基因页面:LEF1
总结吗?
| GeneID | 51176年 |
| 象征 | LEF1 |
| 同义词 | LEF-1 | TCF10 | TCF1ALPHA | TCF7L3 |
| 描述 | 淋巴增强器结合因子1 |
| 参考 | MIM: 153245|HGNC: HGNC: 6551|运用:ENSG00000138795|HPRD: 01075|织女:OTTHUMG00000131809 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 4 q25 |
| 帕斯卡假定值 | 0.166 |
| 胎儿β | -0.823 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂症患者,神经 | 点击显示详细信息 |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg19737633 | 4 | 109087912 | LOC641518; LEF1 | 1.177的军医 | -0.381 | 0.029 | DMG: Wockner_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0003677 | DNA结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0003682 | 染色质绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0003705 | RNA聚合酶II转录因子的活动,增强器绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 9751710|12192039 | |
| 去:0008301 | DNA弯曲活动 | 国际空间站 | - - - - - - | |
| 去:0016563 | 转录激活活性 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0043565 | sequence-specific DNA结合 | 艾达 | 9308964 | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0021542 | 齿状回发展 | 国际能源机构 | 神经元(术语层面:12) | - - - - - - |
| 去:0000122 | 负调控RNA聚合酶II启动子的转录 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0001756 | somitogenesis | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0001890 | 胎盘发展 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006355 | 依赖dna的转录调节 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006350 | 转录 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016055 | Wnt受体信号通路 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0048468 | 细胞的发展 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0030111 | 监管Wnt受体信号通路 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0042475 | 牙发生dentine-containing牙齿 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0030879 | 乳腺发育 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0030326 | 胚胎肢体形态发生 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0048341 | 近轴中胚层的形成 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0045944 | 积极的监管RNA聚合酶II启动子的转录 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0045843 | 横纹肌发展的负调控 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005634 | 核 | 集成电路 | 9308964 | |
| 去:0005634 | 核 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005667 | 转录因子复杂 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005730 | 核仁 | 艾达 | 18029348 | |
| 去:0005737 | 细胞质 | 艾达 | 18029348 | |
| 去:0005737 | 细胞质 | 国际能源机构 | - - - - - - |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
| 扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| ALX4 | FPP | KIAA1788 |烤瓷| PFM1 | PFM2 | ALX同源框4 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11696550 |
| CTNNB1 | CTNNB | DKFZp686D02253 | FLJ25606 | FLJ37923 | β连环蛋白(cadherin-associated蛋白质),88 kda | - - - - - - | HPRD | 8757136|12556497 |
| CTNNB1 | CTNNB | DKFZp686D02253 | FLJ25606 | FLJ37923 | β连环蛋白(cadherin-associated蛋白质),88 kda | 亲和力Capture-Western 2台混合动力 |
BioGRID | 8757136|12748295 |15684397 |
| CTNNB1 | CTNNB | DKFZp686D02253 | FLJ25606 | FLJ37923 | β连环蛋白(cadherin-associated蛋白质),88 kda | LEF-1与β-连环蛋白相互作用。这种交互建模在展示人类LEF-1和鼠标β-连环蛋白之间的相互作用。 | 绑定 | 15525529 |
| EP300 | KAT3B | p300 | E1A结合蛋白p300 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12446687 |
| KPNA1 | IPOA5 | NPI-1 | RCH2 | SRP1 | karyopherinα1 (importinα5) | - - - - - - | HPRD | 8631802 |
| KPNA2 | IPOA1 | QIP2 | RCH1 | SRP1alpha | karyopherinα2(抹布队列1,importinα1) | - - - - - - | HPRD | 8631802 |
| MITF | MI | WS2A | bHLHe32 | microphthalmia-associated转录因子 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12032083 |
| NLK | DKFZp761G1211 | FLJ21033 | nemo-like激酶 | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 12556497 |
| NLK | DKFZp761G1211 | FLJ21033 | nemo-like激酶 | - - - - - - | HPRD | 12901858 |
| NOTCH1 | TAN1 | hN1 | 切口同族体1,translocation-associated(果蝇) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11604490 |
| PIAS4 | FLJ12419 | MGC35296 | PIASY | Piasg | ZMIZ6 | 蛋白质抑制剂激活统计4 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11731474 |
| RUNX1 | AML1 | AML1-EVI-1 | AMLCR1 | CBFA2 | EVI-1 | PEBP2aB | runt-related转录因子1 | 重新组成复杂 | BioGRID | 12551949 |
| RUNX2 | CCD AML3 | CBFA1 | | CCD1 | MGC120022 | MGC120023 | OSF2 | PEA2aA | PEBP2A1 | PEBP2A2 | PEBP2aA | PEBP2aA1 | runt-related转录因子2 | 重新组成复杂 | BioGRID | 12551949 |
| RUVBL1 | ECP54 | INO80H | NMP238 |庞丁| Pontin52 | RVB1 | TIH1 | TIP49 | TIP49A | RuvB-like 1(大肠杆菌) | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 9843967 |
| SMAD1 | BSP1 | JV4-1 | JV41 | MADH1 | MADR1 | SMAD家庭成员1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10890911 |
| SMAD2 | JV18 | JV18-1 | MADH2 | MADR2 | MGC22139 | MGC34440 | hMAD-2 | hSMAD2 | SMAD家庭成员2 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10890911 |
| SMAD3 | DKFZp586N0721 | DKFZp686J10186 | HSPC193 | HsT17436 | JV15-2 | MADH3 | MGC60396 | SMAD家庭成员3 | Lef1与Smad3交互。这种交互建模在鼠标Lef1之间的交互和Smad3从一个未指明的物种。 | 绑定 | 15750622 |
| SMAD3 | DKFZp586N0721 | DKFZp686J10186 | HSPC193 | HsT17436 | JV15-2 | MADH3 | MGC60396 | SMAD家庭成员3 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10890911 |
| SMAD4 | DPC4似|吉格| MADH4 | SMAD家庭成员4 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10890911 |
| SMAD7 | CRCS3 | FLJ16482 | MADH7 | MADH8 | SMAD家庭成员7 | 亲和力Capture-Western | BioGRID | 15684397 |
| THOC4 | 阿里|性能试验 | THO复杂4 | 重新组成复杂 | BioGRID | 9119228 |
| TLE1 | 环境、社会和治理| ESG1 | GRG1 | transducin-like增强剂的分裂1 (E (sp1)同族体,果蝇) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 9751710 |
| TLE1 | 环境、社会和治理| ESG1 | GRG1 | transducin-like增强剂的分裂1 (E (sp1)同族体,果蝇) | LEF-1与TLE1交互。之间的交互是仿照了交互从一个未指明的物种和人类TLE1 LEF-1。 | 绑定 | 9751710 |
| TRA@ | FLJ22602 | MGC117436 | MGC22624 | MGC23964 | MGC71411 | TCRA | TCRD |交易 | T细胞受体α轨迹 | - - - - - - | HPRD | 1827423|9119227 | 9119227 |
| UBTF | 和- 90 | UBF | 上游转录因子结合,RNA聚合酶I | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12748295 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG WNT信号通路 | 151年 | 112年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG ADHERENS结 | 75年 | 53 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG杀菌作用 | 102年 | 80年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG通路在癌症 | 328年 | 259年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG结肠直肠癌 | 62年 | 47 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG子宫内膜癌 | 52 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG前列腺癌 | 89年 | 75年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG甲状腺癌 | 29日 | 26 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG基底细胞癌 | 55 | 44 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG急性髓系白血病 | 60 | 47 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KEGG ARRHYTHMOGENIC右心室心肌病ARVC | 76年 | 59 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GSK3 BIOCARTA通路 | 27 | 26 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BIOCARTA PITX2通路 | 15 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BIOCARTA WNT通路 | 26 | 24 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| WNT信号 | 89年 | 71年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PID CMYB通路 | 84年 | 61年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PIDβ连环蛋白NUC途径 | 80年 | 60 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过CD40 HOLLMANN细胞凋亡 | 201年 | 125年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 刘SOX4目标了 | 137年 | 94年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 罗德里格斯NTN1目标了 | 17 | 11 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 奥斯瓦尔德造血干细胞在胶原凝胶 | 233年 | 161年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 无角的伯基特淋巴瘤了 | 43 | 27 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 周炎症反应费马 | 544年 | 308年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 周炎症反应有限合伙人 | 431年 | 237年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金赛的目标EWSR1 FLII融合起来 | 1278年 | 748年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金正日WT1目标了 | 214年 | 155年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| JAATINEN造血干细胞DN | 226年 | 132年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KOKKINAKIS蛋氨酸剥夺48小时DN | 64年 | 39 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KOKKINAKIS蛋氨酸不足96小时DN | 75年 | 50 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 林格伦膀胱癌集群2 b | 392年 | 251年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN SCHLOSSER血清反应 | 712年 | 443年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SPIELMAN淋巴母细胞欧洲和亚洲2 fc DN | 21 | 13 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SPIELMAN淋巴母细胞欧洲和亚洲的DN | 584年 | 395年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PUJANA BRCA2 PCC网络 | 423年 | 265年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布伊泰尔特说光动力治疗压力DN | 637年 | 377年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 里克曼肿瘤分化好VS适度 | 109年 | 69年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SCHAEFFER前列腺癌发展6小时DN | 514年 | 330年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 小山SEMA3B目标了 | 292年 | 168年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH SUZ12目标 | 1038年 | 678年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH ES与H3K27ME3 | 1118年 | 744年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MORI PRE BI淋巴细胞 | 80年 | 54 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL反式 | 882年 | 572年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 公园HSC标记 | 44 | 31日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 哈达德B淋巴细胞祖 | 293年 | 193年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 哈达德T淋巴细胞及NK祖DN | 63年 | 41 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KUMAR MLL AF9融合的目标 | 405年 | 264年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿尔茨海默病早期布莱洛克的了 | 390年 | 242年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 胡锦涛GENOTOXIN行动直接和间接24小时 | 55 | 38 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿尔茨海默病了布莱洛克的 | 1691年 | 1088年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染血巨细胞病毒14人力资源 | 156年 | 101年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 郑受FOXP3 | 491年 | 310年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 郑FOXP3目标T淋巴细胞DN | 37 | 29日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 桑塞姆需要MYC WNT通路 | 58 | 43 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 近藤前列腺癌HCP H3K27ME3 | 97年 | 72年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 里奇尤因肉瘤祖 | 430年 | 288年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN NADELLA PRKAR1A目标 | 8 | 8 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 萧述三乳腺癌等正常 | 476年 | 285年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MCGARVEY甲基化沉默的结肠癌 | 42 | 29日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 顾PDEF目标了 | 71年 | 49 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RUIZ过渡委员会的目标了 | 153年 | 107年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李区分T淋巴细胞 | 200年 | 115年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 汉SATB1目标了 | 395年 | 249年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迈斯纳大脑HCP H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069年 | 729年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BOYAULT肝癌子类G6 | 65年 | 43 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 开罗肝胚细胞瘤了 | 207年 | 143年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 古铁雷斯慢性淋巴细胞白血病DN | 56 | 39 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PCA2 NAKAYAMA软组织肿瘤 | 87年 | 50 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KASLER HDAC7目标1 | 194年 | 133年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ZWANG仅由二EGF脉冲瞬变 | 1725年 | 838年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-26 | 978年 | 984年 | 1 | hsa-miR-26a大脑 | UUCAAGUAAUCCAGGAUAGGC |
| hsa-miR-26b深圳 | UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU | ||||
| miR-34/449 | 190年 | 197年 | 1、m8 | hsa-miR-34a大脑 | UGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUU |
| hsa-miR-34c | AGGCAGUGUAGUUAGCUGAUUGC | ||||
| hsa - mir - 449 | UGGCAGUGUAUUGUUAGCUGGU | ||||
| hsa - mir - 449 b | AGGCAGUGUAUUGUUAGCUGGC | ||||
| mir - 363 | 31日 | 38 | 1、m8 | hsa - mir - 363 | AUUGCACGGUAUCCAUCUGUAA |
| mir - 381 | 612年 | 619年 | 1、m8 | hsa - mir - 381 | UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU |
| mir - 505 | 81年 | 87年 | 1 | hsa - mir - 505 | GUCAACACUUGCUGGUUUCCUC |
| 米尔- 93. - hd / 291 - 3 - p / 294/295/302/372/373/520 | 975年 | 981年 | m8 | hsa - mir - 93大脑 | AAAGUGCUGUUCGUGCAGGUAG |
| hsa - mir - 302 a | UAAGUGCUUCCAUGUUUUGGUGA | ||||
| hsa - mir - 302 b | UAAGUGCUUCCAUGUUUUAGUAG | ||||
| hsa - mir - 302 c | UAAGUGCUUCCAUGUUUCAGUGG | ||||
| hsa - mir - 302 d | UAAGUGCUUCCAUGUUUGAGUGU | ||||
| hsa - mir - 372 | AAAGUGCUGCGACAUUUGAGCGU | ||||
| hsa - mir - 373 | GAAGUGCUUCGAUUUUGGGGUGU | ||||
| hsa - mir - 520 e | AAAGUGCUUCCUUUUUGAGGG | ||||
| hsa - mir - 520 a | AAAGUGCUUCCCUUUGGACUGU | ||||
| hsa - mir - 520 b | AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGG | ||||
| hsa - mir - 520 c | AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGGUU | ||||
| hsa - mir - 520 d | AAAGUGCUUCUCUUUGGUGGGUU | ||||