基因页:aadat
概括?
基因 | 51166 |
象征 | aadat |
同义词 | kat2 | katii |
描述 | 氨基磷酸氨基转移酶 |
参考 | MIM:611754|HGNC:HGNC:17929|ENSEMBL:ENSG00000109576|HPRD:12392|Vega:Otthumg00000160912 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 4Q33 |
Pascal P值 | 0.044 |
Sherlock P值 | 0.096 |
胎儿β | 1.11 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 尾状基底神经节 小脑 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中:3 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG24120085 | 4 | 171012535 | aadat | 3.113E-4 | 0.246 | 0.04 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/AADAT_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
GO:0016212 | Kynurenine- oxogoglutarate转氨酶活性 | 经验 | 谷氨酸(GO期限:6) | 12126930 |
GO:0016212 | Kynurenine- oxogoglutarate转氨酶活性 | IEA | 谷氨酸(GO期限:6) | - |
GO:0047536 | 2-氨基磷酸二磷酸转氨酶活性 | IEA | 谷氨酸(GO期限:6) | - |
去:0030170 | 吡啶还毒素结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0009058 | 生物合成过程 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005829 | 细胞质 | 经验 | 12126930 | |
去:0005739 | 线粒体 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg赖氨酸降解 | 44 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg色氨酸代谢 | 40 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
氨基酸和衍生物的反应组代谢 | 200 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应色氨酸分解代谢 | 11 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang Barretts食道和食道癌 | 26 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 | 261 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Labbe TGFB1靶向 | 102 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 | 445 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ohguchi肝HNF4A靶向DN | 149 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |