
参考 | MIM:616759|HGNC:HGNC:17946|ENSEMBL:ENSG00000142546|HPRD:17642|Vega:Otthumg00000183169 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19q13.33 |
Pascal P值 | 1.004e-5 |
Sherlock P值 | 0.986 |
胎儿beta | 0.223 |
DMG | 1(#研究) |
耶和华 | 额叶皮质BA9 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136例对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG01215037 | 19 | 50083917 | nosip | 9.18e-10 | -0.02 | 1.11E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 耶和华 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS17019396 | CHR3 | 2763878 | nosip | 51070 | 0.12 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/NOSIP_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26后概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #SZGR 2.0途径中的基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Reactome Enos激活和调节 | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过CD40 DN的Hollmann凋亡 | 267 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘cmyb靶向 | 165 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
奥斯曼膀胱癌DN | 406 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wamunyokoli卵巢癌LMP | 265 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jazag TGFB1通过SMAD4向上信号传导 | 108 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chang Core血清反应DN | 209 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aguirre胰腺癌复制号 | 298 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner ES ICP与H3K4Me3 | 34 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MEISSNER NPC ICP带有H3K4ME3 | 20 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain ICP带有H3K4ME3 | 32 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gutierrez慢性淋巴细胞性白血病DN | 56 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC ICP,带有H3K4Me3 | 445 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由PML Rara Fusion绑定的Martens | 456 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应很晚 | 317 | 190 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |