基因页面:APH1A

总结吗?
GeneID 51107年
象征 APH1A
同义词 6530402 n02rik | APH-1 | APH-1A | cgi - 78
描述 aph-1同族体,γ分泌酶亚基
参考 MIM: 607629|HGNC: HGNC: 29509|运用:ENSG00000117362|织女:OTTHUMG00000012545
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 1 p36.13-q31.3
夏洛克假定值 5.287的军医
胎儿β 0.972
DMG 1(#研究)
eGene 尾状基底神经节
支持 生成的信号

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 1
PMID: cooccur 高通量文献检索 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。
GSMA_I 基因组扫描分析 Psr: 0.0235
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) Psr: 0.00814
文学 高通量文献检索 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 点击显示详细信息

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg06766579 1 150242418 APH1A 5.289的军医 0.273 0.048 DMG: Wockner_2014


第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

没有大脑中的基因区域


第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005515 蛋白结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0005515 蛋白结合 新闻学会 12297508
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0042987 淀粉样前体蛋白分解代谢的过程 小鬼 12297508
去:0006509 膜蛋白ectodomain蛋白水解作用 艾达 15274632
去:0007220 切口受体处理 小鬼 12297508
去:0016485 蛋白质的加工 艾达 15274632
去:0016485 蛋白质的加工 国际能源机构 - - - - - -
去:0031293 膜蛋白的胞内域蛋白水解作用 小鬼 12297508
去:0043085 积极的监管的催化活性 艾达 15274632
去:0043085 积极的监管的催化活性 国际能源机构 - - - - - -
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005794 高尔基体 艾达 15274632
去:0005789 内质网的膜 国际能源机构 - - - - - -
去:0005783 内质网 艾达 15274632
去:0016020 膜 国际能源机构 - - - - - -
去:0016021 不可或缺的膜 国际能源机构 - - - - - -
去:0005887 不可或缺的质膜 艾达 15274632

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
KEGG NOTCH信号通路 47 35 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG老年痴呆症病 169年 110年 所有SZGR 2.0基因通路
PID NOTCH通路 59 49 所有SZGR 2.0基因通路
PID PS1通路 46 39 所有SZGR 2.0基因通路
PID我正常途径关系 69年 51 所有SZGR 2.0基因通路
PID SYNDECAN 3通路 17 15 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME信号通过神经生长因子 217年 167年 所有SZGR 2.0基因通路
由ERBB4 REACTOME信号 90年 67年 所有SZGR 2.0基因通路
由ERBB4 REACTOME核信号 38 30. 所有SZGR 2.0基因通路
细胞核REACTOME激活NOTCH1传送信号 27 18 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME信号通过新的高度 12 10 所有SZGR 2.0基因通路
由NOTCH2 REACTOME信号 12 10 所有SZGR 2.0基因通路
由NOTCH1 REACTOME信号 70年 46 所有SZGR 2.0基因通路
由NOTCH3 REACTOME信号 12 10 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME监管P75NTR的蛋白水解作用 10 9 所有SZGR 2.0基因通路
离原子核REACTOME NRIF信号细胞死亡 15 10 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME细胞死亡信号通过NRAGE NRIF和纳德 60 43 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME我正常受体介导信号关系 81年 61年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME信号通过切口 103年 64年 所有SZGR 2.0基因通路
CHARAFE乳腺癌细胞腔的VS间充质 450年 256年 所有SZGR 2.0基因通路
武田的目标NUP98 HOXA9融合16 d 175年 108年 所有SZGR 2.0基因通路
SENESE HDAC1目标了 457年 269年 所有SZGR 2.0基因通路
SENESE HDAC2目标了 114年 66年 所有SZGR 2.0基因通路
SENESE HDAC3目标了 501年 327年 所有SZGR 2.0基因通路
帕蒂尔肝癌 747年 453年 所有SZGR 2.0基因通路
通过SMAD4 JAZAG TGFB1信号 108年 66年 所有SZGR 2.0基因通路
金正日MYCN放大目标 92年 64年 所有SZGR 2.0基因通路
DN NUYTTEN NIPP1目标 848年 527年 所有SZGR 2.0基因通路
洛佩兹MBD的目标 957年 597年 所有SZGR 2.0基因通路
SCHAEFFER前列腺癌发展6小时DN 514年 330年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH NANOG目标 988年 594年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH SOX2目标 734年 436年 所有SZGR 2.0基因通路
瑞士POSTRADIATION肿瘤逃逸 393年 244年 所有SZGR 2.0基因通路
马森受FOXP3刺激 1022年 619年 所有SZGR 2.0基因通路
郑FOXP3目标胸腺DN 12 9 所有SZGR 2.0基因通路
ACEVEDO肝脏肿瘤旁正常组织DN 354年 216年 所有SZGR 2.0基因通路
丰田MIR34B和MIR34C的目标 463年 262年 所有SZGR 2.0基因通路
张乳腺癌祖细胞DN 145年 93年 所有SZGR 2.0基因通路
YOSHIMURA MAPK8目标了 1305年 895年 所有SZGR 2.0基因通路
CHANGOLKAR H2AFY目标了 48 28 所有SZGR 2.0基因通路
DN FORTSCHEGGER PHF8目标 784年 464年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir - 122 522年 528年 1 hsa - mir - 122 a UGGAGUGUGACAAUGGUGUUUGU
miR-204/211 98年 104年 m8 hsa - mir - 204大脑 UUCCCUUUGUCAUCCUAUGCCU
hsa - mir - 211 UUCCCUUUGUCAUCCUUCGCCU
mir - 539 206年 212年 1 hsa - mir - 539 GGAGAAAUUAUCCUUGGUGUGU
hsa - mir - 539 GGAGAAAUUAUCCUUGGUGUGU