基因页:CHMP1A
概括?
基因 | 5119 |
象征 | CHMP1A |
同义词 | CHMP1 | PCH8 | PCOLN3 | PRSM1 | VPS46-1 | VPS46A |
描述 | 带电的多重体蛋白1a |
参考 | MIM:164010|HGNC:HGNC:8740|ENSEMBL:ENSG00000131165|HPRD:01237|Vega:Otthumg00000169521 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 16Q24.3 |
Pascal P值 | 6.201E-5 |
Sherlock P值 | 0.913 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CHMP1A_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
TMC7 | 0.92 | 0.85 |
plekhh1 | 0.92 | 0.87 |
Shroom4 | 0.91 | 0.86 |
AC022100.1 | 0.91 | 0.86 |
DOCK5 | 0.91 | 0.80 |
KIF13B | 0.91 | 0.80 |
Gldn | 0.90 | 0.82 |
ERBB3 | 0.90 | 0.83 |
C10orf90 | 0.90 | 0.79 |
PLD1 | 0.90 | 0.80 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
RPL35 | -0.55 | -0.75 |
RPL36 | -0.54 | -0.75 |
RPL27 | -0.53 | -0.74 |
SCNM1 | -0.53 | -0.63 |
RPL12 | -0.53 | -0.70 |
RPL8 | -0.52 | -0.69 |
RPL18 | -0.52 | -0.74 |
RPS18 | -0.52 | -0.71 |
RPSA | -0.52 | -0.65 |
fau | -0.52 | -0.71 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Wamunyokoli卵巢癌LMP | 265 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
哈马凋亡通过小径dn | 186 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gruetzmann胰腺癌 | 358 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 | 479 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌16q24 Amplicon | 53 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
史密斯·泰特(Smith Tert)目标DN | 87 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kayo衰老的肌肉 | 244 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sesto对UV C0的反应 | 107 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gratias视网膜细胞瘤16Q24 | 17 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 | 549 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delacroix Rarg Bound MEF | 367 | 231 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |