基因页面:CHCHD2
总结吗?
| GeneID | 51142年 |
| 象征 | CHCHD2 |
| 同义词 | C7orf17 | MNRR1 | NS2TP | PARK22 |
| 描述 | coiled-coil-helix-coiled-coil-helix域包含2 |
| 参考 | MIM: 616244|HGNC: HGNC: 21645|运用:ENSG00000106153|HPRD: 09879|织女:OTTHUMG00000129429 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 7 p11.2 |
| 帕斯卡假定值 | 0.004 |
| 夏洛克假定值 | 0.238 |
| eGene | 前扣带皮层BA24 尾状基底神经节 小脑 皮质 额叶皮质BA9 元 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs112806668 | 7 | 56084589 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 3.964 e - | 0 | 89680年 | gtex_brain_ba24 |
| rs117690775 | 7 | 56085536 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 3.468 e - | 0 | 88733年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73140778 | 7 | 56089033 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 2.218 e - | 0 | 85236年 | gtex_brain_ba24 |
| rs113265498 | 7 | 56093988 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 2.168 e - | 0 | 80281年 | gtex_brain_ba24 |
| rs59193297 | 7 | 56096213 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 2.391 e - | 0 | 78056年 | gtex_brain_ba24 |
| rs6955615 | 7 | 56098796 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 4.842 e - | 0 | 75473年 | gtex_brain_ba24 |
| rs6954669 | 7 | 56098906 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 3.064 e - | 0 | 75363年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7791221 | 7 | 56104688 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 1.915 e - | 0 | 69581年 | gtex_brain_ba24 |
| rs111791854 | 7 | 56106146 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 2.221 e - | 0 | 68123年 | gtex_brain_ba24 |
| rs112126471 | 7 | 56106472 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 1.913 e - | 0 | 67797年 | gtex_brain_ba24 |
| rs59852874 | 7 | 56115321 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 1.907 e - | 0 | 58948年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7779821 | 7 | 56119944 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 1.947 e - | 0 | 54325年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7806994 | 7 | 56139505 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 3.867 e - | 0 | 34764年 | gtex_brain_ba24 |
| rs58571234 | 7 | 56145592 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 2.218 e - | 0 | 28677年 | gtex_brain_ba24 |
| rs17172508 | 7 | 56149847 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 1.111 e - | 0 | 24422年 | gtex_brain_ba24 |
| rs67818657 | 7 | 56150289 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 1.057 e - | 0 | 23980年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2242508 | 7 | 56151489 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 5.493 e - | 0 | 22780年 | gtex_brain_ba24 |
| rs112501056 | 7 | 56155759 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 7.513 e-8 | 0 | 18510年 | gtex_brain_ba24 |
| rs3966180 | 7 | 56161121 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 7.608 e-8 | 0 | 13148年 | gtex_brain_ba24 |
| rs6593298 | 7 | 56171760 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 6.298 e-8 | 0 | 2509年 | gtex_brain_ba24 |
| rs4948107 | 7 | 56173407 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 6.412 e-8 | 0 | 862年 | gtex_brain_ba24 |
| rs4948108 | 7 | 56173628 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 6.307 e-8 | 0 | 641年 | gtex_brain_ba24 |
| rs77036114 | 7 | 56174351 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 6.317 e-8 | 0 | -82年 | gtex_brain_ba24 |
| rs146847249 | 7 | 56174353 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 6.317 e-8 | 0 | -84年 | gtex_brain_ba24 |
| rs139238064 | 7 | 56174551 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 6.327 e-8 | 0 | -282年 | gtex_brain_ba24 |
| rs58230982 | 7 | 56179661 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 4.289 e - | 0 | -5392年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2016580 | 7 | 56184642 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 4.272 e - | 0 | -10373年 | gtex_brain_ba24 |
| rs111872279 | 7 | 56188381 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 6.298 e-8 | 0 | -14112年 | gtex_brain_ba24 |
| rs2192262 | 7 | 56191346 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 8.881 e - | 0 | -17077年 | gtex_brain_ba24 |
| rs10499761 | 7 | 56193643 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 6.298 e-8 | 0 | -19374年 | gtex_brain_ba24 |
| rs114026903 | 7 | 56193749 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 6.298 e-8 | 0 | -19480年 | gtex_brain_ba24 |
| rs68051560 | 7 | 56208694 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 6.298 e-8 | 0 | -34425年 | gtex_brain_ba24 |
| rs816229 | 7 | 56213300 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 1.29 e-6 | 0 | -39031年 | gtex_brain_ba24 |
| rs113753484 | 7 | 56215989 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 6.298 e-8 | 0 | -41720年 | gtex_brain_ba24 |
| rs147656751 | 7 | 56216973 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 6.298 e-8 | 0 | -42704年 | gtex_brain_ba24 |
| rs112297703 | 7 | 56217002 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 6.298 e-8 | 0 | -42733年 | gtex_brain_ba24 |
| rs138912485 | 7 | 56217098 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 6.298 e-8 | 0 | -42829年 | gtex_brain_ba24 |
| rs137859570 | 7 | 56217797 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 2.905 e - | 0 | -43528年 | gtex_brain_ba24 |
| rs192877109 | 7 | 56217893 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 1.022 e - | 0 | -43624年 | gtex_brain_ba24 |
| rs184466809 | 7 | 56218210 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 9.394 e - | 0 | -43941年 | gtex_brain_ba24 |
| rs142506035 | 7 | 56220257 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 7.267 e-8 | 0 | -45988年 | gtex_brain_ba24 |
| rs112163901 | 7 | 56220770 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 6.301 e-8 | 0 | -46501年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73132316 | 7 | 56221684 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 6.299 e-8 | 0 | -47415年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73132319 | 7 | 56222546 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 6.299 e-8 | 0 | -48277年 | gtex_brain_ba24 |
| rs4947538 | 7 | 56226044 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 6.298 e-8 | 0 | -51775年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73132333 | 7 | 56226489 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 6.085 e-8 | 0 | -52220年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73132395 | 7 | 56229873 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 6.298 e-8 | 0 | -55604年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73132398 | 7 | 56230383 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 6.298 e-8 | 0 | -56114年 | gtex_brain_ba24 |
