概括
基因 51083
象征 gal
同义词 etl8 | gal-gmap | galn | glnn | gmap
描述 Galanin/GMAP预肽
参考 MIM:137035|HGNC:HGNC:4114|ENSEMBL:ENSG0000000069482|HPRD:00658|Vega:Otthumg00000167890
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11q13.3
Pascal P值 0.014
胎儿β -1.932
DMG 1(#研究)
主持人 小脑

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症(FESZ)和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:3

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG08785534 11 68451827 gal -0.026 0.43 DMG:Nishioka_2013


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005184 神经肽激素活性 nas 轴突,突触,大脑,神经递质(GO期限:6) 1722333
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007218 神经肽信号通路 IEA 神经递质(GO期限:8) -
去:0007399 神经系统的发展 IEA 神经突(GO期限:5) -
GO:0030252 生长激素分泌 nas -
去:0006939 平滑肌收缩 nas -
去:0030073 胰岛素分泌 nas 1370155
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005576 细胞外区域 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
GPCR的反应组信号传导 920 449 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组肽配体结合受体 188 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome A1级Rhodopsin喜欢受体 305 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPCR下游信号传导 805 368 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G alpha I信号事件 195 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPCR配体结合 408 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS 579 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KHSV miRNA的Samols目标 8 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
deurig t细胞促进性白血病 368 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Doane乳腺癌ESR1 DN 48 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Scibetta KDM5B靶向DN 81 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nagashima NRG1信号向上发出 176 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞 530 342 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌基础与仙女 330 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
留置权乳腺癌化生型与导管 83 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mohankumar TLX1靶向 414 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Caffarel对THC 24小时5的响应 34 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼头颈癌C 113 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath ES 1 379 235 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌11q12 Q14 Amplicon 158 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
费尔南德斯(Fernandez)由迈克(Myc)约束 182 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bhattacharya胚胎干细胞 89 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tavor Cebpa靶向DN 30 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
takao对UVB辐射的响应 86 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Smarce1靶向DN 371 218 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV全部 120 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV 24小时 93 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染24小时 148 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krasnoselskaya ILF3靶向DN 46 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WELCSH BRCA1靶向DN 141 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时的反应 953 554 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 461 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
骨骼DN中的Smid乳腺癌复发 315 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID乳腺癌腔B DN 564 326 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Frasor对Serm或Fulvestrant DN的响应 50 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
公园APL发病机理DN 50 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 536 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K27Me3 269 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 435 318 该途径中的所有SZGR 2.0基因
korkola胚胎癌与精子瘤 22 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1靶向衰老 572 352 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHYLA CBFA2T3靶向DN 242 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BMI1和PCGF2的Wiederschain目标 57 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2同工型的Pedersen转移1 46 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因