概括
基因 51166
象征 aadat
同义词 kat2 | katii
描述 氨基磷酸氨基转移酶
参考 MIM:611754|HGNC:HGNC:17929|ENSEMBL:ENSG00000109576|HPRD:12392|Vega:Otthumg00000160912
基因类型 蛋白质编码
地图位置 4Q33
Pascal P值 0.044
Sherlock P值 0.096
胎儿β 1.11
DMG 1(#研究)
主持人 尾状基底神经节
小脑

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:3

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG24120085 4 171012535 aadat 3.113E-4 0.246 0.04 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0016212 Kynurenine- oxogoglutarate转氨酶活性 经验 谷氨酸(GO期限:6) 12126930
GO:0016212 Kynurenine- oxogoglutarate转氨酶活性 IEA 谷氨酸(GO期限:6) -
GO:0047536 2-氨基磷酸二磷酸转氨酶活性 IEA 谷氨酸(GO期限:6) -
去:0030170 吡啶还毒素结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0009058 生物合成过程 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005829 细胞质 经验 12126930
去:0005739 线粒体 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg赖氨酸降解 44 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg色氨酸代谢 40 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
氨基酸和衍生物的反应组代谢 200 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应色氨酸分解代谢 11 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Barretts食道和食道癌 26 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 261 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Labbe TGFB1靶向 102 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 718 401 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 445 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ohguchi肝HNF4A靶向DN 149 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因