| rs118063245 | 7 | 56235731 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 6.323 e-8 | 0 | -61462年 | gtex_brain_ba24 |
| rs114806057 | 7 | 56235789 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 6.298 e-8 | 0 | -61520年 | gtex_brain_ba24 |
| rs111211497 | 7 | 56235887 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 6.308 e-8 | 0 | -61618年 | gtex_brain_ba24 |
| rs111314085 | 7 | 56236001 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 5.65 e - | 0 | -61732年 | gtex_brain_ba24 |
| rs140328268 | 7 | 56240882 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 6.298 e-8 | 0 | -66613年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73135709 | 7 | 56243878 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 6.298 e-8 | 0 | -69609年 | gtex_brain_ba24 |
| rs111814423 | 7 | 56248053 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 6.409 e-8 | 0 | -73784年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7808466 | 7 | 56248655 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 6.461 e-8 | 0 | -74386年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7781376 | 7 | 56252234 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 6.988 e-8 | 0 | -77965年 | gtex_brain_ba24 |
| rs113789714 | 7 | 56265372 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 9.516 e-8 | 0 | -91103年 | gtex_brain_ba24 |
| rs112907150 | 7 | 56268881 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 9.516 e-8 | 0 | -94612年 | gtex_brain_ba24 |
| rs144420256 | 7 | 56269079 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 9.516 e-8 | 0 | -94810年 | gtex_brain_ba24 |
| rs1524437 | 7 | 56272698 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 9.516 e-8 | 0 | -98429年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73135752 | 7 | 56273553 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 9.516 e-8 | 0 | -99284年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73135754 | 7 | 56274522 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 9.516 e-8 | 0 | -100253年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73135756 | 7 | 56274715 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 9.062 e-8 | 0 | -100446年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73135759 | 7 | 56276677 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 9.525 e-8 | 0 | -102408年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73136191 | 7 | 56279490 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 9.519 e-8 | 0 | -105221年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73136193 | 7 | 56279509 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 9.513 e-8 | 0 | -105240年 | gtex_brain_ba24 |
| rs66694283 | 7 | 56279941 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 1.671 e - | 0 | -105672年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73136195 | 7 | 56280610 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 9.516 e-8 | 0 | -106341年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73136197 | 7 | 56280938 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 9.516 e-8 | 0 | -106669年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73138107 | 7 | 56283341 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 9.516 e-8 | 0 | -109072年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73138108 | 7 | 56283764 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 9.516 e-8 | 0 | -109495年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73138110 | 7 | 56284017 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 9.516 e-8 | 0 | -109748年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73138118 | 7 | 56287182 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 9.516 e-8 | 0 | -112913年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73138122 | 7 | 56287623 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 9.516 e-8 | 0 | -113354年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73138130 | 7 | 56290230 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 9.516 e-8 | 0 | -115961年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73138131 | 7 | 56290498 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 9.516 e-8 | 0 | -116229年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73138133 | 7 | 56290892 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 9.516 e-8 | 0 | -116623年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73138135 | 7 | 56291862 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 9.516 e-8 | 0 | -117593年 | gtex_brain_ba24 |
| rs1829963 | 7 | 56295304 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 9.516 e-8 | 0 | -121035年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73140199 | 7 | 56298323 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 9.516 e-8 | 0 | -124054年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73142116 | 7 | 56301138 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 9.527 e-8 | 0 | -126869年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73142177 | 7 | 56302425 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 9.547 e-8 | 0 | -128156年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73142188 | 7 | 56304003 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 1.433 e-6 | 0 | -129734年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73142194 | 7 | 56308710 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 1.292 e - | 0 | -134441年 | gtex_brain_ba24 |
| rs7778744 | 7 | 56309895 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 1.216 e - | 0 | -135626年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73142200 | 7 | 56310523 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 1.226 e - | 0 | -136254年 | gtex_brain_ba24 |
| rs73144003 | 7 | 56311752 | CHCHD2 | ENSG00000106153.12 | 1.24 e - | 0 | -137483年 | gtex_brain_ba24 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 阿尔茨海默病DN布莱洛克的 | 1237年 | 837年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 徐gh自分泌的目标 | 268年 | 157年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GAVIN集群T7 FOXP3目标 | 98年 | 63年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 结肠癌年级了 | 871年 | 505年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 年级结肠癌和直肠癌 | 285年 | 167年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿隆索转移了 | 198年 | 128年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 罗马胰岛素在肌肉的目标 | 442年 | 263年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 蒋介石肝癌子类未经DN | 193年 | 112年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 开罗肝母细胞癌类了 | 605年 | 377年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马顿斯维甲酸反应DN | 841年 | 431年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 菲格罗亚AML甲基化集群1 | 125年 | 61年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 菲格罗亚AML甲基化集群3 | 170年 | 97年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 菲格罗亚AML甲基化集群4 | 112年 | 64年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |