基因页:Angptl4
Summary?
GeneID | 51129 |
Symbol | Angptl4 |
同义词 | arp4 | fiaf | harp | hfarp | nl2 | pgar | tgqtl | unq171 | pp1158 |
描述 | angiopoietin like 4 |
参考 | MIM:605910|HGNC:HGNC:16039|ENSEMBL:ENSG00000167772|HPRD:16173|Vega:Otthumg00000182273 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19p13.3 |
Pascal P值 | 0.507 |
Sherlock P值 | 0.794 |
胎儿β | -2.422 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
Gene in Data Sources
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | Hits with neuro-related keywords: 1 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16999761 | CHR4 | 107454800 | Angptl4 | 51129 | 0.01 | 反式 | ||
RS10743139 | Chr11 | 10425326 | Angptl4 | 51129 | 6.822e-5 | 反式 | ||
RS7119964 | Chr11 | 10425509 | Angptl4 | 51129 | 0.11 | 反式 | ||
RS17076272 | CHR13 | 22726361 | Angptl4 | 51129 | 0.04 | 反式 | ||
RS17076274 | CHR13 | 22726381 | Angptl4 | 51129 | 0.04 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ANGPTL4_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005102 | 受体结合 | IEA | 神经递质(GO期限:4) | - |
去:0004857 | 酶抑制剂活性 | ISS | - | |
Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0001666 | 应对缺氧 | nas | 12707035 | |
去:0007165 | 信号转导 | IEA | - | |
去:0007275 | 多细胞生物发育 | IEA | - | |
GO:0043066 | 凋亡的负调节 | 艾达 | 10698685 | |
去:0030154 | 细胞分化 | IEA | - | |
GO:0051005 | 脂蛋白脂肪酶活性的阴性调节 | ISS | - | |
GO:0045766 | 血管生成的阳性调控 | 塔斯 | 11953136 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005576 | 细胞外区域 | 艾达 | 10698685 | |
去:0005578 | proteinaceous extracellular matrix | IEA | - | |
去:0005615 | 细胞外空间 | IEA | - | |
去:0005634 | 核 | 艾达 | 18029348 | |
去:0005730 | 核仁 | 艾达 | 18029348 | |
去:0005737 | cytoplasm | 艾达 | 18029348 |
Section V. Pathway annotation
第六节。microRNA注释
microrna的全家ly | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
miR-133 | 285 | 291 | M8 | HSA-MIR-133A | uugguccccuucaaccagcugu |
HSA-MIR-133B | uguguccccuucaaccagcua |